Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,519,410 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,519,410 | 0 | A | T | 99.1% | 805.2 / NA | 339 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (166/169); minor base G (1/2); total (167/172) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,519,411 | 0 | G | C | 99.4% | 794.7 / NA | 339 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (167/168); total (167/172) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,519,412 | 0 | C | G | 100.0% | 801.2 / NA | 339 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (167/172); total (167/172) |
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
CGGGCAGCGCGAAAGTTTGCAAAGTAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATAAGCCCTGCTTTGAGCTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGAGCACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCTTTTGCCACCAGCGCCCTTCTGCTCTTTGCTGACGGAGGGCTGCTTTATGACTATTTCCCGTATTTCACTCCGCCAATGGACCGATTTGGCATCGGTCTGGGCCTCACCCTTGCAGTGAAAGAAAGCGCATTTCTGCTGTGGATCTTAGCAG > CP042583/1519137‑1519689 ||| atcaaGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTg < 1:3095160/285‑1 (MQ=255) gccgccGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGgcgc > 1:586938/1‑289 (MQ=255) gccgccGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGgc > 1:292341/1‑287 (MQ=255) cgccgGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCt < 1:1663310/288‑1 (MQ=255) tACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGcc < 2:992245/288‑1 (MQ=255) gCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCggg > 2:1782496/1‑242 (MQ=255) gCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCggg < 1:1782496/242‑1 (MQ=255) gCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGGCGACAACCATCGCGGCGGTCCGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTggg > 1:1563086/1‑287 (MQ=255) acgcaGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGAt > 2:1851311/1‑243 (MQ=255) acgcaGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAg > 1:3057594/1‑289 (MQ=255) ggTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTCGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGCTTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGCAATCGccactgatgtgc > 2:2899945/1‑277 (MQ=255) gTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTgcg < 1:2588619/288‑1 (MQ=255) tGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATtgtg < 2:1110589/246‑1 (MQ=255) aGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATtgtg > 1:2679586/1‑234 (MQ=255) aGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCCGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGgct > 1:897860/1‑287 (MQ=255) tACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTg > 1:2969383/1‑201 (MQ=255) tACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCtt > 1:1989024/1‑289 (MQ=255) ccGCATTAATCTTTGTGGGGTGTGCGTGTGTGGCGGTTAGTGATGACCCTCTGATCACGGAGTCTCTCCCGCTTATATCGCCTGCTTTGGCGTGGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGCTGCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGGGATTGTGGCGCTTTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCttt < 2:2771143/288‑1 (MQ=255) cGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGt < 2:2546397/177‑1 (MQ=255) cGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGa < 2:2814459/191‑1 (MQ=255) cGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGa > 1:2814459/1‑191 (MQ=255) cGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCt < 1:3005830/216‑1 (MQ=255) cGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCtttt > 1:738941/1‑289 (MQ=255) cGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCtttt > 2:480975/1‑289 (MQ=255) cGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCtttt > 1:1077748/1‑289 (MQ=255) cGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCCCCCTTCTGCCGTGGCCGCTCGCCATTCCCCATGTGGCtttt > 2:2064514/1‑289 (MQ=255) tAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCTTTTGccac < 1:577790/289‑1 (MQ=255) tCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCtg > 2:882927/1‑209 (MQ=255) tCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCTTTTGccacca > 2:645757/1‑288 (MQ=255) 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tggtggCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCTTTTGCCACCTGCGCCCGTCTGCCCttt > 2:2134787/1‑287 (MQ=255) tggCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCTTTTGCCACCAGCGCCCTTCTGCTCTTTGCTg > 1:1131281/1‑288 (MQ=255) tttATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCTTTTGCCACCAGCGCCCTTCTGCTCTTTGCTGACGGAgg > 1:2384491/1‑286 (MQ=255) 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cGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTTCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCCTTCCCCATGTGGCTTTTGCCACCAGCGCCCTCCTTCCCTTTGCTGCTGGAGGGCTGCTTTATg > 2:3093237/1‑288 (MQ=255) gCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCTTTTGCCACCAGCGCCCTTCTGCTCTTTGCTGACGGAGGGCTGCTTTATGAc < 1:1020627/289‑1 (MQ=255) cTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGAtt < 2:247978/159‑1 (MQ=255) cTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGAtt > 1:247978/1‑159 (MQ=255) cTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGaa > 1:2515544/1‑182 (MQ=255) cTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATgg < 2:1954757/186‑1 (MQ=255) cTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATATCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGTCGACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCTTTTTCCACCAGCGCCCTTCTGCCCTTTTCTGGCGGAGGGCTGCTTTATGACt > 2:563203/1‑289 (MQ=255) 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1:779655/227‑1 (MQ=255) ||| CGGGCAGCGCGAAAGTTTGCAAAGTAGAATGCCGCAGGATCTGCCGCCGGTACTGGCTGAACCGCACGCAGGTTGGGTAAATGCGCTGGAACAAGAATGGCTACACCGTTACGGTACGCATTAATCTTTTTGCTGTGGGCGATGGTGGCGGTGATTTATGCACCGCTGATCCCGGCAGCTCTCACGCTGATAAGCCCTGCTTTGAGCTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGCATTACTGGCAACGCTGGTGAGCACAACCATCGCGGCGGTCGGGGCATTGTTGATTGCCCTGCTGGTGATTGTGGCGCTGTGGCCTGGGCCGAAATGGCAGCGTATGTGCGCCCGTCTGCCGTGGCTGCTCGCCATTCCCCATGTGGCTTTTGCCACCAGCGCCCTTCTGCTCTTTGCTGACGGAGGGCTGCTTTATGACTATTTCCCGTATTTCACTCCGCCAATGGACCGATTTGGCATCGGTCTGGGCCTCACCCTTGCAGTGAAAGAAAGCGCATTTCTGCTGTGGATCTTAGCAG > CP042583/1519137‑1519689 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |