| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,618,196 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,618,196 | 0 | A | T | 99.7% | 841.2 / NA | 351 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (178/171); total (180/171) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,618,197 | 0 | G | C | 99.7% | 829.4 / NA | 351 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (179/170); total (180/171) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,618,198 | 0 | C | G | 99.4% | 841.8 / NA | 351 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (178/171); total (180/171) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 351 total aligned reads displayed.
TTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAAAGCCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGATAATAATCTTGAAAAAGTTATCGCGGCGGGTGCCAACGTTGTACGT > CP042583/1617916‑1618475 ||| cAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTaa > 1:2655507/1‑289 (MQ=255) aaaaaTCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAAtt < 1:761510/289‑1 (MQ=255) ggCACGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACg > 2:2347662/1‑285 (MQ=255) cACGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtc > 1:1003218/1‑289 (MQ=255) aCGCGAAACCGACGCCATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca < 2:2488761/289‑1 (MQ=255) aCGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca < 2:1003218/289‑1 (MQ=255) aCGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca < 1:2721629/289‑1 (MQ=255) aCGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca < 1:2347662/289‑1 (MQ=255) aCGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca < 1:1925690/289‑1 (MQ=255) aactcacgCCTTGGGGCTTGCCCTCACCCCTGCGAGAACCCCGCTGGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTcc < 2:158454/284‑1 (MQ=255) aaagcccaccATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTGGACCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTcc < 2:1206135/281‑1 (MQ=255) ccTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTGTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTGAAAACGACTGACACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGaa > 1:1501956/1‑289 (MQ=255) cACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACg < 2:1094279/277‑1 (MQ=255) cACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATga > 1:593347/1‑289 (MQ=255) cACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCAGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca > 2:2068827/1‑259 (MQ=255) cACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCAGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca < 1:2068827/259‑1 (MQ=255) aCCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTtata < 2:3144524/274‑1 (MQ=255) ctctGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGAt > 2:2552339/1‑289 (MQ=255) tGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGa > 1:722618/1‑207 (MQ=255) tGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGc < 1:1334269/212‑1 (MQ=255) tGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGc > 2:1334269/1‑212 (MQ=255) tGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca < 1:1540928/253‑1 (MQ=255) tGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAAt < 1:3043478/281‑1 (MQ=255) tGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGCGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTaa > 1:1746849/1‑289 (MQ=255) tGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGACCATGGCTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGAATTTCTTTGCGACCCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCGTAAGGGATCGCGTTTTGATAATCGGTTATGTAATTTACATGACGATCGCTAAAAACGGCTGTCCTCGTCCTAATCTTATATTACTTCCGAATGATATCaa > 2:241457/1‑289 (MQ=255) cGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca > 1:935365/1‑251 (MQ=255) ccGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATTCGCCATCCGAAGGAGATTAAtt > 2:3043478/1‑281 (MQ=255) gCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca > 2:2883193/1‑241 (MQ=255) cTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca < 1:1100412/240‑1 (MQ=255) tCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGGTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATcgc > 2:279610/1‑289 (MQ=255) cGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTa > 2:1820967/1‑246 (MQ=255) cGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTtata > 2:2277415/1‑254 (MQ=255) tCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGAt > 1:451871/1‑191 (MQ=255) tCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGAt < 2:458835/191‑1 (MQ=255) tCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtcac > 1:1149180/1‑210 (MQ=255) gACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAg < 1:1207200/165‑1 (MQ=255) aCCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCCTGGTTTCTCGACTTGAACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAacac < 2:1136110/289‑1 (MQ=255) aCCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAaca > 2:576164/1‑288 (MQ=255) ccGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAaca > 1:1951980/1‑287 (MQ=255) tACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCTCAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAaca > 1:2524792/1‑279 (MQ=255) aCTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGttt > 2:1886913/1‑289 (MQ=255) tGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGaa > 1:1818318/1‑217 (MQ=255) aCATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCt > 2:2220855/1‑174 (MQ=255) tataTGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTaa > 1:1846642/1‑192 (MQ=255) atGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAg < 2:1541312/289‑1 (MQ=255) gCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATcg < 1:1393501/227‑1 (MQ=255) gCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTa > 1:904100/1‑289 (MQ=255) cATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTcc < 1:3069583/181‑1 (MQ=255) aTGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTa < 2:708504/182‑1 (MQ=255) aTGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTa > 1:708504/1‑182 (MQ=255) aTGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTAc < 2:940907/289‑1 (MQ=255) tGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGt < 1:1627398/283‑1 (MQ=255) tGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGt > 2:1627398/1‑283 (MQ=255) tGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACa > 2:297586/1‑289 (MQ=255) ggTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACAt > 2:2016077/1‑289 (MQ=255) ctcGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca < 1:2432251/167‑1 (MQ=255) ctcGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCa > 1:82377/1‑289 (MQ=255) ctcGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCa > 1:2156333/1‑289 (MQ=255) tcGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAg > 2:2459736/1‑289 (MQ=255) cTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATcg < 2:743654/211‑1 (MQ=255) cTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAACTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCCGCGTTATTTCATTCGGAATTCATGTTCACGCAACACCTGGTTGTTTCCGTCAACGGATTAGTACATTTCCAGAAg > 2:2993786/1‑288 (MQ=255) ttGCACGGCTGACCGTGATTGATGTGCTTGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCTGAGATAGCTGGAAGCGGTTCAAAGAAGCGCTGGTGGATTGGCTTTTTGTTACGCAGTTGCTTAACTTAAGTGACGATCGCTAATAGCTACTGTCACTGTCCTACTCTTTTACGACATCCGTATGGGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTTGGATTTCATGTTCAAGCAAAACCTGGTTGTTTCAGTTAACGGAGTATTACATGTCCAGAAgg < 2:2571023/288‑1 (MQ=255) tGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATa > 2:915613/1‑116 (MQ=255) tGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCt > 1:220606/1‑289 (MQ=255) gCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACg < 1:2990810/260‑1 (MQ=255) gATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACaaaaa > 1:2319105/1‑288 (MQ=255) tgCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGAAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTAcc < 2:1562969/288‑1 (MQ=255) cTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTc < 2:2667876/233‑1 (MQ=255) gCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCaa > 2:2698970/1‑236 (MQ=255) cGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTa < 1:2016077/288‑1 (MQ=255) cGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTa < 2:1951980/288‑1 (MQ=255) gACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTa < 2:3185400/279‑1 (MQ=255) aCAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTcc > 2:1813622/1‑135 (MQ=255) aTTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAg < 1:2459736/288‑1 (MQ=255) ttACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCaa < 1:2961293/289‑1 (MQ=255) aCTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTc > 2:6388/1‑198 (MQ=255) aCTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTc < 1:6388/198‑1 (MQ=255) gCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAg < 2:1412265/196‑1 (MQ=255) gCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACAt > 1:2839033/1‑232 (MQ=255) gCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGcc < 2:1739706/276‑1 (MQ=255) ttCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGATAATAATCTTGaa < 1:318629/289‑1 (MQ=255) agagATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCTGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGaa > 2:440141/1‑233 (MQ=255) agagATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGATAATAATCTTGaaaaa > 2:1447118/1‑289 (MQ=255) aCTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAg > 1:2674626/1‑198 (MQ=255) aCTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAg < 2:2674626/198‑1 (MQ=255) aCTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTAc < 1:464598/239‑1 (MQ=255) aCTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAgg < 2:1108251/248‑1 (MQ=255) aCTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAgg > 1:1108251/1‑248 (MQ=255) aCTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATAAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTAAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCATCGCAGAACAAAAATCGTTACCAAGTTAGGCCCAGCAACAGACCGCTATAATAATCTCAAAAAAGTtctc > 2:1754605/1‑288 (MQ=255) aaGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACg > 2:1280521/1‑190 (MQ=255) aaGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACg < 1:1280521/190‑1 (MQ=255) aGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGATAATAATCTTGAAAAAGTTATCgcggcg < 1:2560904/288‑1 (MQ=255) aGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGATAATAATCTTGAAAAAGTTATCgcggcg < 1:3167714/288‑1 (MQ=255) ggTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACg > 1:1038018/1‑59 (MQ=255) tCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACAt > 2:1054030/1‑194 (MQ=255) tCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGATAATAATCTTGAAAAAGTTATCGCGGCGGGTGCCa > 1:1184375/1‑289 (MQ=255) tCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCAGTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGATAATAATCTTGAAAAAGTTATCGCGGCGGGTGcc < 2:1184375/288‑1 (MQ=255) agCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGATAATAATCTTGAAAAAGTTATCGCGGCGGGTGCCAACGTTg < 1:1581568/288‑1 (MQ=255) cgcTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGcc < 1:1787770/229‑1 (MQ=255) cgcTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGATAATAATCTTGAAAAAGTTATCGCGGCGGGTGCCAACGTTGTAc > 2:523895/1‑289 (MQ=255) ||| TTCTCACACTGGAAGAACAAAAAATCTGGTCGAGCTGGCGCAGCTGGCACGCGAAAACGACGCCATGGTGATTGCCCTCACCTCTGCGGGTACCCCGCTCGCCCGGGAAGCAACGCTGGCAATTACCCTCGACGTACCGGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAAAGCCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGATAATAATCTTGAAAAAGTTATCGCGGCGGGTGCCAACGTTGTACGT > CP042583/1617916‑1618475 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |