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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (182/220); minor base T (1/0); total (183/220) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 481,668 | 0 | T | A | 99.5% | 966.3 / NA | 403 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (182/219); total (183/220) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 403 total aligned reads displayed.
CAAAAAAGACACACAGGGGAAAGGCGTGAAAAACGCGAGTACCGTAAGCGAAGATACTGCGAGCAATCAAGAGCCGACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTCAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTAGTTTTGCCCACTTTGCCTATAAATACTGGGGACCGTTTGCGGGCTTCCTCTCTGGCTGGAACTACTGGGTAATGTTCGTGCTGGTGGGAATGGCAGAGCTGACCGCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTGGTGAACGTGCGCTTATATGGCGAAACCGAGTTCTGGTTTGCGTTGATTAAAGTGCTGGCAATCATCGGTATGATCGGCT > CP042583/481386‑481942 ||| tacaaaacggggAAAGGCGTGAAAAACGCGTCAACCGTATCGGAAGATACTGCGTCGAATCAAGAGCCTACGCTTCATCGCGGATTACATAACCGTCATATTAAACTGATTGCGTTGGGTGGCGCAATTGGTACTGGTCTGTTTCTTGGCATTGGCCCGGCGATTCAGATGGCGGGTCCGGCTGTATTGCTGGGCTACGGCGTCGCCGGGATCATCGCTTTCCTGATTATGCGCCAGCTTGGCGAAATGGTGGTTGAGGAGCCGGTATCCGGTTCATTTGCCCACTTTg < 2:1608751/281‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |