| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,753,697 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,753,697 | 0 | A | T | 99.7% | 847.4 / NA | 355 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (199/154); total (201/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,753,698 | 0 | G | C | 99.4% | 841.3 / NA | 355 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base C (199/154); total (201/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,753,699 | 0 | C | G | 99.7% | 852.3 / NA | 355 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (200/154); minor base T (1/0); total (201/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
ACTATGCTCCCGTAAATTCCGATTGGATATCGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGAGCTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGAGCTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGAGCCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCAGCGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGTTCTTCCCGTTACTGCTGGCC > CP042583/1753421‑1753975 ||| aCTATGCTCCCGTAAATTCCGATTGGATATCGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGAtgt < 2:826470/289‑1 (MQ=255) tATGCTCCCGTAAATTCCGATTGGATATCGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGAtgttt > 2:1338920/1‑289 (MQ=255) tCCCGTAAATTCCGATTGGATATCGGCTATGGATTGTCCTGGCACGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTCGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTATAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGAAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGACGTTCATGATGTTTGTAGa > 2:1537854/1‑289 (MQ=255) cccGTAAATTCCGATTGGATATCGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGaa < 1:1228573/289‑1 (MQ=255) tatCGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGcgcg < 2:3169715/288‑1 (MQ=255) cGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACTTTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGt > 2:945800/1‑289 (MQ=255) tCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGcgcg > 2:1496204/1‑272 (MQ=255) tCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGcgcg < 1:1496204/272‑1 (MQ=255) tCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATAATAATCCTGGTAGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGTATGCTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCACTGGTATTTAAAAGGTATTATTACGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCCGTCTTGAAGGAATTCAAAGATGACAAACACAGCCAAGCTGTGGTTCATGATGTTGGTTGAATGGTTTATCTGGGTCGCGTGGCTGGTGCTAttgtg > 2:2942364/1‑289 (MQ=255) gCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAttgtgtttgt > 2:464504/1‑289 (MQ=255) ccGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAttgtggttgtgg < 1:1338920/289‑1 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATgg > 1:232750/1‑247 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGcgcg < 2:316079/262‑1 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAttgtggtt < 1:1756933/282‑1 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAttgtggtt > 2:1756933/1‑282 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAtt > 2:2212703/1‑276 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTa > 2:2652973/1‑289 (MQ=255) ccTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTa > 2:2975657/1‑289 (MQ=255) cTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATgg < 1:2252524/225‑1 (MQ=255) ggTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTgg > 1:2553988/1‑232 (MQ=255) gTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCAttg < 1:3164682/252‑1 (MQ=255) gTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGgag > 1:2836868/1‑289 (MQ=255) gTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGgag > 2:1915654/1‑289 (MQ=255) gTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGGGCCGgag > 2:247823/1‑289 (MQ=255) gggCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGc < 1:25832/289‑1 (MQ=255) gCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCt < 1:2889697/288‑1 (MQ=255) gCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCt < 1:1034899/288‑1 (MQ=255) aGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGa > 2:1158153/1‑205 (MQ=255) ttttGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTa > 2:438851/1‑288 (MQ=255) tttttCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTgcg > 2:1449655/1‑289 (MQ=255) gATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGtt < 1:2652973/289‑1 (MQ=255) gATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGtt < 1:418390/289‑1 (MQ=255) gATTAATCAGAAAAAATGGTAACGCGGGAAAGTTTTCACCGAAAAGGTATTTAAAAGGGATTATTAAGTGGTGTTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGtt < 1:1412935/289‑1 (MQ=255) aTTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTa > 2:1388741/1‑204 (MQ=255) tttatcaGAAAAAAGGTTAACGCGGTAAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGGGGTATTGTCATCGAGTACCTTCCATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGCATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCAAATTCTGGtt < 2:2590156/284‑1 (MQ=255) tcaGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTTTGGTTGGCTcc > 2:1569982/1‑289 (MQ=255) gTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTctc > 1:2706321/1‑287 (MQ=255) gTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTctc > 1:470706/1‑287 (MQ=255) aCCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGa < 1:2008993/122‑1 (MQ=255) aCCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGa > 2:2008993/1‑122 (MQ=255) cAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTgtcgc < 1:2916787/237‑5 (MQ=255) aaaGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCt < 1:2975657/288‑1 (MQ=255) aTTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAGTTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTa < 1:1285315/289‑1 (MQ=255) attattAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGc > 2:229990/1‑289 (MQ=255) aGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcgcg < 1:2800172/289‑1 (MQ=255) aGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcgc > 2:2800172/1‑288 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATgg < 2:2346435/95‑1 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATgg > 2:2166605/1‑95 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGtt > 1:1187065/1‑221 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGtt < 2:1187065/221‑1 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTctcgg > 1:52644/1‑245 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTctcgg < 2:52644/249‑5 (MQ=255) tGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcgc > 1:376733/1‑286 (MQ=255) ggTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcgcgc < 1:1532859/287‑1 (MQ=255) gTATTGTCATCGCGTCACTTACATTAGCTGTCAAGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTGGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCgctg < 2:2876520/288‑1 (MQ=255) gTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCgct > 1:1904057/1‑287 (MQ=255) tATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCgct > 1:1982628/1‑286 (MQ=255) ttGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGcgcg > 2:208318/1‑105 (MQ=255) ttGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGa > 2:2617105/1‑289 (MQ=255) ttGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGa > 1:1552394/1‑289 (MQ=255) aTCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcgcg < 1:689707/277‑1 (MQ=255) aTCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATT‑AAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGt > 1:2062779/1‑209 (MQ=255) gcgTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTggtcg < 1:142978/163‑4 (MQ=255) gcgTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTc > 2:735019/1‑289 (MQ=255) gTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCgctg > 1:958284/1‑275 (MQ=255) gTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCg < 1:229990/288‑1 (MQ=255) tACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCgctg > 1:1075565/1‑274 (MQ=255) tACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCgctg < 2:1075565/274‑1 (MQ=255) ccTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTgc > 1:3151495/1‑289 (MQ=255) ccTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAAATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGtt < 2:393373/203‑1 (MQ=255) cTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGGTGAAAACAACGGCAAGGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTgcg < 2:1982628/289‑1 (MQ=255) cTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTgcg < 1:2280636/289‑1 (MQ=255) cTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTgcg < 2:2276537/289‑1 (MQ=255) aCATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCa > 2:573643/1‑288 (MQ=255) aaTTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTGCAGGAGGTTTGTTGAATGGGTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCaa < 1:1374794/287‑1 (MQ=255) aCCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTAGTGATGTTCGCCGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGa > 1:2493957/1‑288 (MQ=255) ccTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGc < 2:2721031/142‑1 (MQ=255) ccTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGAcc > 1:2122737/1‑289 (MQ=255) ccTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGAcc > 1:97410/1‑289 (MQ=255) cTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAAt > 2:2542929/1‑64 (MQ=255) cTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTa > 1:2219034/1‑240 (MQ=255) gTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACt > 1:617206/1‑289 (MQ=255) tCATGAAGGAATTAACAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTACATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTGGTGCCCTTGTGGTTGTGGATAAGTAAACGCGGCTTTAGTGTCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACGGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTATGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTCTTCTCGGCGCATACAGTGATGGCGGTCTTGATGTTCGTGGACACGATGCTGAGGTAGTTCGCTGCGCAACAGACCACtt > 2:1650256/1‑289 (MQ=255) tCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTtgtg > 2:1041600/1‑87 (MQ=255) tGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTg < 1:2747007/289‑1 (MQ=255) ggAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcg > 1:816012/1‑246 (MQ=255) aTTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGCTGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCTTGTACCGCCATTTCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCGATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCGGCTCCACGGACCACTTTTGCCGGGtt > 2:2413231/1‑289 (MQ=255) aTTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTggtcgtat > 2:621230/1‑131 (MQ=255) aaaaGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGttctt < 2:966131/289‑1 (MQ=255) aaaGATGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCgctg > 1:1815060/1‑244 (MQ=255) aTGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTggtcg > 2:1320880/1‑123 (MQ=255) aTGAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGTTCTTCCCGt < 1:172971/289‑1 (MQ=255) gAAAACAACAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGTCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCACCATACCACTTTTGCCGGGTGCTTCCCGtt > 2:2246735/1‑288 (MQ=255) aacaacAGCAGAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGTTCTTCCCGTTActg < 1:2413231/289‑1 (MQ=255) aacaacAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGtt < 1:2633728/222‑1 (MQ=255) aacaacAGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGTTCTTCCCGTTActg < 1:2141404/289‑1 (MQ=255) caGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGgcg > 2:1839642/1‑225 (MQ=255) aGCAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGttct < 1:219570/272‑1 (MQ=255) cAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTg < 1:1121012/155‑1 (MQ=255) cAAAGCTGTCGTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGTCGTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGTCGCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCTCGGCGCAAAAAGTGCttg < 1:2452838/201‑3 (MQ=255) ||| ACTATGCTCCCGTAAATTCCGATTGGATATCGGCTATGGATTGTCCTGGCCCGCCTTTTGCGGGCAATCATAATCCTGGTCGTTACGGGCGAGTTTTTCCATCTTTTGGATGTTTTTTCAGCGTTTTCTGTTGGCTCGATTCATCAGAAAAAATGTTAGCGCGGTCAAGTTTTCACCGCAAAGGTATTTAAAAGGTATTATTAAGTGGTATTGTCATCGCGTACCTTACATTACCTGTCATGAAGGAATTAAAAGATGAAAACAACAGCAAAGCTGAGCTTCATGATGTTTGTTGAATGGTTTATCTGGGGCGCGTGGTTTGTGCCATTGTGGTTGTGGTTAAGTAAAAGCGGTTTTAGTGCCGGAGAAATTGGCTGGAGCTATGCCTGTACCGCCATTGCGGCGATCCTGAGCCCAATTCTGGTTGGCTCCATCACTGACCGCTTTTTCAGCGCGCAAAAAGTGCTGGCGGTATTGATGTTCGCAGGCGCGCTGCTGATGTATTTCGCTGCGCAACAGACCACTTTTGCCGGGTTCTTCCCGTTACTGCTGGCC > CP042583/1753421‑1753975 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |