| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 844,558 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 844,558 | 0 | A | T | 99.7% | 817.1 / NA | 345 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (178/165); minor base C (1/0); total (179/166) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 844,559 | 0 | G | C | 99.7% | 814.6 / ‑4.6 | 345 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (178/165); minor base T (1/0); total (179/166) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.44e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 844,560 | 0 | C | G | 100.0% | 823.5 / NA | 345 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (179/166); total (179/166) | |||||||||||
Only 100 of 345 total aligned reads displayed.
CGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCAGCGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAAAGCTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAACGACGTACCGGCGTTGCGCGAAATATTGCAACGCACAGGCATGTTGGACGGGGGGCCGAAAATTACTCTACCTGGCGATGACACGCCAACTGACGCG > CP042583/844290‑844839 ||| tgacgcattatGCAAACCATGTGGGAAAACCTTGAGGCTGTTAAGGCTTTCAAGCAACGGCTGGCGGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTAGCCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGc < 2:1286586/281‑1 (MQ=255) cACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCa > 1:211785/1‑286 (MQ=255) cACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCCGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTaa < 2:2253871/277‑1 (MQ=255) cACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCCGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTaa > 1:2253871/1‑277 (MQ=255) tatGCAAGCCATGGGGAAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTACCAGCAACAGCGGGCAGCGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCACAGTGTAATAAAAGGGTAGAGTTAATGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCt < 2:401592/288‑1 (MQ=255) cccATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAg > 1:2673116/1‑289 (MQ=255) aTGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTc < 1:349859/289‑1 (MQ=255) aTGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTc > 1:2845707/1‑289 (MQ=255) aaaaCCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTg > 1:679207/1‑287 (MQ=255) gTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAg > 1:582611/1‑289 (MQ=255) ttCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCa > 2:2984063/1‑288 (MQ=255) ttCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATCAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAAGTACCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCa > 2:1123657/1‑288 (MQ=255) aCAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCgcagca > 1:2315542/1‑288 (MQ=255) cAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGaatcgttac < 2:3058278/289‑8 (MQ=255) cAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATg > 2:2376583/1‑191 (MQ=255) ataaATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCtg < 1:747394/289‑1 (MQ=255) aTGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGaatcgttac < 2:71109/272‑8 (MQ=255) gggTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCCGCATCCGCAATATGCGGCGAGGCATGAATCGTTACTGGCCTTCCTCTGTGcca > 2:1182312/1‑288 (MQ=255) tAGGGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCa < 2:2846737/288‑1 (MQ=255) ataagtggcagATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGTCGTGGTGCTCTCTGAGGCGATGATGGGCGATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCGAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCATGACTGGCACCGTAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAAcc < 1:3128110/278‑1 (MQ=255) tACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGt < 1:2984063/288‑1 (MQ=255) aCTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCaaa > 1:1977231/1‑283 (MQ=255) cTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGc > 2:181674/1‑209 (MQ=255) cTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCgca < 1:2890438/224‑1 (MQ=255) cTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTAGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATa < 1:1855891/184‑1 (MQ=255) cGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGAc < 2:1070646/209‑1 (MQ=255) aTCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCgcagca > 2:2240328/1‑220 (MQ=255) aTCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCgcagca < 1:2240328/220‑1 (MQ=255) aTCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGaatcgttac > 2:2896121/1‑245 (MQ=255) aTCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCa > 1:2421907/1‑286 (MQ=255) aTCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAAc > 2:2642124/1‑288 (MQ=255) tCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGcc < 1:2383804/256‑1 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATTTAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCCATATGCGGCGATGCATGCATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAg > 1:2895773/1‑289 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGgcg < 2:2282945/159‑1 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGa > 2:857126/1‑226 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGaatcgttac < 2:652521/241‑8 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGaatcgtta < 1:2603995/240‑7 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAAcc > 1:492264/1‑266 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCaaa > 1:2951816/1‑288 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCaaa > 1:1280171/1‑288 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCaaa > 1:1815552/1‑288 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAAGCGTTCATGGCCTTACTCTGGGAACACAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAg > 2:329889/1‑289 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCCGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACCCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTTACCCGTaaac > 2:3140049/1‑288 (MQ=255) aaCGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCCCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAACGTCAATTGCCTACGTTTGTTCCAGTACTGGCACCGCAGCACCCCAAATATTCGGCGACGCATGAAGCGTTACTTCACCTCCCCTGTTACACCCAACCCTCGCACCCACAGAccacccaa > 2:2438268/1‑282 (MQ=255) tGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGtt < 2:172958/289‑1 (MQ=255) ggCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCgc < 2:1416533/197‑1 (MQ=255) ggCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCgc > 1:1416533/1‑197 (MQ=255) cgcgACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACATTTGTTGCAGGACTGGCACCGAAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGcc < 2:1945958/289‑1 (MQ=255) gtggtggtgTCTGGTGGGATGGTGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATAGTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGATATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGACGCCGCTCTCGGTGATTAACGAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAggg < 2:1923830/288‑1 (MQ=255) ggtgCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAg < 1:1732173/289‑1 (MQ=255) gtgCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGgcg < 2:1588443/138‑1 (MQ=255) gtgCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATgcggc > 1:618902/1‑203 (MQ=255) gCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAAcc > 1:1129404/1‑243 (MQ=255) tctGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTa > 2:1762519/1‑222 (MQ=255) tctGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTa < 1:1762519/222‑1 (MQ=255) tctGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCtg < 2:2619318/227‑1 (MQ=255) tctGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTa > 1:1229248/1‑289 (MQ=255) tctGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACT‑GCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTa > 2:1504159/1‑288 (MQ=255) tGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGTAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGACTCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCCGGGCAGTGGAGTacagac > 2:2140052/1‑284 (MQ=255) tGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGaatcgttac < 1:2676609/209‑8 (MQ=255) tGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGaatcgttac > 2:2676609/1‑202 (MQ=255) tGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGaat < 2:2739194/203‑2 (MQ=255) tGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGaat > 1:2739194/1‑202 (MQ=255) tGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCa < 2:543633/230‑1 (MQ=255) tGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAg < 1:1156444/277‑1 (MQ=255) tGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAacgac > 1:2805253/1‑289 (MQ=255) tGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAacga < 1:329889/288‑1 (MQ=255) tgatgGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAacga > 2:881205/1‑283 (MQ=255) tgatgGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAacga < 1:881205/283‑1 (MQ=255) tgatgGGCTATCTCCATTTCATTACAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAacga > 2:2316088/1‑283 (MQ=255) atgGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCa > 2:2470417/1‑176 (MQ=255) atgGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATgcggcg < 1:1571887/186‑1 (MQ=255) gggCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAAcc > 1:1033403/1‑225 (MQ=255) tATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACT‑GCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAACGACGTACCGGCGTTgcg < 1:1504159/289‑1 (MQ=255) tctcCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAg > 1:2325892/1‑262 (MQ=255) ctcCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAACGACGTACCGGCGTTGcgcg < 1:832113/289‑1 (MQ=255) tcCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCATTTGCCTACGATTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTTACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAg < 1:1676539/260‑1 (MQ=255) tcCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCgg > 2:592073/1‑235 (MQ=255) tGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTgg > 2:1250681/1‑98 (MQ=255) tGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCt < 1:1096190/188‑1 (MQ=255) tGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAacga < 1:1344372/261‑1 (MQ=255) cAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTttgtt > 1:1644836/1‑128 (MQ=255) ggTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAACGACGTACCGGCGTTGCGCGAAATATTGCAACGCACAGGCATg < 1:977571/289‑1 (MQ=255) aaGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAACGACGTACCGGCGTTGCGCGAAATATTGCa > 2:1671642/1‑271 (MQ=255) cTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATgcggc < 2:1150861/142‑1 (MQ=255) gCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAACGACGTACCGGCGTTGCGCGAAATATTGCAACGCACAGGCATGTTGGACGGGGGGcc < 2:958020/289‑1 (MQ=255) tAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCGGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAg > 2:2811647/1‑208 (MQ=255) tAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCaa > 2:2013520/1‑73 (MQ=255) tAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCaa < 1:2013520/73‑1 (MQ=255) tAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAAcc < 2:1349785/165‑1 (MQ=255) tAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGtt > 1:203073/1‑195 (MQ=255) tAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGcc > 2:2058103/1‑200 (MQ=255) tAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGcc < 1:2058103/200‑1 (MQ=255) tAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAACGACGTACCGGCGTTGCGCGAAATATTGCAACg < 1:3099631/249‑1 (MQ=255) tAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAACGACGTACCGGCGTTGCGCGAAATATTGCAACGCACAGGCATGTTGGACGGGGGGCCGAAAATTACTCTa > 2:778341/1‑286 (MQ=255) tATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCg < 1:953390/105‑1 (MQ=255) tATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGcc < 2:2021791/193‑1 (MQ=255) tATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAACGACGTACCGGCGTTGCGCGAAATATTGCAACGCACAGGCATGTTGGACGGGGGGCCGAAAATTACTCTACCTGGCGATg > 1:815859/1‑289 (MQ=255) aTGCACTTGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAACGACGTACCGGCGTTGCGCGAAATATTGCAACGCACAGGCATGTTGGACGGGGGGCCGAAAATTACTCTACCTGGCGATGa < 1:2485708/289‑1 (MQ=255) tGCAACGCCGCCGCTCTCGGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATT‑CCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAATCGTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCa > 2:1535548/1‑186 (MQ=255) ||| CGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTCGCTGGCTATATAGCAGTAAACCTTATGCACTTGCAACGCCGCCGCTCAGCGTGATTAACCAATGGCAGCTGGCGCTGGATAAAGGTCAATTGCCTACGTTTGTTGCAGGACTGGCACCGCAGCATCCGCAATATGCGGCGATGCATGAAAGCTTACTGGCCTTACTCTGTGACACCAAACCGTGGCCCCAACTGACCGGCAAAGCAACGTTGCGCCCAGGGCAGTGGAGTAACGACGTACCGGCGTTGCGCGAAATATTGCAACGCACAGGCATGTTGGACGGGGGGCCGAAAATTACTCTACCTGGCGATGACACGCCAACTGACGCG > CP042583/844290‑844839 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |