| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,487,294 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,487,294 | 0 | G | C | 99.7% | 796.6 / NA | 335 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (169/165); total (169/166) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,487,295 | 0 | C | G | 100.0% | 797.2 / NA | 335 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (169/166); total (169/166) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,487,296 | 0 | T | A | 99.7% | 790.7 / NA | 335 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base A (167/165); total (169/166) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
CATGTGCACAACGCCACCCGACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGGCTTAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACGCTAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGTTTCACTGGCATTGTCGGTATATTTGTCGTAACGCACACCTGGACCG > CP042583/1487010‑1487573 ||| cATGTGCACAACGCCACCCGACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGCCAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAACCCAggtata > 2:3120873/1‑285 (MQ=255) aaCGCCACCCGACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTcc > 2:2797627/1‑289 (MQ=255) aaCGCCACCCGACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTcc > 1:1886106/1‑289 (MQ=255) aCGCCACCCGACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCg < 1:3120873/289‑1 (MQ=255) cGCCACCCGACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCg > 2:2929482/1‑288 (MQ=255) cACCCGACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGAcgg > 1:3134089/1‑289 (MQ=255) aCCCGACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGAcggt < 1:3190394/289‑1 (MQ=255) cccGACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGAcggtc > 2:1169467/1‑289 (MQ=255) gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGAcggtcggt < 1:1476424/289‑1 (MQ=255) cTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGtt > 2:121408/1‑289 (MQ=255) aaaaaaTCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAg > 1:1687369/1‑288 (MQ=255) tGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGtt < 1:922220/261‑1 (MQ=255) tGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGtt > 2:922220/1‑261 (MQ=255) tCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGAcggtcggt < 2:1906715/254‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCa > 1:119543/1‑282 (MQ=255) tttGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAg < 2:1350310/272‑1 (MQ=255) tttGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCAtgtg > 1:2136338/1‑289 (MQ=255) cGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGCTTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGGCCCGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGc > 2:215988/1‑288 (MQ=255) cGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGcc > 1:2182765/1‑289 (MQ=255) cGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTAGATAAAAAACACTGGCAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGc > 2:2010863/1‑288 (MQ=255) ttATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGcaa > 1:2340210/1‑286 (MQ=255) ttATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCa > 2:2552376/1‑288 (MQ=255) tCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCtt < 2:2279101/289‑1 (MQ=255) tCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCt > 1:3011129/1‑288 (MQ=255) tCACGCACAAGAGATATGCAGGACACGGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCtt < 2:3011129/289‑1 (MQ=255) cacaAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCTGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGt > 1:1589057/1‑288 (MQ=255) cacaAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTg > 2:1106288/1‑238 (MQ=255) cacaAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTg < 1:1106288/238‑1 (MQ=255) cacaAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGt > 2:3100588/1‑288 (MQ=255) cacaAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGAAAGCCAGACCGCATAACGCGGTCCGTCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGGCTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTTGAAGCCACCTTCAgg > 2:81913/1‑287 (MQ=255) tatGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGt < 1:2552376/288‑1 (MQ=255) cAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCtt < 2:581991/271‑1 (MQ=255) cAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGGTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCtt > 1:581991/1‑271 (MQ=255) gACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGAcgg > 2:14368/1‑206 (MQ=255) gACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTc < 1:2841822/238‑1 (MQ=255) gACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCagag > 1:802722/1‑242 (MQ=255) gACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCAtg < 2:1806386/249‑1 (MQ=255) gACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCAtg > 1:1806386/1‑249 (MQ=255) cacTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGATGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTTGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTACGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGTGAATGTTGTCCGACGGACGGTATGTTCCTGTGCCGACGCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTTTAATCAACCTTAACTCCAAAATGTTCATCAAAAg > 2:1461579/1‑289 (MQ=255) acTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGc < 2:2879762/289‑1 (MQ=255) cTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCa < 2:435570/289‑1 (MQ=255) tGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCAtt > 1:2422684/1‑281 (MQ=255) tGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCa > 1:1003509/1‑288 (MQ=255) tGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCa > 1:2329618/1‑288 (MQ=255) tGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCa > 1:1278791/1‑288 (MQ=255) gTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGAcggtcggt > 2:758918/1‑204 (MQ=255) gTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGAcggtcggt < 1:758918/204‑1 (MQ=255) gACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGGGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCTGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATg < 2:1589057/289‑1 (MQ=255) aCTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGAcggt > 2:1144648/1‑192 (MQ=255) aCTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGAcggt < 1:1144648/192‑1 (MQ=255) tAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGa < 1:3176038/235‑1 (MQ=255) ttGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAg > 1:139217/1‑289 (MQ=255) tggtggtgCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCa > 1:372828/1‑289 (MQ=255) ggtggtgCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCa < 2:1003509/288‑1 (MQ=255) gttcTACTGGCAATCGGTGGGGTGATGTTGTGGCTACGTTGGGAAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTAACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGa < 2:346004/285‑1 (MQ=255) gtgCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATg < 2:2131847/249‑1 (MQ=255) aCTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGAccgaa > 1:545763/1‑284 (MQ=255) ggCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCAtt < 2:2769271/224‑1 (MQ=255) ggCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCAtt > 1:2769271/1‑224 (MQ=255) aaTCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGc > 2:54701/1‑255 (MQ=255) gcgcTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCa > 1:1937672/1‑166 (MQ=255) tgttgtTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCg > 2:2343435/1‑289 (MQ=255) tgttgtTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCg > 1:3151256/1‑289 (MQ=255) gttgttGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGt < 1:3100588/289‑1 (MQ=255) tgCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTgtc < 2:2329618/288‑1 (MQ=255) aCGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGc > 2:1310510/1‑231 (MQ=255) aCGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGa < 2:3170004/253‑1 (MQ=255) aCGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTgtcagtca > 1:1304424/1‑289 (MQ=255) cGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCaa < 2:508074/289‑1 (MQ=255) ggCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCa > 1:1345592/1‑223 (MQ=255) cagcaATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGcc > 2:1668940/1‑287 (MQ=255) caATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGa < 1:1638255/103‑1 (MQ=255) aTGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGt < 2:1953341/156‑1 (MQ=255) aTGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGt > 1:1953341/1‑156 (MQ=255) gggCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCa > 1:454713/1‑129 (MQ=255) gggCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCgg > 2:103571/1‑289 (MQ=255) aGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCa < 2:233902/288‑1 (MQ=255) tGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCg > 1:2895256/1‑236 (MQ=255) aaCGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTgg > 1:1529239/1‑106 (MQ=255) aaCGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTgg < 2:1529239/106‑1 (MQ=255) aGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTggg < 1:2288445/289‑1 (MQ=255) aaGCCAGACCGATTAACACGGTCCGGCAGATAATTGTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGt < 2:2840773/286‑1 (MQ=255) ccAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGTTTc > 2:2705427/1‑287 (MQ=255) ccGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGTTTCACTGGCa < 1:103571/289‑1 (MQ=255) cATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTgg > 1:2241080/1‑87 (MQ=255) cATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTgg < 2:2241080/87‑1 (MQ=255) cATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTgtca < 2:1697426/229‑1 (MQ=255) cATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGCTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGTTTCACTGGCa < 1:2457409/286‑1 (MQ=255) tAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGTTTCACTGGCATTGTc < 1:1169467/289‑1 (MQ=255) tCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAATATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGCTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCACGGAGGCATAGCCCAGCGGCGGGTTTTCCCTGGCATTGTCGGtat > 2:2457409/1‑286 (MQ=255) tCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAGCATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCaa < 1:2077660/224‑1 (MQ=255) tCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCa > 2:3138950/1‑234 (MQ=255) tCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGTTTCACTGGCATTGTCGGTATAtt > 1:2813323/1‑289 (MQ=255) cAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGtt < 2:2636960/156‑1 (MQ=255) cAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGtt > 1:2636960/1‑156 (MQ=255) aGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTGAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGTTTCACTGGCATTGTCGGTATATTTGTCg < 1:2002905/288‑1 (MQ=255) aaTTTTACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGTTTCACTGGCATTGTCGGTATATTTGTCGTAACg < 1:1456545/289‑1 (MQ=255) ttttACATGCTGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGTTTCACTGGCATTGTCGGTATATTTGTCGTAACGca < 1:2705427/289‑1 (MQ=255) tGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCAt < 2:1941362/213‑1 (MQ=255) tGTAGCCCAGCGATAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACCGAAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGTTTCACTGGCATTGTCGGTATATTTGTCGTAACGCACACCTGGAc > 2:1258766/1‑288 (MQ=255) ||| CATGTGCACAACGCCACCCGACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGGTATGCCGACTAAACGCTTTGATAAAAAACACTGGAAGATGGTGGTGGTGCTACTGGCAATCTGTGGCGCTATGTTGTTGCTACGTTGGGCAGCAATGATTTGGGGCTGAGCAGTGACAAACGAAGACAGCCAGACCGCATAACACGGTCCGGCAGATAATTTTACATGCTGTAGCCCAGGCTTAAGGTTGTCCGACGGTCGGTATGTTCCGGTGCAGACTCTGGAGGTTCAGAGTTCCATGTGACGTTGTAAGCCACCTTCAGTCCAAAATGTTCATTAATAGCAACATTTAATGCGCTTTCGGAGTTCAGCGTTGTGTCTTCCGCGCCAAAGACGCTAACACCCTGCGTAAATTTAGCGTTGTCAGTCAACTGCCATGCATAAGCCCCGGAGGCATAGCCCAGCGGCTGGGTTTCACTGGCATTGTCGGTATATTTGTCGTAACGCACACCTGGACCG > CP042583/1487010‑1487573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |