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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 894,367 | 0 | T | A | 100.0% | 800.5 / NA | 331 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (162/169); total (162/169) | |||||||||||
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
ATTACGTCACCCATTCCGGCAGACAGATAGGTGTTCAGAATAGGTCCGAGGATATAACCCAGAAAACCGGTAAAGGCGAATGCGGAGATAATCCCGGTCGGCTTATTCGCCGTTTTATAGGTCAGGAACATCAAACCATACATACCCACCAGCGTCAGAATCAGACCCGGAGATGGCAGCATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCGCTAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGACTTGTACGGTCATGACTAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTATGACAGATGTAATTAATTAAGCAGCATAATGATAATGCGTAAGGGCACCCAGAAGTTTTACCCATCTTTACGCATTTGATCTGGAACAGGTTTAACAGCGGATTATCAGGTCATTAAGCAAATATAACGCCCTGAGAATTTCGACAGGCAAAAGAAAAAGGGGTTAGCATTTAGCTAACCCCTTATCTTATTTGGCGGAAGCGCAGAGATTCGAACTCTGGAACCCTT > CP042583/894087‑894645 ||| aTTACGTCACCCATTCCGGCAGACAGATAGGTGTTCAGAATAGGTCCGAGGATATAACCCAGAAAACCGGTAAAGGCGAATGCGGAGATAATCCCGGTCGGCTTATTCGCCGTTTTATAGGTCAGGAACATCAAACCATACATACCCACCAGCGTCAGAATCAGACCCGGAGATGGCAGCATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACgg > 1:2079804/1‑288 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ATTACGTCACCCATTCCGGCAGACAGATAGGTGTTCAGAATAGGTCCGAGGATATAACCCAGAAAACCGGTAAAGGCGAATGCGGAGATAATCCCGGTCGGCTTATTCGCCGTTTTATAGGTCAGGAACATCAAACCATACATACCCACCAGCGTCAGAATCAGACCCGGAGATGGCAGCATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCGCTAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGACTTGTACGGTCATGACTAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTATGACAGATGTAATTAATTAAGCAGCATAATGATAATGCGTAAGGGCACCCAGAAGTTTTACCCATCTTTACGCATTTGATCTGGAACAGGTTTAACAGCGGATTATCAGGTCATTAAGCAAATATAACGCCCTGAGAATTTCGACAGGCAAAAGAAAAAGGGGTTAGCATTTAGCTAACCCCTTATCTTATTTGGCGGAAGCGCAGAGATTCGAACTCTGGAACCCTT > CP042583/894087‑894645 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |