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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,912,290 | 0 | T | A | 98.9% | 894.0 / NA | 379 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (191/182); minor base G (0/4); total (192/187) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.83e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
CTGCTGCACGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACTGATACCCCGCCTCCAGGCTG‑GCGATAAT‑CCCGCTGCTGTGGTAATGATCTGTGCCATCTTCTTGTTCGGAAACATCATTGCTAAACCACGCGTATTGCAGCCAGCTATCCAGCCAGGCCCCTTGCTTCTGATTACCGTGCTGAAACCAGCTACTTGTCAGCCCAACGGCATAACCGTGGTTCTGGTTATCGGCGCGAGTTCCGGTCATATTGCTGCGGCTGTCGCCCTGGTTATCGCTGTAGCCACCAACAATCCCAAGCATCCACTCGCCATCCGTGCCCCAGCGCCCGCTAAACAGATCGCCGCTAAGTTGCACCGTAGAAGTGTCTTCATGTTGAGCCAGTTGCCCCGCTGCTGTGTAATGATAATCTCCGCCGATAACACGTAAATTCAGCGTCTGACCATCGCCACCTGCGTGATCGCGTCGCTCCATCATAAACGCCTGATTTGCCGCCCGCAGGTTATTAAGATAACCGCCAACTTTGGCATT > CP042583/1912009‑1912566 ||| ctgctgCACGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACTGATACCCCGCCTCCAGCGAG‑GCGATAAT‑CCCCGACGAGTGGTAATGATCTGTGCCATCTTCTTGTTCGGAAACATCATTGCTAAACCACGCGTATTGCAGCCAGCTATCCAGCCAGGCCCCTTGCTTCTGATTACCGTGCTGAAACCAGCTTGATGTCAGCCCAACGGCATAACCGTGGTTCTGGTTATCGGCGCGAGTTCCGGTCATATTCGAGCGGCTg < 1:1176178/289‑1 (MQ=255) 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