Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,742,307 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,742,307 | 0 | A | T | 100.0% | 582.3 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (112/132); total (112/132) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,742,308 | 0 | G | C | 99.6% | 576.3 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (111/132); minor base T (1/0); total (112/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,742,309 | 0 | C | G | 100.0% | 580.5 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (112/132); total (112/132) |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GTATTTCTGCGGGCGATCGCGTGGTGACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGAGCCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTAGCGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGAGCAGC‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGAGTGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCGACCAACTTGTTGCCGAGCGATCTGCCTAACCCGCCGGT > CP042583/1742030‑1742587 ||| tATTTCTGCGGGCGATCGCGTGGTGACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGc < 1:2921150/286‑1 (MQ=255) aTTTCTGCGGGCGATCGCGTGGTGACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGa < 1:1113401/289‑1 (MQ=255) tCTGCGGGCGATCGCGTGGTGACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGt > 1:282313/1‑289 (MQ=255) tGCGGGCGATCGCGTGGTGACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAATTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTgg > 1:2316463/1‑289 (MQ=255) cGGGCGATGACGTGTGGACCGACGGCATGGATCGCCTGACCGAAGGGGGGAAAGTGGAAGTGGTGGAGGGCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAGAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCAATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGACGGAAGTGGa < 2:2032205/288‑1 (MQ=255) gggCGATCGCGTGGTGACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACt > 1:2368521/1‑289 (MQ=255) gATCGCGTGGTGACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATcc > 1:2222161/1‑289 (MQ=255) aTCGCGTGGTGACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATcc < 2:330886/288‑1 (MQ=255) tCGCGTGGTGACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGc > 2:2244406/1‑271 (MQ=255) tCGCGTGGTGACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGa < 1:365067/289‑1 (MQ=255) gtggtgACAGGAGGGATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGGGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCACCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTa < 2:3093418/280‑1 (MQ=255) ggaaaGACGGCTTTAATGGCCTGACCGAAGGGGCGAAATTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCa < 2:2316463/284‑1 (MQ=255) gACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCCCGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAg < 1:2771290/288‑1 (MQ=255) aCGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGGTTATCGGTTATCGCGCCCTGACCGTTTTGGCGCCGCAGGAAGTGGACTAACCGACCATTCAggggggc > 1:2442859/1‑287 (MQ=255) aCGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCACCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCAtt > 1:3093418/1‑280 (MQ=255) cGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAggtggt < 1:2582994/287‑1 (MQ=255) cGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTc < 1:2702137/288‑1 (MQ=255) aggaaTTGATCGCCTGACCGAAGGGGCAAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCAAGAGCGCCACTACGCCGGAAGAGAAGGCCACCAGCCGGGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGGTCCGGATGCAGGTGTTACCCCCGGGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTAGTATGCGTCCTGTGGCCACCAGGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGGTATCGCGCCCTGCCGGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGGCTATCCGACCATGCAGGTGGTc < 2:2305715/284‑1 (MQ=255) cATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGc < 2:1187216/253‑1 (MQ=255) cATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACg > 1:1072514/1‑288 (MQ=255) cATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCCGTTATCGCGCCCTGCCCGTGTCGGCGCTGCCGTACGTTGACTATCCGACCCTTCAGGTTGTCAcc > 2:2474422/1‑287 (MQ=255) aTTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGct < 1:1137829/289‑1 (MQ=255) tGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAgg < 1:19201/277‑1 (MQ=255) aTCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCCGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGGGGACTATCCGACCATTCAGGGGGTCACGctcca > 2:1390513/1‑286 (MQ=255) gCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTg > 1:1542919/1‑253 (MQ=255) gCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTg < 2:1542919/253‑1 (MQ=255) gCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGGGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATcc < 2:1665431/261‑1 (MQ=255) cTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCTTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCCTTCAGGTGGTCACGCCCCACCCAgt > 2:294847/1‑288 (MQ=255) cTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAgg > 1:2392700/1‑289 (MQ=255) aCCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGGGGACTATCCGACCATCCAGGTGGTCACGCCCTACCCAGGTg > 2:1019327/1‑288 (MQ=255) aGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTTGCCACCACGCCGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCTCTGCCGGAAGGGGACTATCCGCCCATTCAGGTGGTCTAGCTCTACCCAGGTGCCAGc > 2:1055010/1‑288 (MQ=255) gCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCgg < 1:1446354/288‑1 (MQ=255) agAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCAAGAGCGCCACTACGCGGGAAGAGAAAGCCACCAGCAGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGa < 2:240428/287‑1 (MQ=255) aaggggaaggggTGGAAGCCCAGGGCGCCACTACCCCGGAAGGGAAACCACCCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCCCGCTCCTGATGCAGGTGTGACCCCCGAGCAGCACGGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCGGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCgg < 2:2658836/284‑1 (MQ=255) ggaagtggTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCAt < 2:2179440/287‑1 (MQ=255) tggAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCg < 1:631009/271‑1 (MQ=255) ggAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGTGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAAGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGGCATGACCTCTGCCg > 1:2279328/1‑289 (MQ=255) gcgcCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCa < 1:2543157/236‑1 (MQ=255) gAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATcc < 2:1839872/205‑1 (MQ=255) gAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGt > 1:2493182/1‑288 (MQ=255) aaGAGAAGGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGtt < 1:2139307/288‑1 (MQ=255) aaaGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACct < 1:1903929/252‑1 (MQ=255) aaaGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGGGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACCCCCGTTCGGGcc > 2:3069723/1‑288 (MQ=255) caccaGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGGGAACGCGCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGt < 2:3172027/289‑1 (MQ=255) acccGCCGCGAAGACGCGAAAAAAGGAACCCGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCTTCGCGCCTGTTTATTATGTGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCTACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTc < 2:2279328/289‑1 (MQ=255) caGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACcg > 1:2020464/1‑256 (MQ=255) cgAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATcc > 2:2934245/1‑185 (MQ=255) cgcgAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGa > 1:1756191/1‑289 (MQ=255) cTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGcgccgc > 2:51583/1‑229 (MQ=255) ggTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGaa < 1:1340091/139‑1 (MQ=255) ggTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAgg < 2:3018088/161‑1 (MQ=255) ggTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAgg > 1:3018088/1‑161 (MQ=255) ggTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACcg > 1:2455010/1‑215 (MQ=255) tgtTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTc < 1:1452453/244‑1 (MQ=255) tgtTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTc > 2:1452453/1‑244 (MQ=255) tgtTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCgtcagt > 1:1660874/1‑284 (MQ=255) aCCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGc > 2:1275704/1‑128 (MQ=255) aCCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGGTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCTCGCCGCTAGACGGCCAGTTCGGGCAGCTGTCTGGCCTGAACCAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGTTGCgtcaggtatc > 2:1796535/1‑280 (MQ=255) aCCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATc > 1:1038786/1‑289 (MQ=255) cGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCCCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGACGTGGACTATCCGACCCTTCAGGTGGTCACGCCCTACCCAGGTGCCATCCCGCATGTCATGACCCCTGCCGTTACCGCGCCGCCAGACCGCCAGTTCGGGCAGATGTCTTGCCCGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTTCGTCCGTTATCACttt > 2:2877370/1‑289 (MQ=255) gAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTg < 1:2981900/289‑1 (MQ=255) agcagcACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGct > 1:1382348/1‑158 (MQ=255) cacaGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTc > 2:1354328/1‑148 (MQ=255) cacaGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCg < 1:1730355/268‑1 (MQ=255) cggtcgggcCGGCGCCG‑CTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCGCGCGGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCa < 2:2558708/283‑1 (MQ=255) caGGGGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTCTGGGGCCTGTGGCCACCACGCTGCTGCTGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCa < 2:1313533/289‑1 (MQ=255) ggcccgtcgcgccTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTaa < 1:1585940/280‑1 (MQ=255) ccgtcgcgccTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCCGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCCGTTCCAGCTAACAt > 1:2073508/7‑289 (MQ=255) ccgtcgcgccTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTc > 1:762834/7‑218 (MQ=255) ccgtcgcgccTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTc < 2:762834/212‑1 (MQ=255) ccgtcgcgccTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGGTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATCCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGAGGTCATTACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACCCCAGTTCTGGCAGATGTCTGTCCTGAAACAGATCTCCCCG‑CCATGTTACGTCGGTGCGTCAGGTAACACTTTGCAGTTCCAGCTAACAt > 2:380799/7‑289 (MQ=255) cGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGa < 2:625989/95‑1 (MQ=255) cGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGc > 1:3136366/1‑289 (MQ=255) tgtatttggcaccaacGCGGCTGGTGGTGGCGGTCTTACTCGACGTGATGACCGGTTATCGCGCCCGGCCCTTTTCGGCGCTGCCAGAAGTGGACTAACGGACCCTTCAGGTGGTCACTCTCTACCTAGGTGCCAGCCCAGATGTCATGACCCCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGTAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑AAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGc < 2:2358013/274‑1 (MQ=255) gTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTg < 1:1614087/251‑1 (MQ=255) gTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTg < 2:1094073/251‑1 (MQ=255) ccTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAgg > 1:1004890/1‑289 (MQ=255) accacGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATgtcgtcgcaa < 2:839506/210‑10 (MQ=255) accacGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATgtcgtcgcaa > 1:839506/1‑201 (MQ=255) ggCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCg > 1:3188583/1‑289 (MQ=255) ggCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCg > 1:1812388/1‑289 (MQ=255) cGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGACGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTTCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTACAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATG‑GCGTCGCAAAGTTCCCGCGGTGCGTCAGTTATCACGTTGCAGTTCCCGCTAACa > 2:1588485/1‑236 (MQ=255) cGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGAc < 2:916259/73‑1 (MQ=255) cGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCGa > 1:94658/1‑288 (MQ=255) gATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCGAc < 1:3069723/288‑1 (MQ=255) gATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCGAc < 1:600115/288‑1 (MQ=255) tCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCg > 1:569208/1‑249 (MQ=255) tCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTg < 1:787548/263‑1 (MQ=255) cTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACAGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTTCGTCAGTTATCACTTTGCACTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGACGTGCAGGCCCCGATTAACGCTGCACCCAACtcgt > 2:1938848/1‑289 (MQ=255) gCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGAATAACGCCGCGAACAACttggtg > 2:600115/1‑288 (MQ=255) cGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAg < 2:1712176/148‑1 (MQ=255) cGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGcc > 1:1201596/1‑259 (MQ=255) ttATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGACCGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCGACCAACTTGTTGCCGAGCGa < 1:380799/289‑1 (MQ=255) ttATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCGACCAACTTGTTGCCGAGCGa < 2:1812388/289‑1 (MQ=255) ttATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCGACCAACTTGTTGCCGAGCGa < 1:294847/289‑1 (MQ=255) ggTTATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGAcc < 2:245103/99‑1 (MQ=255) tATCGCGCCCTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTg < 1:2878039/195‑1 (MQ=255) cccTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCGACCAACTTGTTGCCGAGCGATCTGCCTAACccgc < 2:2392700/288‑1 (MQ=255) cccTGCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCGACCAACTTGTTGCCGAGCGATCTGCCTAACccgc > 2:2150124/1‑288 (MQ=255) ggCCCGTTTCGGCGCTGCCGGAAGGGGCCCATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTGCCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCGGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGTCGTCG‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGTCAGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCGCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCGACCAACTTGTTGCCGAGCGATCTGCCTAACCCGCCGGt < 2:94658/288‑1 (MQ=255) ||| GTATTTCTGCGGGCGATCGCGTGGTGACAGACGGCATTGATCGCCTGACCGAAGGGGCGAAAGTGGAAGTGGTGGAAGCCCAGAGCGCCACTACTCCGGAAGAGAAAGCCACCAGCCGCGAATACGCGAAAAAAGGAGCACGCTCCTGATGCAGGTGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGAGCCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACCACGCTGCTGATGGTGGCGATCTTACTCGCCGGGATTATCGGTTATCGCGCCCTGCCCGTTAGCGCGCTGCCGGAAGTGGACTATCCGACCATTCAGGTGGTCACGCTCTACCCAGGTGCCAGCCCGGATGTCATGACCTCTGCCGTTACCGCGCCGCTAGAACGCCAGTTCGGGCAGATGTCTGGCCTGAAACAGATGAGCAGC‑CAAAGTTCCGGCGGTGCGAGTGTTATCACTTTGCAGTTCCAGCTAACATTACCGCTCGATGTCGCCGAGCAGGAAGTGCAGGCCGCGATTAACGCTGCGACCAACTTGTTGCCGAGCGATCTGCCTAACCCGCCGGT > CP042583/1742030‑1742587 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |