| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 1,725,054 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (186/204); minor base A (1/0); total (187/204) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,725,056 | 0 | C | G | 99.5% | 931.9 / NA | 391 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (186/203); minor base T (1/1); total (187/204) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 391 total aligned reads displayed.
ACATTTGTCATACAACGAATAGGTTTTGTACTTACTATGGAATGGATTGCCGATCCGTCTATCTGGGCCGGGTTAATCACGCTGATTGTGATCGAACTGGTCCTCGGCATTGATAACCTGGTCTTTATTGCCATCCTCGCCGAAAAACTACCGCCGAAGCAGCGTGACCGCGCACGGGTTACCGGGCTGCTGCTGGCAATGTTAATGCGCCTGTTACTGCTGGCGAGTATCTCCTGGCTGGTCACCCTGACTCAACCGCTGTTCAGCTTCCGCAGCTTTACCTTTAGCGCCCGCGACTTAATCATGCTGTTTGGTGGTTTCTTCCTGTTGTTCAAAGCCACGATGGAGCTGAACGAACGGCTGGAAGGGAAAGACAGCAATAATCCCACACAACGCAAAGGTGCGAAGTTCTGGGGCGTGGTGACGCAAATTGTGGTACTGGACGCCATTTTCAGTCTCGACAGTGTGATTACCGCCGTCGGGATGGTCGACCATTTACTGGTCATGATGGCCGCCGTGGTTATCGCTATCAGCCTGATGTTGAT > CP042583/1724781‑1725325 ||| aTTTGTCATACAACGAATAGGTTTTGTACTTACTATGGAATGGATTGCCGATCCGTCTATCTGGGCCGGGTTAATCACGCTGATTGTGATCGAACTGGTCCTCGGCATTGATAACCTGGTCTTTATTGCCATCCTCGCCGAAAAACTACCGCCGAAGCAGCGTGACCGCGCACGGGTTACCGGGCTGCTGCTGGCAATGTTAATGCGCCTGTTACTGCTGGCGTCAATCTCCTGGCTGGTCACCCTGACTCAACCGCTGTTCAGCTTCCGCTCGTTTACCTTTAGCGcc < 1:1547921/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |