| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,834,177 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,834,177 | 0 | A | T | 99.7% | 839.6 / NA | 347 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (166/180); total (167/180) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,834,178 | 0 | C | G | 100.0% | 834.4 / NA | 347 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (167/180); total (167/180) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,834,179 | 0 | T | A | 99.7% | 838.5 / NA | 347 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base A (166/179); total (167/180) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 347 total aligned reads displayed.
CATGTCATTTATAGCAACCAGCATTTCACCGGTATTATCGAGTAAACTTAAATAACTGCTCGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGGCTTTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTACTATCCGCATAATTTAAACTTTCATGACTATATCCGGCGACATCAATATTCGCGCTACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTAAATGCCTGAATTACAAAAGCGA > CP042583/1833898‑1834444 ||| gTCATTTATAGCAACCAGCATTTCACCGGTATTATCGAGTAATGATAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCg > 1:1992995/1‑289 (MQ=255) aTTTATAGCAACCAGCATTTCACCGGTATTATCGAGTAATGATAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACa > 1:282000/1‑289 (MQ=255) aCCAGCATTTCACCGGTATTATCGAGTAATGATAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTc > 2:524021/1‑288 (MQ=255) ccAGCATTTCACCGGTATTATCGAGTAATGATAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTcg > 2:628765/1‑288 (MQ=255) ccAGCATTTCACCGGTATTATCGAGTAATGATAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTcg > 1:2434058/1‑288 (MQ=255) cAGCATTTCACCGGTATTATCGAGTAATGATAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTcgcc < 1:3036074/289‑2 (MQ=255) ttCACCGGTATTATCGAGTAATGATAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATCTTGCGCCCTACTCCCCCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGCTTCATGTGAATATCCTGCGACCTCAata > 1:2033715/1‑277 (MQ=255) ttCACCGGTATTATCGAGTAATGATAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTcgccgaacct > 1:2060548/1‑282 (MQ=255) cACCGGTATTATCGAGTAATGATAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCtat > 2:908657/1‑289 (MQ=255) gTATTATCGAGTAATGATAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATTAATATTCGCAGAACCTATAATTa > 1:1476637/1‑289 (MQ=255) tattatCGAGTAATGATAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTa < 2:406638/288‑1 (MQ=255) gtaatgatAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTa > 1:773716/8‑279 (MQ=255) taatgatAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGTCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAAt > 2:350918/7‑287 (MQ=255) taatgatAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGc > 1:584110/7‑249 (MQ=255) taatgatAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAAt > 1:1219044/7‑287 (MQ=255) gatAAATAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCtttt < 2:2060548/287‑1 (MQ=255) aaTAACTCGACGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTcgc > 2:102726/1‑288 (MQ=255) ataactcgacGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCgcgc < 1:2337121/280‑1 (MQ=255) taactctacGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCa < 1:329658/281‑1 (MQ=255) taactcgacGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCa < 1:2944504/281‑1 (MQ=255) aattctacGTATTTTCTCCCGGCCCAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCAt < 2:768696/282‑1 (MQ=255) ctcgacGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGc > 1:520424/6‑236 (MQ=255) cgacGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCa < 2:1795379/286‑1 (MQ=255) gacGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTcgccg > 1:9200/3‑248 (MQ=255) ctcCCGGCACAATCAGGCATGTATCGACATAAACGCCAGATGGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCGACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGt < 2:2987002/289‑1 (MQ=255) cccGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTaa > 1:1005115/1‑289 (MQ=255) ccGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTaaa < 1:877753/289‑1 (MQ=255) cGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTaaaa > 2:3088841/1‑289 (MQ=255) cacaATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAat < 2:2198711/225‑1 (MQ=255) gCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCaa > 2:60808/1‑286 (MQ=255) cATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAAc < 1:60808/286‑1 (MQ=255) tttATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGt < 1:3084454/289‑1 (MQ=255) tATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCa < 1:2758787/289‑1 (MQ=255) aTCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTcgcc < 1:1616607/217‑2 (MQ=255) aTCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTcgcc > 2:1616607/1‑216 (MQ=255) aTAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCcaca < 2:1315867/289‑1 (MQ=255) aaaCGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAg < 2:701217/289‑1 (MQ=255) aaaCGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAg < 1:1541201/289‑1 (MQ=255) gattgattGGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTa > 1:482211/1‑214 (MQ=255) ttgattgGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGa < 2:282000/287‑1 (MQ=255) ttgattgGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGa < 1:1299721/287‑1 (MQ=255) ttgattgGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGAt < 1:2900445/288‑1 (MQ=255) ttgattgGTTTGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGAt < 1:407077/288‑1 (MQ=255) tttGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCaaa < 1:1173035/288‑1 (MQ=255) ttGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAg < 1:63131/288‑1 (MQ=255) ttGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAg < 2:2482109/288‑1 (MQ=255) ttGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGa < 2:1685340/289‑1 (MQ=255) ttGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGa < 2:1135339/289‑1 (MQ=255) tGCGTTAGCAGCGATTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGAc > 1:22822/1‑289 (MQ=255) agcgattGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTaaa < 2:272142/283‑1 (MQ=255) gattGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACAt < 2:85560/286‑1 (MQ=255) cACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACa < 1:1596596/289‑1 (MQ=255) cACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACa < 2:2097297/289‑1 (MQ=255) cACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACa < 2:810599/289‑1 (MQ=255) gCCTACGGCCCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAACATTACGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGAGAATAGCCGGCGACATCAATATTCGCCGATCCTATAATTACGACATAATCCTTTATGCGGATAGACCGTCCTCTGGTGAAAAAGTACCAACCCTGGCAATCCACCAGAATATAGATGGTGCCAAAATGTTTCAAACATGTCGTCATAATTAATCAtga > 2:2877856/1‑287 (MQ=255) ccTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATACTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACAt > 1:168668/1‑267 (MQ=255) aCGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCa < 2:3033263/289‑1 (MQ=255) cGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCAt < 2:2588374/289‑1 (MQ=255) acaggcTCAGTTGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACGCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTTATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATTATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGGCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCa < 1:830748/284‑1 (MQ=255) tCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTa > 1:2090823/1‑159 (MQ=255) tCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCcaca < 2:227734/224‑1 (MQ=255) tCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACACGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTAt > 1:2239483/1‑288 (MQ=255) tCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGa > 2:2429224/1‑245 (MQ=255) cTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGc > 1:1950379/1‑118 (MQ=255) cTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCcac < 1:2665801/211‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACAtgtg > 2:873710/1‑266 (MQ=255) ttGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCca > 2:1420473/1‑208 (MQ=255) cAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAAtt > 1:2631439/1‑289 (MQ=255) cAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAAtt > 2:1355254/1‑289 (MQ=255) cAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCa < 2:173270/216‑1 (MQ=255) cAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCa > 1:760462/1‑257 (MQ=255) cAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTAcc > 2:1526555/1‑289 (MQ=255) ccAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTcgc > 2:1567602/1‑147 (MQ=255) ccAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTcgc < 1:1567602/147‑1 (MQ=255) ccAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCcaca < 2:1975245/194‑1 (MQ=255) ccAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACa > 2:455952/1‑244 (MQ=255) acggTTTTGTGCAATATTGCGTCCTACTCCACCCGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATGTCGACATAATCCTTTTCGCGCATGGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCGGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCaga < 2:1210877/287‑1 (MQ=255) cTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAg < 2:202984/289‑1 (MQ=255) cTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAg < 2:740013/289‑1 (MQ=255) cTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAg < 1:2491154/289‑1 (MQ=255) tACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCAc > 2:2010334/1‑131 (MQ=255) tACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGc > 1:1397244/1‑289 (MQ=255) tACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGc > 2:486918/1‑289 (MQ=255) ccaGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCct > 2:2674981/1‑129 (MQ=255) ggCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGAt > 1:1876079/1‑170 (MQ=255) ggCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGAt < 2:1876079/170‑1 (MQ=255) ggCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACa < 1:2708047/209‑1 (MQ=255) cGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCa > 1:990686/1‑215 (MQ=255) cGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAg > 1:872773/1‑276 (MQ=255) cGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACaaaa > 2:1706231/1‑289 (MQ=255) cGTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACAAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACaaaa > 2:1223396/1‑289 (MQ=255) gTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAAt > 2:3144558/1‑289 (MQ=255) gTAAATTTTATTTTACCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAAAATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAg > 1:274863/1‑275 (MQ=255) tattttaCCTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGaa > 1:2533240/1‑152 (MQ=255) ccTGGATTTGAATCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCTACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTAAGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCGCTAGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCAACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTTTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTAAATGCCTg < 1:1072672/289‑1 (MQ=255) gaaTCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTAAATGCCTGAATTACaaa > 2:964254/3‑289 (MQ=255) aaTCCGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGc > 1:1716524/2‑197 (MQ=255) cGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCcaca > 1:2021684/1‑127 (MQ=255) cGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGa < 2:2751846/137‑1 (MQ=255) cGCATAATTTAATGATTCATGTGAATATCCGGCGACATCAATATTCGCCGAACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTAAATGCCTGAATTACAAAAGCGa > 1:2159631/1‑289 (MQ=255) ||| CATGTCATTTATAGCAACCAGCATTTCACCGGTATTATCGAGTAAACTTAAATAACTGCTCGTATTTTCTCCCGGCACAATCAGGCATTTATCGACATAAACGCCAGATTGATTGGTTTGCGTTAGCAGGCTTTGACCATAAAAATCACTGCCTACGGCGCTCAGTAGCCAGGCTTTGTTACCCAGCAACGCCAGGTTTTGTGCAATATTGCGCCCTACTCCACCAGGCGTAAATTTTATTTTACCTGGATTACTATCCGCATAATTTAAACTTTCATGACTATATCCGGCGACATCAATATTCGCGCTACCTATAATTACGACATAATCCTTTTCGCGCATAGCACGTCCTCTGGTAAAAAATTACCAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTAAATGCCTGAATTACAAAAGCGA > CP042583/1833898‑1834444 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |