| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 613,270 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 613,270 | 0 | G | C | 99.4% | 779.4 / ‑5.2 | 327 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| * | CP042583 | 613,271 | 0 | C | G | 100.0% | 776.8 / NA | 327 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (148/179); total (148/179) | |||||||||||
| * | CP042583 | 613,272 | 0 | T | A | 100.0% | 788.0 / NA | 327 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (148/179); total (148/179) | |||||||||||
Only 100 of 327 total aligned reads displayed.
GAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCACTACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCAGCTCATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGGCTAATGCTCAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGAAACTCGTGCTAATGCTGATAT‑CTCTCCAGTCACCAATATCAACATTAAAACCTGCTGTGATGTTGGCGGTCGTGGAGGCGTCTGCATTCCACCAGGTTTGATGTAGCAGGTTGGCGTAAAGATTGAGGTTTAGTGGGGTAATCGGTTG > CP042583/612990‑613551 ||| gAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCg > 1:2198029/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |