Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,781,324 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,781,324 | 0 | A | T | 99.3% | 725.1 / NA | 304 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (146/156); minor base G (1/1); total (147/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,781,325 | 0 | G | C | 100.0% | 728.8 / NA | 304 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (147/157); total (147/157) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,781,326 | 0 | T | A | 100.0% | 732.7 / NA | 304 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (147/157); total (147/157) |
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
ACTATTTTGCCCAACTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCAGCCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTAGTGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑AGCCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATT > CP042583/1781046‑1781602 ||| ttttGCCCAACTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCT‑ACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGccc < 1:1521293/289‑1 (MQ=255) ccGGGGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCa < 2:3045914/289‑1 (MQ=255) ggCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGt < 1:2502756/289‑1 (MQ=255) ggCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGt < 1:652475/289‑1 (MQ=255) aTGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTAAAGGTTGTTATCTCACACCCTACATTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCGGGATACCTTGCAGGAATGCATGCCCCGGTATGGCACAACTGGTGTCGGCACTggtg > 2:2046571/1‑287 (MQ=255) cgcgtCAATCGTAACGGGGAAGCCTTAATGGCCGGCTGGATTGGATGGGGGTTGCAGCAAAATAATGGGGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCGTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGc < 2:1613810/284‑1 (MQ=255) gTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGc < 1:553650/289‑1 (MQ=255) aGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCgg > 1:2752526/1‑289 (MQ=255) ttATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCt < 1:265117/289‑1 (MQ=255) cGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTa > 1:1223153/1‑289 (MQ=255) cTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTAt > 2:320308/1‑288 (MQ=255) tggatGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGc > 1:1950164/1‑235 (MQ=255) gggcagtGCAGCAAAGTAATGGCGACGTGTTAGTGGTGTGGGGTGGCTGGCACGCTCCGGGACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAGCAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGtt < 2:2624203/282‑1 (MQ=255) gCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTgc > 2:2454401/1‑289 (MQ=255) gATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTgcg < 1:2454401/288‑1 (MQ=255) aTGCAGGAAAATAAGGGGTAGGGGTTAGTGGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGGAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTgcgc < 2:1741821/288‑1 (MQ=255) tGCAGCAAAATAATGGCGAGGGTTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGcc < 2:54540/288‑1 (MQ=255) aaaaTAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGcaca < 1:2666194/288‑1 (MQ=255) atGGCGACGTGTTATTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCCCACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGcc < 1:829768/289‑1 (MQ=255) gCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCCAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAATGCCGGTGAACAACTGCTAAAACCTAGCCTTACCCGTTTGCTCCAGCCCAAAGTGcctg > 2:42222/1‑286 (MQ=255) tCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGatat > 1:2786544/1‑289 (MQ=255) tGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACGGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATg > 1:437124/1‑288 (MQ=255) tGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACcg > 2:1077704/1‑280 (MQ=255) tGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATg > 1:1774965/1‑288 (MQ=255) cACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCAt > 2:3089124/1‑288 (MQ=255) tCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAAtgcctgc > 2:2009031/1‑153 (MQ=255) tCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAAc < 1:1362298/169‑1 (MQ=255) ccGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATg < 1:261087/289‑1 (MQ=255) ggCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCt < 2:481315/276‑1 (MQ=255) gCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAAtgc > 2:2130704/1‑139 (MQ=255) gCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAAtgc < 1:2130704/139‑1 (MQ=255) gCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGc < 2:2824848/177‑1 (MQ=255) gCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGTCTGCCGCCCATCTGCCTGCGATGgcc > 2:1705042/1‑287 (MQ=255) ggCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCCCATCTGCATGCGATGGCGCTGGcagcgtt > 2:1364189/1‑284 (MQ=255) ggCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCCCATCTGAATGCGATGCCGCTGGCCGAGtt > 2:1930457/1‑289 (MQ=255) gcgAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg < 1:1269421/289‑1 (MQ=255) gcgAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg < 1:147390/289‑1 (MQ=255) gcgAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg < 1:1588880/289‑1 (MQ=255) cgAATGCCCTCAGAAAATTAGCAAGCCGGAATTGCCCTGGCTGGCAGACGCCGTTACACGTTGTTATCTCACACCCGACAGTGAGAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGGCTGCACCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGGGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTAACGCGGATATGGCTGCCGCTGATTTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg < 2:1535408/288‑1 (MQ=255) aaTGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCgg > 1:1091345/1‑289 (MQ=255) ccTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATa < 1:51833/289‑1 (MQ=255) cTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTg > 1:3080843/1‑278 (MQ=255) cAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATacac < 1:1628567/289‑1 (MQ=255) aaaTTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACTGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTa < 1:2069736/287‑1 (MQ=255) aTTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCa > 1:2229172/1‑152 (MQ=255) tAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGAt > 2:776762/1‑252 (MQ=255) aaGCCAAAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGTTGTTTACCTCACACCCTAAAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCa < 2:1971654/289‑1 (MQ=255) aGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGc > 1:2162672/1‑287 (MQ=255) aGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCactg > 1:707568/1‑287 (MQ=255) gccctcgcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGTCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGActggctg < 1:1705323/282‑1 (MQ=255) gccctcgcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGActggctg < 1:91201/282‑1 (MQ=255) ccctcgcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGcc < 1:2040700/188‑1 (MQ=255) ccctcgcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg > 1:1299700/7‑254 (MQ=255) ccctcgcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGActggctgg > 2:2659851/7‑289 (MQ=255) ctcgcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCactgac > 2:1487642/5‑280 (MQ=255) cgcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGc < 2:724272/287‑1 (MQ=255) gcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTa > 2:613137/2‑197 (MQ=255) gCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg > 1:3159413/1‑239 (MQ=255) ttACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTAcc < 2:872602/185‑1 (MQ=255) gttgttATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg > 2:1638187/1‑229 (MQ=255) ttATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTa > 2:1247832/1‑238 (MQ=255) cacCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTAcc > 2:2161008/1‑167 (MQ=255) cacCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCa < 2:2215759/240‑1 (MQ=255) tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATc > 1:3105471/1‑123 (MQ=255) tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTg < 1:1809804/175‑1 (MQ=255) tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCAt > 1:75860/1‑183 (MQ=255) tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg < 1:1652251/212‑1 (MQ=255) tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGCCTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAAcgcg > 2:226568/1‑288 (MQ=255) tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGc < 2:1289875/251‑1 (MQ=255) tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTaaa > 1:1388800/1‑273 (MQ=255) tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTaaa < 2:1388800/273‑1 (MQ=255) tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAAcgcg > 2:1856663/1‑288 (MQ=255) tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACCACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑CCGCTGATAAAAGACGCCCTGAAcccc > 2:689715/1‑285 (MQ=255) tGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCACGC‑TCGCTGATTAAAGAAACCCTGAACGCCGCGtt > 2:2910054/1‑288 (MQ=255) gAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCg < 1:1930457/285‑1 (MQ=255) aaaaGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGcc > 2:2801932/1‑289 (MQ=255) aaaGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGcc > 1:3041655/1‑144 (MQ=255) aaaGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGTGGTCACACACTACCGGTACGCACCGACTGGCTGGATGCCATCGCAGGCTCGCCT‑ATTAAAGAAGCCCTGAActgttccttata > 2:2506253/1‑277 (MQ=255) aaaGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGa < 1:2849770/240‑1 (MQ=255) aaaGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCg > 1:2528054/1‑289 (MQ=255) aGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCg < 1:1000442/182‑1 (MQ=255) aGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTg > 1:3007079/1‑289 (MQ=255) gcgcCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGCTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACCCGCCGTTGcctggg > 1:2320702/1‑285 (MQ=255) cgcCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTgcgc < 2:1025889/126‑1 (MQ=255) gcCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTgg < 1:105872/287‑1 (MQ=255) cTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGActggct < 2:2559092/230‑1 (MQ=255) cTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGActggct > 1:2559092/1‑230 (MQ=255) gATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATc < 1:2001642/289‑1 (MQ=255) tgtgCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATcg < 2:3007079/288‑1 (MQ=255) tgtgCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATcg < 1:1867653/288‑1 (MQ=255) gtggcgggCAGGATACCTTTCAGGAAGGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATcg < 2:2752526/282‑1 (MQ=255) cTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCg < 2:1175837/76‑1 (MQ=255) cTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGt > 2:519219/1‑268 (MQ=255) tGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCgcggcg < 1:1173911/288‑1 (MQ=255) gCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGc > 2:1796947/1‑71 (MQ=255) aGGTTACCTTTCAGGAATGCCGACCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 2:3148700/289‑1 (MQ=255) aGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCAGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 2:1301870/289‑1 (MQ=255) ggATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 2:2326690/288‑1 (MQ=255) aTACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 1:226568/286‑1 (MQ=255) aTACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑TCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 1:404785/286‑1 (MQ=255) ||| ACTATTTTGCCCAACTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCAGCCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTAGTGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGC‑AGCCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATT > CP042583/1781046‑1781602 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |