Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,555,916 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,555,916 | 0 | G | C | 99.7% | 919.9 / NA | 386 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (184/200); total (184/202) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,555,917 | 0 | C | G | 100.0% | 927.8 / NA | 386 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (184/202); total (184/202) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,555,918 | 0 | T | A | 99.7% | 926.3 / NA | 386 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base A (184/200); total (184/202) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 386 total aligned reads displayed.
ACCCCGTCTCTTTTACTATCAGTCGGGCAAGATTGCGTTCACTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGGCTTATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGT > CP042583/1555639‑1556196 ||| ccccGTCTCTTTTACTATCAGTCGGGCAAGATTGCGTTCACTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAAt < 1:2265485/289‑1 (MQ=255) ctctTTTACTATCAGTCGGGCAAGATTGCGTTCACTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCaa > 2:60853/1‑289 (MQ=255) aGTCGGGCAAGATTGCGTTCACTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAAtgtg > 1:2569811/1‑273 (MQ=255) tCGGGCAAGATTGCGTTCACTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCAt < 1:2248815/288‑1 (MQ=255) cGGGCAAGATTGCGTTCACTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTg > 1:1916032/1‑289 (MQ=255) gCAAGATTGCGTTCACTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTc < 2:744371/288‑1 (MQ=255) cAAGATTGCGTTCACTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCa < 2:2480842/288‑1 (MQ=255) ttGCGTTCACTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTgcg > 2:2568606/1‑288 (MQ=255) gTTCACTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTgg < 1:1327726/288‑1 (MQ=255) aCTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACAt > 2:827287/1‑259 (MQ=255) aCTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCg > 1:3171834/1‑289 (MQ=255) cGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCa > 1:2855144/1‑269 (MQ=255) agccagccCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATaaacagaaaaca < 1:60853/289‑1 (MQ=255) tGCCCCAGTCCCCCCCCCTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCCCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCAt < 2:161366/289‑1 (MQ=255) aTGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGt > 1:2442256/1‑289 (MQ=255) ccccACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAAc > 2:1348513/1‑220 (MQ=255) cccACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTgcg < 2:1639204/242‑1 (MQ=255) cccACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTgcg > 1:1639204/1‑242 (MQ=255) cccACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATaaacagaaaa > 1:266671/1‑263 (MQ=255) cccACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATaaacagaaaa < 2:266671/263‑1 (MQ=255) ccACTCAACGGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGGGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGa < 2:1681115/289‑1 (MQ=255) cACGCGACAGGCCCTTTCGCCACCAGCTCCACCATGGTGCGGGTTTTAGGGTGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGAt < 2:3171834/289‑1 (MQ=255) tccggaaGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCAGCGGGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTTTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTg < 2:2101727/283‑1 (MQ=255) tCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATaaacagaaaaca > 1:758338/1‑260 (MQ=255) gCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCt < 1:274136/232‑1 (MQ=255) gCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGtt > 1:1549978/1‑288 (MQ=255) ccTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTcc > 2:3093317/1‑288 (MQ=255) ttCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACt < 2:1876494/222‑1 (MQ=255) atcatcTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACcccgcccg < 2:1549978/289‑1 (MQ=255) ccaccaTCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTgcg > 2:54762/1‑212 (MQ=255) ccaccaTCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTgcg < 1:54762/212‑1 (MQ=255) tCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGc > 1:375124/1‑289 (MQ=255) tCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGc > 1:1058861/1‑289 (MQ=255) cGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCa > 2:1262103/1‑289 (MQ=255) tGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCt < 1:978934/256‑1 (MQ=255) tGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCt > 2:978934/1‑256 (MQ=255) tGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCata > 2:923650/1‑289 (MQ=255) tGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCata > 1:1267074/1‑289 (MQ=255) gggAGTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGGCCGGCGTTTGTTGTGGTGGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCGGCGGGTCATTGGATCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCatat < 2:2577654/287‑1 (MQ=255) cGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCAcc > 1:3146243/1‑264 (MQ=255) aTTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGt < 1:384158/225‑1 (MQ=255) ttAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTGTGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTggcg < 1:834430/289‑1 (MQ=255) aaCGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACaaa < 1:3008624/289‑1 (MQ=255) aCGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAAcc > 1:3125624/1‑261 (MQ=255) aCGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAAcc < 2:3125624/261‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCa > 2:2398576/1‑272 (MQ=255) cAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCa < 1:2398576/272‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCAttt > 1:198749/1‑289 (MQ=255) gTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCt < 1:1670516/225‑1 (MQ=255) gttgttgtGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACa < 1:1166643/289‑1 (MQ=255) tgttgtGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTc > 2:228221/1‑191 (MQ=255) tgttgtGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCAACAAAGCATTTTCCACCGTACAgg > 1:2291645/1‑289 (MQ=255) gttgtGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCAcc > 2:2200156/1‑281 (MQ=255) gttgtGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCAcc < 1:2200156/281‑1 (MQ=255) gttgtGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGt > 2:1090967/1‑289 (MQ=255) gctgctGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATaaacagaaaaca < 2:1305482/178‑1 (MQ=255) gctgctGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCa < 1:932221/273‑1 (MQ=255) gctgAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCt > 2:2259037/1‑205 (MQ=255) ctgAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCa > 2:1134205/1‑269 (MQ=255) ctgAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCa > 1:499389/1‑289 (MQ=255) gTTCACAAAACAGGCTCGGAATTAATCTGCGGGGCATTGGCCCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGTTATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCGTTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAgcg < 2:499389/288‑1 (MQ=255) ttCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCatat > 2:804746/1‑229 (MQ=255) ttCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCatat < 1:804746/229‑1 (MQ=255) ttCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTGCa > 2:283111/1‑267 (MQ=255) tcatcaAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCTGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGc < 2:2806209/179‑1 (MQ=255) tcatcaAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATaaacagaaaa < 2:1458664/162‑1 (MQ=255) catcaAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAg > 1:1734927/1‑289 (MQ=255) caAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTa > 1:1018059/1‑288 (MQ=255) caAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTAt < 2:198749/289‑1 (MQ=255) gACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCAt > 2:1193699/1‑120 (MQ=255) gACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCa > 2:2903966/1‑248 (MQ=255) gACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCa < 1:2903966/248‑1 (MQ=255) aCCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACa > 1:1442575/1‑254 (MQ=255) aCCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGt > 2:274934/1‑288 (MQ=255) cTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCa > 1:1197207/1‑262 (MQ=255) aaTTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCt > 1:1851010/1‑177 (MQ=255) aaTTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCAAGTATCAGCTGTCCttt > 2:1276982/1‑288 (MQ=255) aaTCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCACTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCACCTGTCCTTTGCgg > 2:447473/1‑288 (MQ=255) aTCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTg > 1:1372766/1‑170 (MQ=255) ttccggTCATTGGCTCAGCACTCTTAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGTCATAAGGACGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTg < 1:2818351/285‑1 (MQ=255) tGCGGGTAATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTg < 2:214497/289‑1 (MQ=255) cGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCATTTGCGGTGCTGAt > 1:1288824/1‑289 (MQ=255) tGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGAt > 1:2644542/1‑155 (MQ=255) tGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGAt < 2:2644542/155‑1 (MQ=255) cAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGt > 1:3072420/1‑289 (MQ=255) gCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACa > 1:1112881/1‑224 (MQ=255) cACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTTAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTTTCCTTTGCGGTGCTGAGTTCAAGGACTGGTTaa > 2:325357/1‑289 (MQ=255) gAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCAt < 2:1018059/288‑1 (MQ=255) cTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCa < 1:2788490/199‑1 (MQ=255) cTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGt < 1:2541418/269‑1 (MQ=255) gTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTg < 1:1790199/252‑1 (MQ=255) gTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTg > 2:1790199/1‑252 (MQ=255) tGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTg < 1:2144567/249‑1 (MQ=255) cAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACa > 2:2998354/1‑198 (MQ=255) ggTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCACCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAAt > 1:1611085/1‑289 (MQ=255) attCCCGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAgcg < 1:1452216/204‑1 (MQ=255) ccGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCa < 2:140833/289‑1 (MQ=255) cGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCa < 2:1499675/189‑1 (MQ=255) cGGCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCa > 1:1499675/1‑189 (MQ=255) ggCATAAGGGCGATATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACGTGATTGCTATGTTCCACTCCGCCCGGTATATAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCGTTGTCAACCGTATAGGTAATTGCACCATGTAGCGACAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGCACAGGAATGGTTAACTCATCCGTTCCGGTGTGATGACAAAATTCGACGGCGGATTCagg > 2:1920776/1‑287 (MQ=255) ||| ACCCCGTCTCTTTTACTATCAGTCGGGCAAGATTGCGTTCACTCATCGCAAAAAAGCCAGCCCATTGCCCCAATGCCCCCCACTCGACAGGCCCTTTCGCCATCATCTCCACCATCGTGCGGATTTTAGGATGAGAAGAAACGGGCAGGTGCAGCTGTTGTTGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATCAAACAGGACCTGAATTAATCTGCGGGTCATTGGCTCAGCACGCTGAGTCGTCGTCCTGTTTGCCAGGGTTAAAATTAATTCCCGGCATAAGGGGCTTATTTTCAATGTGCAACATGTTGTCGGCATTGTCACTGCGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGT > CP042583/1555639‑1556196 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |