| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,718,682 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,718,682 | 0 | A | T | 99.4% | 775.4 / NA | 330 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (153/175); minor base G (0/2); total (153/177) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,718,683 | 0 | G | C | 99.4% | 772.0 / NA | 330 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (152/175); minor base T (1/1); total (153/177) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,718,684 | 0 | T | A | 98.8% | 770.0 / NA | 330 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (151/173); minor base C (2/2); total (153/177) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
CGTCTCCATCAGGGCGATTACGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAAAGTCAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACAGCGGCGTTAGTCTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACATGTGCTGTGTACCGATATCAGCCGCGACGGCACGCTGGCAGGCTCTAACGTCTCTTTATATGAAGAAGTGTGCGCCAGATATCCGCAGGTGGCATTTCAGT > CP042583/1718403‑1718961 ||| gTCTCCATCAGGGCGATTACGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGata < 1:2803598/288‑1 (MQ=255) ccATCAGGGCGATTACGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTg > 1:3176502/1‑289 (MQ=255) ggCGATTACGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAg > 1:55906/1‑286 (MQ=255) cGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGaa < 1:897923/289‑1 (MQ=255) cGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGaa < 1:1336921/289‑1 (MQ=255) cgcgATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGt > 1:381005/1‑288 (MQ=255) cgcgATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGGGGTCGGCTCCACCGCGGGGAAATCACAGGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTTgggg > 2:1187007/1‑287 (MQ=255) cgcgATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGGAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATAGGGTGAAAGGCTGGTGTGAACGCGTCGGt > 2:100124/1‑288 (MQ=255) gttccgggcaCGACCCGCAGCCGCGATTGAATGATTACGACGCGCAGGGGTCCGAAGTGATGAAACTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGGGCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAATCGCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGGGGGGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCGACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCg < 2:3093666/279‑1 (MQ=255) ttACGTGAACGAACGGCTGCCGCGATTGGAGGATGACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGTTCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGa < 2:2211425/288‑1 (MQ=255) ttACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGa < 1:2342088/288‑1 (MQ=255) aCGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGt > 1:357777/1‑289 (MQ=255) cccGCTGCCGAGATTGCAGGATGACGCCGCGCAGGGTGACGTAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCGGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCt < 2:476918/288‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGAt < 2:238939/289‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGAt < 1:817988/289‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGAt < 1:968230/289‑1 (MQ=255) tGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCg < 2:737381/289‑1 (MQ=255) aGGATTACGCCGCGCAGGGGGCCGAAGTGGTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAGTCCCGCTGATTAATACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTa < 1:857346/288‑1 (MQ=255) cgccgcGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGata < 2:148324/218‑1 (MQ=255) cgcgCAGGGTGCCGAAGTGCTGCCCCTGGGTGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAGCCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCa < 2:2915249/288‑1 (MQ=255) cgcAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAgg > 1:1689322/1‑289 (MQ=255) cgcAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAg > 1:2915249/1‑288 (MQ=255) cAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTg > 2:2177526/1‑216 (MQ=255) ggTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTg > 1:160800/1‑226 (MQ=255) ggTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCGGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTg < 2:160800/226‑1 (MQ=255) aaGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTGTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGt > 1:2943083/1‑289 (MQ=255) tgctgcACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTg < 1:2376090/251‑1 (MQ=255) tgctgcACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCa > 2:3179590/1‑271 (MQ=255) ctgcACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTg > 2:823260/1‑240 (MQ=255) ctgcACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGc > 1:1280533/1‑273 (MQ=255) cTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCg < 2:1913908/289‑1 (MQ=255) ggtggATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCg > 1:2403392/1‑287 (MQ=255) aTCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTg > 1:1033725/1‑236 (MQ=255) acTGACCGGGGGAAATGGTCAGGCTAAACGCAAAAGCCCGCTGAATAAACCCCTGGGCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCaa < 2:1346703/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |