Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 517,872 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 517,873 | 0 | C | G | 99.5% | 908.0 / NA | 383 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base G (203/178); total (203/180) | |||||||||||
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* | CP042583 | 517,874 | 0 | T | A | 100.0% | 913.7 / NA | 383 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (203/180); total (203/180) |
Only 100 of 383 total aligned reads displayed.
ACCGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAAACTGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATGCTGATCTGAATTTCAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCCAGGCAGGAACGTCCGCCAGCTCC > CP042583/517597‑518150 ||| cggcAGGCGGCGATGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCGAGATCTGAATTTCa < 2:2182733/286‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |