| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 1,643,113 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (133/141); minor base A (1/0); total (134/141) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 | |||||||||||
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| * | CP042583 | 1,643,115 | 0 | T | A | 100.0% | 665.2 / NA | 275 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (134/141); total (134/141) | |||||||||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
AAATAGTGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAAAGTTGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAAAGTCAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTAGTAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAAAGTGAATGGCTCAGTTGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGTAACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATA > CP042583/1642833‑1643393 ||| aaattcagatgatgatACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATg < 1:1812996/282‑1 (MQ=255) 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AAATAGTGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAAAGTTGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAAAGTCAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGACAAAGAATGTGAATTAATCCTTAGTAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAAAGTGAATGGCTCAGTTGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGTAACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATA > CP042583/1642833‑1643393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |