Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,969,243 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,969,243 | 0 | G | C | 100.0% | 736.9 / NA | 310 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (158/152); total (158/152) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,969,244 | 0 | C | G | 99.4% | 725.3 / NA | 310 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (156/152); total (158/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,969,245 | 0 | T | A | 98.7% | 720.9 / ‑5.2 | 310 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (157/148); minor base G (0/4); total (158/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.74e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
CCGGAGCACGCTGACTCAATTCATCGCTGCCAAACAGGTGGTAATACGGCGCGATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGGCTACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATGCTGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTCAGCAGGGTGCTGTGCAGGCTGTGTAACCAGCGCCAGCTTTCCAGCATG > CP042583/1968966‑1969522 ||| aGCACGCTGTGACAATTCATCGCTGCCAAACAGGTGGTAATACGGCGCGATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACAt < 1:2907261/288‑1 (MQ=255) gacAATTCATCGCTGCCAAACAGGTGGTAATACGGCGCGATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAata > 1:3057177/3‑288 (MQ=255) cATCGCTGCCAAACAGGTGGTAATACGGCGCGATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGCACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCCAGAAGGTTACACTGGTGTCAATATCCTGTgg > 2:1102799/1‑289 (MQ=255) gtggtAATACGGCGCGATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCCGGCGGCTGGTTGTTACCTTCCCTCGAGACGGTGAACATGGTCGCAATATCCTGCGTCTGACCCGGCTCATGa > 2:2609780/1‑289 (MQ=255) gtggtAATACGGCGCGATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCCTCGAGAAGGGGAAAATGTGGTCAAAATCCTGCGGCTGACCCGGGTCTTGa > 2:1713565/1‑289 (MQ=255) tggtAATACGGCGCGATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATg < 1:1611075/287‑1 (MQ=255) gtAATACGGCGCGATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAAc < 1:2760102/288‑1 (MQ=255) caagcccGGCGCGATACGCCCTTTCCCTGCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGCCGCACGCCCGGCTCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAAc < 2:1205580/282‑1 (MQ=255) ggCGCGATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATgg < 1:2822343/247‑1 (MQ=255) gcgcGATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGAcg < 2:895919/268‑1 (MQ=255) cgcgATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTg > 1:3124478/1‑289 (MQ=255) cgcgATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGGGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGGCAATATCCTGCGGCTCACGCGGCGCATGAGCGTGGATAttt > 2:2421234/1‑288 (MQ=255) gCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCAt < 2:1443487/289‑1 (MQ=255) ttccGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCTCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAAc < 1:1658773/225‑1 (MQ=255) cGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACg < 1:1060077/289‑1 (MQ=255) ccTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCGCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGAc < 2:1372870/288‑1 (MQ=255) gCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGAcg < 1:2283980/244‑1 (MQ=255) cGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGa < 2:2374072/253‑1 (MQ=255) cGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGa > 1:2374072/1‑253 (MQ=255) cGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTgg > 2:2961544/1‑266 (MQ=255) cGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTgg < 1:2961544/266‑1 (MQ=255) cGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAAACGCACGCCCGGATCGCCCAAGCGCAGATTGCCGCCCACTTAGTCCTGGAATTTGTTCCCCGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCACACGGCACTTTCCACCGGTGCGCGGTCCGCTGGTTTTGACCTTCCGTCCAGGAGGCCAAAATGCTGTCaa > 2:1658773/1‑227 (MQ=255) tGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTaa < 1:1127649/288‑1 (MQ=255) aggcacgcGGTACGCTGGTGGAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTAAAACAGACGCCCGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTg < 2:2035665/282‑1 (MQ=255) aGCGGGCCGGTAGCCGGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTg < 2:1224955/289‑1 (MQ=255) cggtccGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCAGTTTCGCGGGTTTCAACAGGAGGCACGCCCGGATCGCCAAGGGGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTg < 2:2062841/283‑1 (MQ=255) tGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTTGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCACTATCCTGCTGATGACGCTGCTCATGAACGCTGATATTGGCGAGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGttccgt > 2:371304/1‑284 (MQ=255) tGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCt > 1:864730/1‑227 (MQ=255) gTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGtt > 1:2497612/1‑289 (MQ=255) aTCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGccc > 2:825011/1‑288 (MQ=255) aTCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGccc > 2:3135830/1‑288 (MQ=255) aTCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGGTTCTGccc > 1:1861851/1‑288 (MQ=255) cAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACAt < 2:277020/183‑1 (MQ=255) gACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCAAGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAAt > 2:305937/1‑289 (MQ=255) ttttCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGa > 1:2418318/1‑289 (MQ=255) tttCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCCCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGaa > 1:1045975/1‑289 (MQ=255) cTGGTTTCAAACAGACGCCCGCCCCGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCTCCCAGGCAAACGGCCCTTCCGTCCGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACCTGGTGGCAAATTCCTGCGGCTGACGCGGGTCATGAACGCAGATCTTGGCGTCCATGGCTGTTCGACCGCTGTAACGATGCGGTTCCCGGGCCCGTTTCTTCCCGCGACTCCTGAATgcc > 2:250917/1‑286 (MQ=255) gACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCgcagc > 1:119873/1‑289 (MQ=255) gACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGGGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGACTACGGAAGGTCGCATCCgtgccag > 2:1086130/1‑282 (MQ=255) cgcacgcCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCgca < 1:1683143/285‑1 (MQ=255) cGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATa < 1:2107488/289‑1 (MQ=255) gATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGAc > 2:2825779/1‑210 (MQ=255) cGCCAACGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGCATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGc < 1:371304/289‑1 (MQ=255) ttGCCGCCCACTTCGTCCTGGACTTTGTCCCCCGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGAtt < 2:502853/288‑1 (MQ=255) ttCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGt > 1:2221650/1‑211 (MQ=255) cGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGc > 1:1495556/1‑289 (MQ=255) ccTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCAt > 2:3148325/1‑166 (MQ=255) ccTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGAc < 2:2165739/177‑1 (MQ=255) ccTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGAc > 1:2165739/1‑177 (MQ=255) ccTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGCTCGGTTCACGGGCCAGTTTCTTCCCACGACTACGGAATGTCCCATCCGGCGCAGCATCCTTGATCCCTTCCAGTTCCGGGGTTTTCGCCCCACCAGCGt > 2:2220093/1‑288 (MQ=255) ccTGGAATTTGTTCCACGCCGGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTc < 1:204625/289‑1 (MQ=255) ggAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCaa > 1:1563069/1‑288 (MQ=255) gAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATCCGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTCCCAGTTCCGGGAATTTCGCCACCCCAGCCTCCAt > 2:2710084/1‑288 (MQ=255) aTTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATcac < 1:2609780/289‑1 (MQ=255) tttGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATcaca < 1:317359/289‑1 (MQ=255) tGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCgcagc < 1:90927/235‑1 (MQ=255) tGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATg > 1:1164682/1‑289 (MQ=255) aCGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGa > 1:999016/1‑288 (MQ=255) gCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCggg > 2:2352515/1‑248 (MQ=255) gCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCggg < 1:2352515/248‑1 (MQ=255) gCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGGCAATCACATGGTCGAGCTGCg > 1:1742755/1‑288 (MQ=255) cGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGc < 1:2114759/237‑1 (MQ=255) cGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCgt > 1:3146417/1‑288 (MQ=255) aGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCt < 1:1898352/279‑1 (MQ=255) ttCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCgtccagtcc > 1:135730/1‑288 (MQ=255) ccAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCAc > 1:1006749/1‑185 (MQ=255) ccAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCgtc < 1:2735976/280‑1 (MQ=255) ccAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCCGCgtc > 2:2735976/1‑280 (MQ=255) gCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCa < 2:1052914/289‑1 (MQ=255) cccccGCGCCCAGGCAAACGGAACTAGCTAACGGTGCGCATTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTACCGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGACTGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCa < 1:1386639/288‑1 (MQ=255) gcgcCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTg > 2:1876159/1‑172 (MQ=255) gcgcCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACg > 1:2951108/1‑286 (MQ=255) gcgcCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACg < 2:2951108/286‑1 (MQ=255) cgcCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCt < 1:1095825/288‑1 (MQ=255) cgcCCAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCt < 1:2710084/288‑1 (MQ=255) cAGGCGACCTGCACTTGCGAACGGTGCGTCGTCGGCTGGTTGTTCCCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTcagca < 2:2113925/289‑1 (MQ=255) cAGGCAAACGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTcagca < 2:117084/289‑1 (MQ=255) aaaCGGCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTCAGCAGGGTg < 1:651034/289‑1 (MQ=255) ggCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCgcagc < 2:938635/191‑1 (MQ=255) ggCACTTGCGAACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCgcagc > 1:938635/1‑191 (MQ=255) cttgcgaaCGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTCAGCAGGGTGCTGTGCAg < 2:2319469/282‑1 (MQ=255) cGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCCGCATCTTTGATACCTGCCAGTTTCGGGGTTTTCGCCACCACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGCCCACTTCACGGCCCACACGGGTGcccgtccctttgagc > 2:1964317/1‑274 (MQ=255) tGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATc > 1:2018759/1‑167 (MQ=255) cGGCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTCAGCAGGGTGCTGTGCAGCGAGTGTAACCAgcgc < 1:2835259/286‑1 (MQ=255) gCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGCACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACAGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCCGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCAGCTTTGATACCTCCCAGATCCGGGATTCTCGCCACAACAGCGCCAATCACATGGTCGCGCTGCGTCCAGTCCACTTCACCGCCCAGAAGCGTGCTGTCCAGCCACTGGAACCatcccctcgt > 2:2018937/1‑280 (MQ=255) gCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCTCGCATGTCGGTACGACCGCTTTAACGGTGCGGTTAACGTGCCAGTTTCTGCCCCCGAATACGGAATGTCGCATCCCGAGCAGCATCTTTGTTCCCTGCCAGTTCAGAGCTTTTCGCCACCACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCCGCACCCAGTCCCCTTCACGGCTCAGCAGGGCTCTTTTCAGCGAGGGTAACCCGCGccccct > 2:3102887/1‑285 (MQ=255) gCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGAtt > 2:437787/1‑194 (MQ=255) gCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCCCAACAGCGTCAATCCCATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTCAGCAGGGTGCTGTGCAGCGAGTGTAACCAGCGCCAGCt > 2:1587811/1‑289 (MQ=255) gCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGc > 1:2587324/1‑227 (MQ=255) gCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGc < 2:2587324/227‑1 (MQ=255) gCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCa < 2:2839694/245‑1 (MQ=255) gCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTCAGCAGGGTg > 2:140099/1‑260 (MQ=255) gCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTCAGCAGGGTGCTGTGCAGCGAGTGTAACCAGCGCCAGCt > 1:2330188/1‑289 (MQ=255) gCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTCAGCAGGGTGCTGTGCAGCGAGTGTAACCAGCGCCAGCt > 1:2456728/1‑289 (MQ=255) gCTGGTTGTTACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTCAGCAGGGTGCTGGTCAGCGCGTGTACACAGCGCCAGCt > 2:1348096/1‑289 (MQ=255) gttgttACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGAtt < 1:2573244/190‑1 (MQ=255) ttgttACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTCAGCAGGGTGCTGTGCAGCGAGTGTAACCAGCGCCAGCTTTcc < 1:1086130/288‑1 (MQ=255) ttgttACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACCGCCCAGCAGGTGGCTGTGCCGCGAGTGTAACCCGGGCCAGCtttgc > 2:1141566/1‑286 (MQ=255) gttACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGAtt > 1:1970174/1‑187 (MQ=255) gttACCTTCCATCGAGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATgg > 1:441323/1‑214 (MQ=255) ||| CCGGAGCACGCTGACTCAATTCATCGCTGCCAAACAGGTGGTAATACGGCGCGATACGCCATTTCCCGTCCTGCGGCTGGAAGCGTGCCGGTACGCTGGTGAAGTAATCCAGACCATTTTCGCTGGTTTCAAACAGACGCACGCCCGGATCGCCAAAGCGCAGTTTGCCGCCCACTTCGTCCTGGAATTTGTTCCACGCCTGCGGGGAGTTCCAGCCCGGCGCCCAGGCAAACGGCACTTGGCTACGGTGCGCAGTCGGCTGGTTGTTACCTTCCATGCTGAAGGTGAACATGGTGTCAATATCCTGCGGCTGACGCGGCTCATGAACGCTGATATTGGCGCGCATGGCGGTACGACCGCTGTAACGGTGCGGTTCACGGGCCAGTTTCTGCCCACGAATACGGAATGTCGCATCCGGCGCAGCATCTTTGATACCTGCCAGTTCCGGGATTTTCGCCACAACAGCGTCAATCACATGGTCGAGCTGCGTCCAGTCCACTTCACGGCTCAGCAGGGTGCTGTGCAGGCTGTGTAACCAGCGCCAGCTTTCCAGCATG > CP042583/1968966‑1969522 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |