Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 489,830 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 489,830 | 0 | A | T | 99.3% | 659.0 / NA | 282 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (128/151); minor base C (2/0); total (131/151) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.13e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 489,831 | 0 | G | C | 99.6% | 658.4 / NA | 282 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (129/151); total (131/151) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.63e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 489,832 | 0 | C | G | 98.6% | 649.2 / NA | 282 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/0); new base G (127/151); total (131/151) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.54e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
CAGGCCGAAAGGGGTAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCAGCGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGAGCATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCAGCCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTGCC > CP042583/489547‑490107 ||| tAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCg < 1:2407456/288‑1 (MQ=255) aaTGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTGTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCt < 1:407943/289‑1 (MQ=255) ggTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGc < 2:46092/289‑1 (MQ=255) tCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGAACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGTTGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCCCAACCCCGTCGCCa > 2:1349849/1‑289 (MQ=255) gggCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCaga > 1:83340/1‑289 (MQ=255) gggCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGGTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGAGGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATTCAGCAATGTTTTGCCTAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCGGGCGGCATTTT‑TTGCTCCGCTGCCGCCGCAAACCgtcggccagg > 2:954745/1‑280 (MQ=255) gACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTgc > 1:3094549/1‑289 (MQ=255) ccGCCTGCTTTGGATGCAAAATCAGTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAg < 1:2203197/289‑1 (MQ=255) ccTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGCCCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑GTTCCTCGCTGACGCAGCCAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCTGCGTTTAACCAAGtt > 2:2193879/1‑289 (MQ=255) ccTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGtt > 2:3185029/1‑289 (MQ=255) ccTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGtt < 2:83340/289‑1 (MQ=255) ccTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGtt > 1:1873684/1‑289 (MQ=255) ccTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCCCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGtt > 1:231578/1‑289 (MQ=255) ttgATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTa < 2:2430870/287‑1 (MQ=255) tGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTa < 1:1810715/289‑1 (MQ=255) tGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTa < 1:3185029/289‑1 (MQ=255) tGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTa < 2:39481/289‑1 (MQ=255) ggATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTTCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGGACCAGGTTTGCGGTAg > 2:1217020/1‑289 (MQ=255) gCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAgtggt < 1:1217020/289‑1 (MQ=255) aTTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCtt < 1:389349/289‑1 (MQ=255) tCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCg > 2:902405/1‑289 (MQ=255) tCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACAGCGCCCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGAGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTTGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCCTTGGCGCGACAAACCGCTCTCCAGTGGTCCGCGAAGTTGCAACATGCTTTCTGGTGAGGGGAGACCTTACCg > 2:1680040/1‑289 (MQ=255) cTTACCGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCCCTCGCCAGAGTTGCGACACGTTGCAACAGGCTTTCTCTAGTGGTGAGGCCTTACCGCCTg > 1:256197/1‑289 (MQ=255) cTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTgcgc > 1:2606063/1‑245 (MQ=255) cTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGtt > 1:314192/1‑261 (MQ=255) cTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTg > 1:1584505/1‑289 (MQ=255) cTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGCGCCGTCCATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCCCTGACGCCGCCAACCGCCCGCCCGAGTTGCGCGACCTTGCAACCGGTTTTCTTGAGTGGTGAGGCCTTACCCGcg > 2:1537554/1‑287 (MQ=255) tACAGGGGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTGGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGACGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCATCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGAt < 1:1287194/289‑1 (MQ=255) tACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGGGCAGGTTGGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGAt < 1:1680040/289‑1 (MQ=255) aGATGTCGTTGCCCAAAACACGCCGTGCAGTGTTGATGGCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCcg < 2:1650983/288‑1 (MQ=255) aGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCg > 2:2314239/1‑218 (MQ=255) gTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGc < 1:900548/289‑1 (MQ=255) gTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGc < 1:1996117/289‑1 (MQ=255) ttGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGc < 2:2322928/288‑1 (MQ=255) tGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCaa < 1:1507268/289‑1 (MQ=255) aaaaaCGCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCCGATTTAGTCCGCGAAAGGCAACAGTTa > 2:1507268/1‑289 (MQ=255) gCCGTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGgc > 1:63841/1‑289 (MQ=255) ccGTGCAGTTTGTTTGTCTCGTTGTGGGAGTTTTTCTGTCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGTCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGgcg < 2:3081614/289‑1 (MQ=255) gTGCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGgcgcg < 2:1015905/289‑1 (MQ=255) gCAGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGcc < 1:954745/289‑1 (MQ=255) aGTTTTGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGCCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCg < 1:2512925/288‑1 (MQ=255) tttGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGTCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGc < 1:1166874/289‑1 (MQ=255) tttGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGc > 2:1122179/1‑289 (MQ=255) tttGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGc < 1:2977869/289‑1 (MQ=255) tttGATGTCTCGGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGc < 1:2808569/289‑1 (MQ=255) tttGAGGTCTGGGTGTGGGGGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGc < 2:63841/289‑1 (MQ=255) gtggaggtctcggtgtGGGAGTTTTCAGGGCCGGTTATCGCCGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGc < 2:2244054/277‑1 (MQ=255) tgtctcggtgtGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATaa < 1:145521/281‑1 (MQ=255) tcggtgtGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAAc > 2:3027079/4‑205 (MQ=255) tcggtgtGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGa > 2:1096795/4‑224 (MQ=255) tcggtgtGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGc < 2:398491/253‑1 (MQ=255) tcggtgtGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGc < 2:798708/277‑1 (MQ=255) tcggtgtGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCa < 2:2377548/278‑1 (MQ=255) gtgtGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGc < 2:1427362/277‑1 (MQ=255) ggAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCgg < 2:3139885/227‑1 (MQ=255) tttCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAACCTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCTGCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCGGAGGCCGCAAACGGAGGGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGGCGCGGATGGCAACAGGTAAAGGGCGCGCCGTGGCAGAAGCTATATGGGCAGAGGGaa < 1:2355536/289‑1 (MQ=255) tttCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCa > 2:255632/1‑171 (MQ=255) tttCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTgcgc < 1:2445300/180‑1 (MQ=255) tttCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACAACGCACTTTGTGCCGTCGCTGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCCAACCCCTCGCCAGAATTGCGCTACGTTGAAACAGGATTTCTGTAGTGGTGAGGTCTACCCGGCTGATTTTTTCACAGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCACTTGCATAATAGACATGGCGTGACGGa > 2:1958470/1‑288 (MQ=255) tCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTgcgc > 2:765759/1‑178 (MQ=255) tCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCa > 1:2247032/1‑265 (MQ=255) cGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGt < 1:1122179/289‑1 (MQ=255) gggCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCg < 2:930237/144‑1 (MQ=255) gggCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAgtggt > 1:2942762/1‑188 (MQ=255) gggAAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAgtggt < 2:2942762/188‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTa > 1:793093/1‑172 (MQ=255) gTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACAGgcg < 2:2110628/226‑1 (MQ=255) cTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGGCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGc > 1:2061414/1‑204 (MQ=255) tGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGa < 1:673796/288‑1 (MQ=255) ccGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAAc < 2:2485423/289‑1 (MQ=255) ggAAGCGTGCCGCCACCCGCTATCTAGGCAGCGATTCCTTGCGGAAAAGGGCGTAACGACCACGCCCTTGCGTCAGTATATG‑AGGTGGTAATTGCTTGCGTCGCAGACGGCGCAAACCGATCGCGCGAGTTGCGCGACGTTGAAAAAGGCTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATACATGCCGCGAATGGCAACAGTTAAATGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCAGCCGGAAGCGGCGGTAGAAGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAAc < 2:2529539/287‑1 (MQ=255) gAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAgcgg < 1:928231/247‑1 (MQ=255) gcgACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAAcc > 1:1074691/1‑107 (MQ=255) gcgACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATa < 1:1413026/213‑1 (MQ=255) gcgACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTgcg > 1:1341240/1‑289 (MQ=255) cgACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTgcgc > 2:2052527/1‑289 (MQ=255) cgACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTgcgc > 1:270379/1‑289 (MQ=255) gctcgctATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGgcg < 2:673122/194‑1 (MQ=255) gctcgctATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGgcagc > 1:1266585/1‑289 (MQ=255) gctATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAgtg > 1:1629832/1‑289 (MQ=255) ttCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGc < 1:506577/187‑1 (MQ=255) ttCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAAt < 2:286003/192‑1 (MQ=255) cTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTa > 1:545522/1‑288 (MQ=255) cTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTAt < 1:986379/289‑1 (MQ=255) tttGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTATc < 1:1003743/289‑1 (MQ=255) aaCGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATgg < 2:2735356/142‑1 (MQ=255) aaCGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATgg > 1:2735356/1‑142 (MQ=255) aaCGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCg > 1:441676/1‑163 (MQ=255) aaCGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCg < 1:650274/227‑1 (MQ=255) aCGACCACGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCAGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTc < 1:745136/289‑1 (MQ=255) aCGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCCGGGCAGCCGTGTGCCGGTTGGTTGTCCGGTATGGGATatgtcccgtatat > 2:183763/1‑277 (MQ=255) cGCACTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCa < 2:2594417/160‑1 (MQ=255) aCTTTGTGCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTATc < 1:2860512/261‑1 (MQ=255) tgtgCCGTCGATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTgcg < 2:2355526/231‑1 (MQ=255) gccgtcgaTGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGc < 1:2145369/281‑1 (MQ=255) cgtcgaTGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCgat < 2:545522/284‑1 (MQ=255) cgtcgaTGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCgat < 1:3067374/284‑1 (MQ=255) cgaTGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTg > 1:2371966/3‑201 (MQ=255) aTTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCg > 2:1294459/1‑127 (MQ=255) aTTTG‑TTGCCTCGCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTgcc > 2:2717257/1‑288 (MQ=255) ||| CAGGCCGAAAGGGGTAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTGCAGTTTTGATGTCAGCGTGTGGGAGTTTTTCTGGCCGTTTATCGCAGGGGCAAAACTGGTGATGGCTGAACCGGAAGCGCACCGCGACCCGCTCGCTATGCAGCAATTCTTTGCCGAATATGGCGTAACGACCACGCACTTTGTGCCGAGCATGCTGGCGGCATTTG‑TTGCCAGCCTGACGCCGCAAACCGCTCGCCAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTGCC > CP042583/489547‑490107 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |