Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,531,040 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,531,040 | 0 | A | T | 99.7% | 882.1 / NA | 368 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (187/180); minor base A (0/1); total (187/181) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,531,042 | 0 | C | G | 100.0% | 874.1 / NA | 368 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (187/181); total (187/181) |
Only 100 of 368 total aligned reads displayed.
AAATTAACACGAGAGTGGATTTTGTTACAGCACAGTCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATAGCAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTTTAGTAAATTAAGCCGCCAGCTGCTTGGTGCCAGTTCCGATCGTCTGCAGGAAAACAGTCTGTTTGATATCGTCAACACTATTCGCCAGGCGAAGGACGACCGCAATATCACCGGTATTGTGATGGATCTGAAAAACTTCGCAGGCGGCGACCAACCGTCTATGCAGTACATCGGCAAAGCTCTGAAAGAGTTTCGTGA > CP042583/1530765‑1531320 ||| aaaTTAACACGAGAGTGGATTTTGTTACAGCACAGTCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGATAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGc < 1:1975262/289‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |