Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,778,578 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,778,578 | 0 | A | T | 99.1% | 829.2 / NA | 347 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (170/174); minor base G (3/0); total (173/174) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,778,579 | 0 | G | C | 99.7% | 826.2 / NA | 347 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (171/174); minor base T (1/0); total (173/174) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,778,580 | 0 | T | A | 99.7% | 828.1 / NA | 347 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (171/174); minor base G (1/0); total (173/174) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 347 total aligned reads displayed.
GCAGAGGGGGAGTTCTGCAATGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGAGCCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGAGTACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGAGTGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTAGTCCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAACACGACTTACCAGCGGGGAAAGCGATGAT > CP042583/1778302‑1778858 ||| agagGGGGAGTTCTGCAATGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGa < 2:1508090/288‑1 (MQ=255) gggAGTTCTGCAATGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCAt < 1:2869836/288‑1 (MQ=255) gggAGTTCTGCAATGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCAt < 1:1980707/288‑1 (MQ=255) ggAGTTCTGCAATGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCTTGCGGACGCTCTGATTTGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAATTGTCTCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAATGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTTGGAGTCAGGCTATGAGGACGCAtt < 1:1727868/288‑1 (MQ=255) ggAGTTCTGCAATGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCAtt < 2:2138311/288‑1 (MQ=255) gAGTTCTGCAATGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCAttt < 2:512680/288‑1 (MQ=255) ttCGGCAATGCGCCAGGTTGCCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTc < 2:1291856/288‑1 (MQ=255) cTGCAATGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGGAAATCCGCTACACTTGGGCAACTTATGGGAAAGCGATCTAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACCCATTTGGCtat > 2:2835397/1‑289 (MQ=255) cTGCAATGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCAGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTACATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACACAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGAAGCAttgtgttat > 2:1653860/1‑282 (MQ=255) gCAATGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCAtt < 1:2160349/280‑1 (MQ=255) aaTGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAAcc < 2:1594091/289‑1 (MQ=255) aaTGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAAcc < 1:1536302/289‑1 (MQ=255) cgcAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACg > 1:1046768/1‑270 (MQ=255) cgcAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCta < 1:1890937/280‑1 (MQ=255) cgcAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTggg > 2:1560415/1‑289 (MQ=255) cgcAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTggg > 1:612143/1‑289 (MQ=255) cgcAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTggg > 2:2260024/1‑289 (MQ=255) cgcAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCAGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTggg > 1:1287247/1‑289 (MQ=255) aaGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCAtt > 1:2417591/1‑271 (MQ=255) gCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCg > 1:473848/1‑288 (MQ=255) gCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCg > 1:3126223/1‑288 (MQ=255) gCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCg > 1:441572/1‑288 (MQ=255) gCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCGATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCg > 1:2938716/1‑288 (MQ=255) cAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGc < 2:483740/288‑1 (MQ=255) tgcGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGt < 2:3069142/265‑1 (MQ=255) cGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGttttcacc < 1:1653860/288‑6 (MQ=255) tctGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGt > 1:2070653/1‑289 (MQ=255) tctGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGCGAAGGCAAATCCGCTAACGTTGGGCTACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGGGGACTCATTTGTCTATTACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTCAGttgtcaccgg > 2:3019414/1‑279 (MQ=255) ctGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGtt < 2:718372/289‑1 (MQ=255) aTTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGttgtcaacctgtttta > 2:1795088/1‑275 (MQ=255) tGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAAc < 1:2769442/289‑1 (MQ=255) tGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAAc < 1:2470130/289‑1 (MQ=255) tGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTAc < 1:1739776/289‑1 (MQ=255) tGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTAc > 1:1001620/1‑289 (MQ=255) cccACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACaa > 1:712749/1‑289 (MQ=255) aGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGt > 1:2793855/1‑232 (MQ=255) aCAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGt < 2:1703485/225‑1 (MQ=255) cgcAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGttttcacc > 2:2736084/1‑237 (MQ=255) cgcAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTcc > 1:1175892/1‑289 (MQ=255) gcAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCg < 2:441572/289‑1 (MQ=255) gcAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCg < 1:2735620/289‑1 (MQ=255) cAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCAt > 2:3053944/1‑194 (MQ=255) cAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCta > 2:190827/1‑201 (MQ=255) cAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGt > 1:489670/1‑289 (MQ=255) tGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAAc < 1:1444940/247‑1 (MQ=255) caTTTGCACCGCTTTTGTCCGATTCAGAAATTATCACGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGGGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTAGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTtctc < 2:2938716/287‑1 (MQ=255) caGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTggg > 2:2405145/1‑197 (MQ=255) caGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTggg < 1:2405145/197‑1 (MQ=255) gCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAAc < 1:1092933/235‑1 (MQ=255) ttttGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGt < 1:1202625/289‑1 (MQ=255) ttttGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGt < 1:2260024/289‑1 (MQ=255) ttttGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCCGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGt < 2:2070653/289‑1 (MQ=255) cGATTACAAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGTCGCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCGATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTTAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACATTGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAAt < 2:2115133/289‑1 (MQ=255) cagttgtcgcgccgcACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGTGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGAt < 1:134026/279‑1 (MQ=255) ttgtcgcgccgcACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATgtgt < 2:3126223/283‑1 (MQ=255) gcgccgcACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGt < 1:535109/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGCTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTtgagtgag < 1:1572814/289‑1 (MQ=255) tgctgcTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAAc < 1:306225/179‑1 (MQ=255) tgctgcTCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTAcc > 1:797351/1‑234 (MQ=255) tgctCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGtt > 1:1934472/1‑289 (MQ=255) tgctCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACATGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGTTGTGTTTGATTTGAGTGAGGAGtt > 2:700612/1‑289 (MQ=255) ctCACACCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTaa > 1:629372/1‑289 (MQ=255) acCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGa < 1:1306842/108‑1 (MQ=255) acCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCta > 2:879952/1‑120 (MQ=255) acCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGttttcacc < 2:619483/159‑6 (MQ=255) acCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAAc > 1:2606594/1‑169 (MQ=255) acCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCg > 2:2415872/1‑207 (MQ=255) acCTGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTg < 2:1139083/227‑1 (MQ=255) tGACGAGTCAACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCa > 1:570698/1‑286 (MQ=255) acgagtcaaCCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAg > 2:606369/9‑213 (MQ=255) tcaaCCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAGGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGGGAGGCGTTAAGCGCACCTGGCGGCa > 2:2644900/4‑289 (MQ=255) tcaaCCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCa > 1:972348/4‑178 (MQ=255) aaCCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCAtt > 1:2986678/2‑289 (MQ=255) cggTAACCGCCAGACTTGCTGGGAAGGTAAATCCGTTTCCGGTGGGCACGTTATGGGAATGCGATCCAAAGGTTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTGTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGTGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTc < 2:1955068/287‑1 (MQ=255) aCAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACAACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCtt > 2:9349/1‑194 (MQ=255) aCAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACAACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCtt < 1:9349/194‑1 (MQ=255) ccTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGt > 2:2524823/1‑202 (MQ=255) ccTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGt < 1:2524823/202‑1 (MQ=255) ccTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTtgagt > 2:1112195/1‑250 (MQ=255) ccTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCt < 2:1083045/268‑1 (MQ=255) aCTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGa < 2:1004460/230‑1 (MQ=255) aCTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAAcaca > 2:541009/1‑288 (MQ=255) gCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAgcg < 2:1242977/255‑1 (MQ=255) gCTGAGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAgcg > 1:1242977/1‑255 (MQ=255) gTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAAt > 2:2629107/1‑137 (MQ=255) tAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGtt < 2:2547372/222‑1 (MQ=255) ttGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCa > 1:1838283/1‑289 (MQ=255) tGCGATGCAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAACACGACTTACCAGCggg > 1:755022/1‑289 (MQ=255) tGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTtgagtgag < 2:789765/203‑1 (MQ=255) tGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTtgagtg < 1:880190/201‑1 (MQ=255) tGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAACACGACTTACCAGCggg > 2:221941/1‑289 (MQ=255) tGCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCAGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCa > 2:2781205/1‑232 (MQ=255) gCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCg < 2:1336738/132‑1 (MQ=255) gCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTc > 2:394479/1‑229 (MQ=255) gCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTc < 1:394479/229‑1 (MQ=255) gCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAACACGACTTACCAGc < 1:2633674/285‑1 (MQ=255) gCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAACACGACTTACCAGCgggg < 2:1838283/289‑1 (MQ=255) gCGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGGGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGCCATTTTCCATTACAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGGCCGTTAACACAACGACTTACCAGAgggg > 2:1435299/1‑289 (MQ=255) cGATACAAAGGCTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGGGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAACACGACTTACCAGCgggg < 2:1217649/288‑1 (MQ=255) cTGGGAGTCAGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAACACGACTTACCAGCGGGGAAAGCgatgat < 2:755022/288‑1 (MQ=255) ||| GCAGAGGGGGAGTTCTGCAATGCGCAAGATGAGCCAATTGACCTGCCTGCGGACGCTCTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGAGCCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGAGTACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGAGTGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTAGTCCCGGTTTTAACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAACACGACTTACCAGCGGGGAAAGCGATGAT > CP042583/1778302‑1778858 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |