| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 482,050 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 482,051 | 0 | G | C | 99.5% | 886.7 / NA | 377 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (183/192); minor base A (2/0); total (185/192) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 482,052 | 0 | C | G | 98.9% | 882.3 / NA | 377 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/0); new base G (181/192); total (185/192) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.70e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 377 total aligned reads displayed.
GCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTGGTGAACGTGCGCTTATATGGCGAAACCGAGTTCTGGTTTGCGTTGATTAAAGTGCTGGCAATCATCGGTATGATCGGCTTTGGCCTGTGGCTGCTGTTTTCTGGTCACGGCGGCGAGAAAGCCAGTATCGACAACCTCTGGCGCTACGGTGGTTTCTTCGCCACCGGCTGGAATGGGCT‑GATTTTGAGCCTGGCGGTAATTATGTTCTCCTTCGGCGGTCTGGAGCTGATTGGGATTAC‑TGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTACATCGGTAGTCTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAATCTCGACAGCAACGTGGTAGCTTCTGCGCTGAACTTCGTCATTCTGGTAGCAAGCCTGAGTGTG > CP042583/481771‑482331 ||| gCTGCGGGCATCTATATGCAGTACTGGTTCCCGGATGTTCCAACGTGGATTTGGGCTGCCGCCTTCTTTATTATCATCAACGCCGTTAACCTGGTGAACGTGCGCTTATATGGCGAAACCGAGTTCTGGTTTGCGTTGATTAAAGTGCTGGCAATCATCGGTATGATCGGCTTTGGCCTGTGGCTGCTGTTTTCTGGTCACGGCGGCGAGAAAGCCAGTATCGACAACCTCTGGCGCTACGGTGGTTTCTTCGCCACCGGCTGGAATGGGCT‑GATTTTGTCGCTGGCgg < 2:300778/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |