Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,519,159 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,519,159 | 0 | A | T | 100.0% | 681.7 / NA | 283 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (134/149); total (134/149) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,519,160 | 0 | G | C | 99.7% | 668.5 / NA | 283 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (133/148); total (134/149) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,519,161 | 0 | T | A | 100.0% | 685.3 / NA | 283 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (134/149); total (134/149) |
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
GAGCCTGACCTTTAACCCCGCGCATGCGCAGCAAAAAATCGCCAGCGGCGATTTGCCTGCAAGCAGTTACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCAGTCCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAAAGTTTGCAAAGTAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATAAGCCCTGCTTTGAGCTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGAGCACAACCATCGCGGCGGT > CP042583/1518882‑1519429 ||| gtcgctgaCCTTTAACCCCGCGCATGCGCAGCAAAAAATCGCCAGCGGCGATTTGCCTGCAAGCAGTTACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAACA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGcc > 2:1337230/5‑288 (MQ=255) ccGCGCATGCGCAGCAAAAAATCGCCAGCGGCGATTTGCCTGCAAGCAGTTACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGt < 1:866597/289‑1 (MQ=255) gcgcATGCGCAGCAAAAAATCGCCAGCGGCGATTTGCCTGCAAGCAGTTACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGt > 1:1990851/1‑287 (MQ=255) gcgcATGCGCAGCAAAAAATCGCCAGCGGCGATTTGCCTGCAAGCAGTTACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGt > 1:1240076/1‑287 (MQ=255) cgcATGCGCAGCAAAAAATCGCCAGCGGCGATTTGCCTGCAAGCAGTTACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGCATCTGCCGCCGGt > 1:3066594/1‑286 (MQ=255) aaaaTCGCCAGCGGCGATTTGCCTGCAAGCAGTTACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg < 1:1032060/289‑1 (MQ=255) aaaaGCGCCAGCGGCGATGTGCCGGCAAGCAGTTACAGTTTTGGCTGTCGCGGGTGGATGATTGGAAACGTGGATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTACGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACGGCGGAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCGTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCAGTACTGGCTGAACcgcacg < 2:3066594/289‑1 (MQ=255) aaGCAGTTACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCG‑AATCTTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAg < 1:1924044/289‑1 (MQ=255) gTTACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACGGGCGGAACCGTACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAGCAAGAATg > 2:1078240/1‑289 (MQ=255) ttACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATg > 2:1747919/1‑288 (MQ=255) tACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTTGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGGAGTTGCTAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGGAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGc < 1:1657643/289‑1 (MQ=255) tACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATgg < 1:236631/288‑1 (MQ=255) aCAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg > 1:2849105/1‑255 (MQ=255) aCAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg < 2:2849105/255‑1 (MQ=255) acgTTTTGCTTTTCGCGAGGGGATGATTGGCCACGTCCATTGCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCCCCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTa < 2:763993/287‑1 (MQ=255) gTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCAGCATTCCTGCCAACGCGAAGGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGAAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCTATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTaca < 1:2247076/289‑1 (MQ=255) tttGGCTTTCGGGGGGGGAGGGTTGGCAACGTGCATTTCGTCACCAGTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTa < 2:1680159/285‑1 (MQ=255) tttGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTa < 2:1990851/285‑1 (MQ=255) tGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGt < 1:205733/289‑1 (MQ=255) cTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTa < 1:1605088/288‑1 (MQ=255) tggcgGGGGGATGATTGGAAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGt < 2:1053029/287‑1 (MQ=255) tCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCCCCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGt < 2:317935/289‑1 (MQ=255) tCGCGAGGGGAGGATTGGCAACGTGCATTTCGTAACCATGCCTGCCAACGCGAAGGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGt < 2:641315/289‑1 (MQ=255) cgcgAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCACCGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTCAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGCTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCCATCACGAATGCCGCAGGACCTGCCGCCGCTCCTGGCTGAACCGCCCGCAGGTTGGGCAAATGCCCTGGAACAGAAATGCCTACACCCTTCCGGt > 2:2816048/1‑288 (MQ=255) cgcgAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg < 2:2708475/241‑1 (MQ=255) gggATGATTAGAAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCCGTGATGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCCGCGCGACTCATTGCAATGAAGAATGCCGCAGGATCGTCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGTAGGTTGGTTAAATGCGATGGAACCAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCAtt > 2:1512466/1‑289 (MQ=255) ggATGATTGGCCACGTGCAGTACGGCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCAtt < 2:1601831/288‑1 (MQ=255) aCGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCt < 1:679805/212‑1 (MQ=255) aCGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCt > 2:679805/1‑212 (MQ=255) aCGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCtg < 1:1341476/289‑1 (MQ=255) tGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTCCTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGACTGGCTACACCGTTACGGGACGCATTGATCTTTTTGCTGTgg > 2:149910/1‑289 (MQ=255) ttCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGt < 1:2453904/261‑1 (MQ=255) cACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg > 2:843888/1‑209 (MQ=255) cACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAgg < 1:2924312/213‑1 (MQ=255) cACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTggg < 2:463156/280‑1 (MQ=255) ccATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCg < 1:1330452/289‑1 (MQ=255) ccAGTCCTGCCAACGCGGATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCATATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCTCGGTCTGGGGCGATCCTTCGGTTGTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGTCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCg < 2:2647780/289‑1 (MQ=255) ccTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAACCTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg > 1:2660710/1‑203 (MQ=255) ccTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGAt < 1:305108/289‑1 (MQ=255) caccgcgAAGGCCAGGGCTGCGGCGACGGTAGTGGCCAATTTCCTGCTCTAACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCGGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATg < 2:1417244/286‑1 (MQ=255) cgcgAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg > 2:1167426/1‑194 (MQ=255) cgcgAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg < 1:1167426/194‑1 (MQ=255) aTGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCt < 2:952134/288‑1 (MQ=255) tgcGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGAtggtg > 1:775240/1‑258 (MQ=255) cggcgAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg < 2:432239/177‑1 (MQ=255) cggcgAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg > 2:868965/1‑177 (MQ=255) cggcgAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAgg < 1:460748/181‑1 (MQ=255) cggcgAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAg > 2:2966516/1‑204 (MQ=255) cggcgAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTACTCACCGCTGATCTCggacgc > 2:2459550/1‑284 (MQ=255) cgAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGctct < 1:3003859/288‑1 (MQ=255) aaGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAg < 2:1710119/199‑1 (MQ=255) aaGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCAc > 1:453594/1‑289 (MQ=255) aGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACg < 1:149910/289‑1 (MQ=255) tCCTGCTCTCACCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCt < 1:2816048/289‑1 (MQ=255) tgctctcacccGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTg > 1:1639098/9‑289 (MQ=255) cacccGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTa > 1:942385/3‑190 (MQ=255) acccGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGc > 2:2198919/2‑179 (MQ=255) acccGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGc < 1:2198919/178‑1 (MQ=255) acccGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAg < 1:2714741/255‑1 (MQ=255) aTGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGc < 1:600525/249‑1 (MQ=255) tGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAg < 2:237789/167‑1 (MQ=255) tGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTa < 2:798610/175‑1 (MQ=255) cAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATgcg < 2:353488/153‑1 (MQ=255) cAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATgcg > 1:353488/1‑153 (MQ=255) aCTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCGCTCACGCTGATATCGCCTGCGTTGTCGTTGACACACTGGCAg > 1:1126707/1‑288 (MQ=255) cGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCTCCGCTGATCCCGGc < 2:1636062/238‑1 (MQ=255) cGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCAc > 1:495547/1‑225 (MQ=255) cGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGtt > 1:1437976/1‑289 (MQ=255) aGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTg < 2:453594/289‑1 (MQ=255) gATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGa > 1:1770438/1‑289 (MQ=255) aTCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGt > 1:3025641/1‑204 (MQ=255) aTCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGt < 2:3025641/204‑1 (MQ=255) aTCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTgt > 1:1744585/1‑256 (MQ=255) aTCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGa > 1:1553170/1‑288 (MQ=255) aTCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGa > 1:2078595/1‑288 (MQ=255) aTCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGa > 1:1832952/1‑288 (MQ=255) aTCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATT‑CAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGAt > 1:3087250/1‑288 (MQ=255) tCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATc < 1:1894248/289‑1 (MQ=255) cccGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCGTATCCCGGCAGCTCCCACGCTGATAACGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGAGTTATGTGCCGGTcc > 2:547507/1‑289 (MQ=255) ccGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCca < 2:2078595/289‑1 (MQ=255) gCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCg > 1:2589731/1‑197 (MQ=255) acgtCCTTCTGTCCCCGATCCGCTAAAA‑CTGCCTGACGGGAGGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCTCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTTAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGAAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTATGCTGTGGTCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCTCGGCCGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAg < 2:1912052/285‑1 (MQ=255) tCCTTCTTTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGaca < 2:2327420/246‑1 (MQ=255) tCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg < 1:396143/101‑1 (MQ=255) tCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACcgcacg > 2:396143/1‑101 (MQ=255) tCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGt > 2:1816063/1‑185 (MQ=255) tCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCg > 1:1063750/1‑198 (MQ=255) tCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACg < 1:1690986/219‑1 (MQ=255) tCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTg < 2:2240718/265‑1 (MQ=255) tCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTg > 1:2240718/1‑265 (MQ=255) ccTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGa < 1:736682/268‑1 (MQ=255) tCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCg > 1:840917/1‑179 (MQ=255) ctcGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCt > 2:258435/1‑157 (MQ=255) ctcGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTa > 1:323656/1‑281 (MQ=255) ctcGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGAGCGACTCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGCTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTAACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGCAGACGATGGTTGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGCTATGCCTGGCTGTTAACTGTACACCCTGCCATGCGTTATTTGCCGATCATCCTGTGCTGCCGGCTTTACTGGCAAc > 2:1849212/1‑289 (MQ=255) tcGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTTGCGTTGACACACTGGCAGGCGCTATTTGCCGATCCACAGTTa > 2:736682/1‑268 (MQ=255) tcGATCCGCAAAAA‑CGGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAGTGCCGCAGGGTCGGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAAGGCGCGGGAACAAGAATTGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGTTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACg < 2:3042/289‑1 (MQ=255) tCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTgg > 1:992245/1‑289 (MQ=255) cGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCCCAGTTACCGCCGGCATTACTGGCAACGCCGGTGTCGACAACCAAcgcg > 2:2624726/1‑288 (MQ=255) cGGGCAGCGCGAATCATTGCAATCAAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATcgcg < 1:816482/288‑1 (MQ=255) ||| GAGCCTGACCTTTAACCCCGCGCATGCGCAGCAAAAAATCGCCAGCGGCGATTTGCCTGCAAGCAGTTACAGTTTTGGCTTTCGCGAGGGGATGATTGGCAACGTGCATTTCGTCACCATTCCTGCCAACGCGAATGCCAGTGCTGCGGCGAAGGTAGTTGCCAATTTCCTGCTCAGTCCCGATGCGCAACTGCGTAAAGCAGATCCCGCTGTCTGGGGCGATCCTTCTGTTCTCGATCCGCAAAAA‑CTGCCTGACGGGCAGCGCGAAAGTTTGCAAAGTAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATAAGCCCTGCTTTGAGCTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGAGCACAACCATCGCGGCGGT > CP042583/1518882‑1519429 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |