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| MC JC | CP042583 | 1,598,178 | 75 bp→TCAGGAAACGCCCGCTTCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
TTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGAGCATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGAGCCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGAGTGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAATAACCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTAGCACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCAGTCCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGAGCGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAA > CP042583/1597972‑1598540 | gttcactttactgttgagcattcattttaaatgccagcaaggtttacgcacacgcattctgttactgcggatggtgacctggattggtcgctggtcgatgctcgacctgtttgtcatatctttaaccatgtcgctgattaatcgcgatcagatcctcgcttttactatgggaccggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGa > 2:1849146‑M2/282‑289 (MQ=255) 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gcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGAtgcg < 1:396771‑M2/279‑1 (MQ=255) cttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGt < 2:1281501‑M2/262‑1 (MQ=255) | TTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGAGCATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGAGCCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGAGTGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAATAACCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTAGCACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCAGTCCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGAGCGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAA > CP042583/1597972‑1598540 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |