Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,585,911 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,585,913 | 0 | T | A | 100.0% | 758.6 / NA | 313 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (137/176); total (137/176) |
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
CTTATCTATAACAACGTCACGAATCATGGTGCGTTAATAACGACATGGTTATTAAGCGCACTGGCTCTGATGGGTTTTTATATATTCTGGATCCGCGTTCCGAAGATCATCTTTAAACAAAAAGGTTTTTTCTTCGCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGAGCGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTTAGTACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAATCCAAATGAAAATCGTTATCAATAAAGCAATGAAATAATATATTCCAACAGTTGTTTTATATTCTCAAAATATGTTAAGGTTGCGCCCTCATTTGGGGAGTAGCCGATTTCCAGATTCCGGAAATGTACGTG > CP042583/1585632‑1586169 ||| catatatataACAGCGTCACGAATACTGGTTCGTTAATAAAGACATGGTTGTTAAGCGCACTGGCGCTGATTGGTTTTTATATATTCTGGATCCGCGTTCCGAAGATCATCTTTAAACAAAAAGGTTTTTTCTTCGCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTTTCAACTCAAt < 2:1853321/287‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |