Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,627,353 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,627,353 | 0 | A | T | 99.7% | 783.6 / NA | 328 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 1,627,354 | 0 | G | C | 100.0% | 784.9 / NA | 328 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (159/169); total (159/169) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,627,355 | 0 | T | A | 100.0% | 795.8 / NA | 328 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (159/169); total (159/169) |
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
TCAAATAAGTGCTGCAAGTAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAACGGTGAAGACTTCCTGGTTGCAGAAAGCCGGGTTCCCCTTAGTACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTAGCTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGTTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTAGCCGCCAGTTCTGTAGTAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCGGTGGGTGAAATAGAGACGTTTGGAGAATTGTTAAATAGCAATCCGAATGCAAAACTCACTTTCTGGAAATTCTGGTTCCTGGGTTCTATTCCGTGGGAGCGTAAAACCGTCACGCCAGCCAGTTTGTGGCATCATCCGGGTTTGGTGTTGATTCATGCGGAGGGAGTGGAAACGCCTCAGCCGGAACTGACCGAGGCGGTATAACTTAACGCAGTCGCCCTCTCGCCAGG > CP042583/1627073‑1627627 ||| tgcatcaaaTTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATACCGGTGAAGACTTCCTGGTTGCAGAAAGCCGGGTTCCCCTTTCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGTTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGat < 2:551691/279‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |