Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (137/145); minor base T (1/3); total (138/148) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 921,839 | 0 | T | A | 100.0% | 689.7 / NA | 286 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
CCATTTTTTCGTCGTACCCGGCGACTTCGAAAATGGCCTCGGCTATTTCCGGGCTCGTATTGCGCAGAGATGCCCATTCACCGACGTGATGAGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGCCAG‑ACCTGCGACATATTCCCCTTGATAACGAGCAATAGACAGTTCTTCCTGGCTGGGCTGGCGACTACCGTCACCGCCTGCGATGGTGGTTGCGCCGTACGGCGTACCGCCGCGAACCTGACTAACGTCAAATAATTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCAGGTGGATGTGATGGTTTGTTCCTGACCGCCGCCAGTACCGGTGGAACTAAAGACGCTCGCCAGTTTTCCGTATAGTGCGCCGGAAGCCCACAGGCCGCCCGTCTGGTCGAGGAAGGTACGCATTTGACCGGACATGTTGCCAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCG > CP042583/921561‑922117 ||| cctgttttgCGTCTTCCCCGGCGACTTAGAAAATGGCCTGGGCTATTTCCGGCGGCGTATTGCGCAGAGATGCCCATTCACCGACGTGATGAGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCGCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGCCAG‑ACCTGCGACATATTCCCCTTGATAACGAGCAATGGACAGTTCTTCCTGGCTGGGCTGGCGTGAACCGTCACCGCCTGCGATGGTGGTTGCGCCGTACGGCGTACCGCCGCGAACCTGTGAAACGTCAaat < 2:1866861/285‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |