| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,612,491 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,612,491 | 0 | A | T | 99.5% | 867.8 / NA | 362 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (178/181); minor base C (2/0); total (180/182) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,612,492 | 0 | G | C | 100.0% | 866.1 / NA | 362 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (180/182); total (180/182) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,612,493 | 0 | T | A | 99.7% | 867.1 / NA | 362 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (179/181); minor base G (0/1); total (180/182) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 362 total aligned reads displayed.
CCTGCTAACCGTCAGCGCGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCAGTGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAC > CP042583/1612214‑1612770 ||| ccTGCTAACCGTCAGCGCGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGcc < 1:1223269/289‑1 (MQ=255)ccTGCTAACCGTCAGCGCGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGcc < 2:1533051/289‑1 (MQ=255) cAGCGCGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGt > 2:1429042/1‑289 (MQ=255) tGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTg < 2:1562821/272‑1 (MQ=255) ggATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCt < 2:1737197/288‑1 (MQ=255) tgtgCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCg > 2:2837890/1‑289 (MQ=255) tgCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCggg > 1:12126/1‑289 (MQ=255) tgCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCggg > 1:1518377/1‑289 (MQ=255) gCACCCGTAGGTCATAGCCAGGAGGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGa < 2:2125713/289‑1 (MQ=255) aCCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATc < 2:12126/289‑1 (MQ=255) cAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGcc > 1:2139429/1‑245 (MQ=255) cAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGa < 1:3136548/285‑1 (MQ=255) cAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCg > 1:445193/1‑289 (MQ=255) gTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATcc > 2:437142/1‑286 (MQ=255) gTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCCGGTATGGGTTGTTTGGTGACGAGCTATTTGTCTGTGGTGCTGAGGTGATTTTCCGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGACGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTTTCAGCGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTGCCTCTGACTTCCGTTGGTCTGGATcctt > 2:2185668/1‑286 (MQ=255) aGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGt < 1:2837890/286‑1 (MQ=255) tCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTa > 2:855718/1‑285 (MQ=255) tCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTa < 1:855718/285‑1 (MQ=255) aTGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCt > 1:2517833/1‑287 (MQ=255) tGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGt > 1:910454/1‑268 (MQ=255) cGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTc < 1:2292651/289‑1 (MQ=255) aaTCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGcc > 1:2230804/1‑289 (MQ=255) tGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGcc < 2:1037389/204‑1 (MQ=255) tGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGt > 2:2600668/1‑249 (MQ=255) tGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCcaca > 1:641239/1‑287 (MQ=255) ggCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACt < 1:2030961/289‑1 (MQ=255) cAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTTAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTa > 2:406360/1‑242 (MQ=255) aaaTGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTc < 1:1970562/285‑1 (MQ=255) cGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGtt < 1:469589/289‑1 (MQ=255) cccTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATaa > 2:2668551/1‑289 (MQ=255) tGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAAtgtg < 1:1005313/289‑1 (MQ=255) gAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGa > 1:1175835/1‑211 (MQ=255) aCGTGCGCAGGGGATTGCCCGGAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTGATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGGGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCa < 2:1403509/288‑1 (MQ=255) tGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATc < 2:1281476/208‑1 (MQ=255) gcgcAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCggg < 1:271718/204‑1 (MQ=255) cgcAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATg > 1:2774508/1‑288 (MQ=255) aTTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGgc > 1:1603987/1‑288 (MQ=255) tGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGACACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCa > 1:2271319/1‑289 (MQ=255) gtgCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTAt < 2:18186/215‑1 (MQ=255) gtgCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTAt > 1:18186/1‑215 (MQ=255) gtgCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTc > 1:141998/1‑289 (MQ=255) gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGTGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGATGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGt < 1:412526/289‑1 (MQ=255) gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTc > 2:2736295/1‑224 (MQ=255) gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTc > 2:2682955/1‑224 (MQ=255) gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTc < 2:3158406/232‑1 (MQ=255) gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCa < 1:1540206/265‑1 (MQ=255) gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGt > 1:1249033/1‑289 (MQ=255) gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGt > 2:299143/1‑289 (MQ=255) gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTGGGCGGGATCCGTCTGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCCCACCTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATTTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTTTTTGGt > 1:247344/1‑289 (MQ=255) ggTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGgcg < 1:1044700/252‑1 (MQ=255) tttGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATg > 1:809174/1‑289 (MQ=255) ttGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATgg < 1:361193/289‑1 (MQ=255) ttGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCAGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATgg < 1:269241/289‑1 (MQ=255) tGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATa > 2:474707/1‑224 (MQ=255) cGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCcg < 2:2223513/288‑1 (MQ=255) aGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGc > 2:711242/1‑108 (MQ=255) aGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCcg < 1:2674157/286‑1 (MQ=255) tttGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTTTTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgg > 1:1140951/1‑289 (MQ=255) tggtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTa > 1:2583079/1‑141 (MQ=255) tggtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGc > 2:1664193/1‑288 (MQ=255) ggtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCa < 1:2613764/288‑1 (MQ=255) gtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAAtgtg > 2:2470449/1‑206 (MQ=255) gtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGt > 1:565226/1‑248 (MQ=255) gtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACATGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGt > 2:1184041/1‑143 (MQ=255) tgatgaGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACt < 2:2517833/288‑1 (MQ=255) atgaGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATaa > 1:2943725/1‑199 (MQ=255) tgaGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGc < 1:305891/288‑1 (MQ=255) gaGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTa < 1:763286/289‑1 (MQ=255) gTGATTTTCAGTGATGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTgg < 2:240676/283‑1 (MQ=255) gTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCg < 1:1328647/111‑1 (MQ=255) gTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGAcc > 2:2899826/1‑171 (MQ=255) gTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTgg > 1:240676/1‑283 (MQ=255) gTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACt > 1:2910293/1‑288 (MQ=255) gATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTgg > 2:1905722/1‑281 (MQ=255) gATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTgg < 1:1905722/281‑1 (MQ=255) aTTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGtt > 1:1861233/1‑185 (MQ=255) aTTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCag < 2:1223131/289‑1 (MQ=255) aTTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCag > 1:2801665/1‑289 (MQ=255) gTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGa > 1:1489778/1‑154 (MQ=255) gTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGttgttg > 2:640413/1‑289 (MQ=255) gTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTG‑CCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGttgttg > 1:174792/1‑288 (MQ=255) ctcCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGAc < 1:2998779/289‑1 (MQ=255) tcCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGc > 2:2093286/1‑142 (MQ=255) tcCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATa < 2:2703160/175‑1 (MQ=255) gTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGa < 2:589704/144‑1 (MQ=255) gTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGAc > 2:1499140/1‑145 (MQ=255) tCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGa > 2:356725/1‑165 (MQ=255) tACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGt < 1:2016520/205‑1 (MQ=255) tACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGGCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGt > 2:2016520/1‑205 (MQ=255) aCCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTg < 2:3021717/154‑1 (MQ=255) aCCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAg < 1:437072/207‑1 (MQ=255) ggATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCAcg > 2:1934232/1‑288 (MQ=255) gTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGcc > 2:2284096/1‑217 (MQ=255) gTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGc < 1:32337/239‑1 (MQ=255) cGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACa < 2:809174/289‑1 (MQ=255) ttAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg > 2:1076170/1‑223 (MQ=255) ttAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAgg > 1:520247/1‑289 (MQ=255) ctcAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACa < 1:1706878/280‑1 (MQ=255) tcAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 2:520247/289‑1 (MQ=255) cAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGCTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCGGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCAGCGGTCGGGGGGTGGCCCTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGCGGCCATTGCATTCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAc > 2:910969/1‑289 (MQ=255) ||| CCTGCTAACCGTCAGCGCGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCAGTGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAC > CP042583/1612214‑1612770 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |