Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 522,121 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (189/158); total (189/158) | |||||||||||
* | CP042583 | 522,123 | 0 | T | A | 99.4% | 823.8 / NA | 347 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base A (187/158); total (189/158) | |||||||||||
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Only 100 of 347 total aligned reads displayed.
GCCGGGTTAACTGCGATACCGTGGTCTGTGACCAGAATATCGACACTGGAGCCTGGGGTGATGCAGGTCAGTACGTTATCCACCAGAGTCGGAATACGACCGCGTACCAGCGGCGCGACGATGATGGAAAGCGCAGAGGCAATCGCGGTATCGCAGTGACCACCGGAAGCACCACGCAGTACGCCGTCAGAGCCGGTCAGCACGTTAACGTTGAACTGGGTGTCAATTTCCAGCGCGCTCAGTACCACCACGTCGAGACGATCAACGCTTGCGCCTTTGCTACCCCAGTTAGCGTACTGGTTGGCGCTGATTTCGATGTGATTGGGGTTACGGGCCAGGCTTTGCGCAGCATGGCTGTCAAAGCTCTGCACATCCAGCAGTTTGCGGATCAGACCTTTTTCGTGCAGGTCAACCATCGTCGCGGTAATACCGCCAAGGGCGAAGTCGGCGCGAATATCGCGGCTACGCATTTTGTCTTCCAGGAAACGGGTTACCGCCAGGCTTGCGCCGCCGGTGCCGGTTTGCATGGAGAAACCTTCTTTGAAGTAGCCAGAGTTGAC > CP042583/521843‑522402 ||| cTGCGATACCGTGGTCTGTGACCAGAATATCGACACTGGAGCCTGGGGTGATGCAGGTCAGTACGTTATCCACCAGAGTCGGAATACGACCGCGTACCAGCGGCGCGACGATGATGGAAAGCGCAGAGGCAATCGCGGTATCGCAGTGACCACCGGAAGCACCACGCAGTACGCCGTCAGAGCCGGTCAGCACGTTAACGTTGAACTGGGTGTCAATTTCCAGCGCGCTCAGTACCACCACGTCGAGACGATCAACCGATGCGCCTTTCGAACCCCAGTTAGCGTa < 1:126073/286‑1 (MQ=255) 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GCCGGGTTAACTGCGATACCGTGGTCTGTGACCAGAATATCGACACTGGAGCCTGGGGTGATGCAGGTCAGTACGTTATCCACCAGAGTCGGAATACGACCGCGTACCAGCGGCGCGACGATGATGGAAAGCGCAGAGGCAATCGCGGTATCGCAGTGACCACCGGAAGCACCACGCAGTACGCCGTCAGAGCCGGTCAGCACGTTAACGTTGAACTGGGTGTCAATTTCCAGCGCGCTCAGTACCACCACGTCGAGACGATCAACGCTTGCGCCTTTGCTACCCCAGTTAGCGTACTGGTTGGCGCTGATTTCGATGTGATTGGGGTTACGGGCCAGGCTTTGCGCAGCATGGCTGTCAAAGCTCTGCACATCCAGCAGTTTGCGGATCAGACCTTTTTCGTGCAGGTCAACCATCGTCGCGGTAATACCGCCAAGGGCGAAGTCGGCGCGAATATCGCGGCTACGCATTTTGTCTTCCAGGAAACGGGTTACCGCCAGGCTTGCGCCGCCGGTGCCGGTTTGCATGGAGAAACCTTCTTTGAAGTAGCCAGAGTTGAC > CP042583/521843‑522402 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |