Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 666,778 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 666,778 | 0 | A | T | 99.1% | 518.0 / NA | 221 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (112/106); minor base C (2/0); total (115/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 666,779 | 0 | G | C | 99.1% | 517.6 / NA | 221 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (113/105); minor base A (2/0); total (115/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 666,780 | 0 | T | A | 99.1% | 515.5 / NA | 221 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (113/106); minor base C (2/0); total (115/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
TTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACAGTCTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTAAGCGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGAGTGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAGCGCGCTCTCTACCGATTTCCGTAACAGCGTTG > CP042583/666517‑667057 ||| ccTCTCACGTTATTACCTTTTTTGGTATTGTCCAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTTAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAgg < 2:201197/289‑1 (MQ=255) ccTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAgg < 2:1494881/289‑1 (MQ=255) tatTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACg > 2:811839/1‑269 (MQ=255) tACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGCTGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTAAGACAGCCCCACCCGATACGGTGGATTAGGTACAATGGCAGtt > 2:620799/1‑288 (MQ=255) aCCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTTCCTCCGCATATGGCGGTCATCCATCCATATATGCTTGAGATGATGGCAGGCGGGGGCAAAATGATCCTCGGGCCCGGCCGGCAACTCCGTTACGGTGCATTAGGTAACAAGGCAGTC‑g > 2:1684802/1‑289 (MQ=255) gttgGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGCCAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGAAGTC‑GGGGacg > 2:568855/1‑287 (MQ=255) aCAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTGTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCCACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGAAATATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGAGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGa < 1:617590/288‑1 (MQ=255) gACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTa > 1:1009441/1‑243 (MQ=255) aCCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGTGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCAGTAGGGACGTAGGCAGGT‑GGTGGGGGCGGGGGGGAGATgg > 2:313732/1‑289 (MQ=255) aCCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCCCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAACGGC‑GTCAGGGGGGCGCGGCGGTGGTTTgg > 2:1960226/1‑289 (MQ=255) ccGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCGTGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGt < 1:1085914/285‑1 (MQ=255) cGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCacac > 2:1425162/1‑234 (MQ=255) cGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCacac < 1:1425162/234‑1 (MQ=255) cGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGGGGGTTggga > 2:1547383/1‑287 (MQ=255) tAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATgg < 2:111308/257‑1 (MQ=255) aGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAg < 1:1547383/289‑1 (MQ=255) cGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCGGCtt > 2:93062/1‑289 (MQ=255) taatgAACGTTTCCGGCTGGCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAAt < 2:1588039/285‑1 (MQ=255) aaCGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCAtt < 1:293032/229‑1 (MQ=255) aaCGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCAtt > 2:293032/1‑229 (MQ=255) ttCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCt < 1:819330/286‑1 (MQ=255) ttcgggaggtgATGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTCTTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGGTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGa < 2:179768/281‑1 (MQ=255) tGCCGGAGGTGCTGACCATCTGCCATAACTCAGTCTCCGCCGTCGGCGGCACTATTATCGTTGATAACCTGGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGGGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGGGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGa < 2:788436/289‑1 (MQ=255) cGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCCGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGGCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTGGGTAAGACAGCTGCTGAATGACCCCGGGGATATCGACTa > 2:1828815/1‑289 (MQ=255) tGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCg < 1:733797/288‑1 (MQ=255) tGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGt > 1:218617/1‑289 (MQ=255) tGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGt > 2:1649905/1‑289 (MQ=255) tGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTCGGTTGGTAATACAGCTGCTTAATGACACCCGGGATACCGACTTTCCGGGCgg > 2:1291206/1‑288 (MQ=255) aCCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTgg > 1:537526/1‑289 (MQ=255) aaCTGCCATAACTCACTCTTCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTg < 1:1382514/289‑1 (MQ=255) aaCTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTg > 1:247550/1‑289 (MQ=255) cTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCg > 1:1824050/1‑289 (MQ=255) cTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCg < 1:11904/289‑1 (MQ=255) ctctGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCg > 1:976638/1‑289 (MQ=255) tctGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAAt > 2:873933/1‑239 (MQ=255) tGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGaa > 1:899714/1‑289 (MQ=255) cggcggCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTgcg < 2:1303460/289‑1 (MQ=255) ggcACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCa > 2:1874463/1‑183 (MQ=255) cACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTa < 1:924951/288‑1 (MQ=255) aCTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTAtg < 1:345871/289‑1 (MQ=255) tATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTGTCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTGTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTAtgtg < 1:463782/289‑1 (MQ=255) cGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCca < 1:1716730/289‑1 (MQ=255) tgatgaCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCcaca < 2:537526/288‑1 (MQ=255) tgatgaCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGGGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCcaca < 1:1680553/288‑1 (MQ=255) gatgaCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTCTGTGGGGCCACAgg > 2:1536424/1‑289 (MQ=255) gatgaCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCca > 1:356670/1‑285 (MQ=255) gatgaCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAgg > 1:596735/1‑289 (MQ=255) gatgaCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAgg > 1:1558678/1‑289 (MQ=255) gatgaCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAgg > 2:1771101/1‑289 (MQ=255) gatgaCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTGGCGGTGCATCTGAACGGAAAACCTGCGCCGTTTGTGGTGCCACAgg > 2:664788/1‑289 (MQ=255) gatgaCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATACTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCGTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCGGAGCGGAAAACCTGGGACGTATGTGGGGCCAGAgg > 1:1481539/1‑289 (MQ=255) atgaCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATGTGACCGGAAAACCTGCGCCGGATGTGGGGCCACCGGa > 1:1014707/1‑289 (MQ=255) aCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGAtgt > 1:1907758/1‑289 (MQ=255) tGTTTTTGGTTTTGCGGCGGCCCGGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCAGATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGgcg < 2:899714/289‑1 (MQ=255) tGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGgcg < 1:664788/289‑1 (MQ=255) tGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGgcg < 2:596735/289‑1 (MQ=255) gTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGGAAAACAg > 2:417588/1‑192 (MQ=255) cgGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGgcg < 2:1867338/288‑1 (MQ=255) cgGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGgcg < 2:1917969/288‑1 (MQ=255) cgGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGgcg < 1:313732/288‑1 (MQ=255) cgGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGgcg < 2:247550/288‑1 (MQ=255) ggCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGgcgc < 1:803706/288‑1 (MQ=255) tGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAAc > 1:1698797/1‑289 (MQ=255) ggTATTTGTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGtt < 1:1765109/289‑1 (MQ=255) gTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGGGCTTGCGATCATTGGCGCGGGGTTCAAAAACgggt > 2:708564/1‑286 (MQ=255) gTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCTCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGtt > 2:1376464/1‑288 (MQ=255) ttttGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑Tc < 2:334299/289‑1 (MQ=255) cTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACa < 1:1304966/288‑1 (MQ=255) cTCCGCATATGGCGGTCATCCATCAATATATGGGTGAGAGGATGGCAGGCGGCGGCAAAAGGATGCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACa < 2:1400093/288‑1 (MQ=255) tCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGAtg < 2:124191/236‑1 (MQ=255) cGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTTGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCaaaaaacaag > 2:1555869/1‑283 (MQ=255) ttGCGGTCATCCATCAATACATGCGTGGGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTAACCGGGCGTGGTTGCGGGGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGa < 1:721699/289‑1 (MQ=255) tGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAg > 1:105690/1‑289 (MQ=255) tGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACATGCGCCGTATGTGGGGCCACCGGATGGGGCGCTGGGTATCATTTGAGCGGTGGTGAAAAACGGTTACGTTCAAAAAGAATGtaagtag > 2:45453/1‑283 (MQ=255) cGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGt > 2:1672576/1‑288 (MQ=255) tCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATg < 2:1042693/141‑1 (MQ=255) tCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGa > 1:161347/1‑283 (MQ=255) tCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGa < 2:161347/283‑1 (MQ=255) catccatcAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGtt > 2:521382/1‑289 (MQ=255) atatatGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGc > 1:1237321/1‑289 (MQ=255) atatGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGt > 1:1155642/1‑289 (MQ=255) atGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGAGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTa > 1:1887233/1‑289 (MQ=255) gCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTAtgt > 1:50502/1‑192 (MQ=255) gTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAgcgc > 1:1246057/1‑289 (MQ=255) gTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGC‑‑CACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAgcgcg < 1:450957/288‑1 (MQ=255) gcgatgatGGCAGGCGGCGGCAAAAGGATCCTCGGGTCAGACAGCCACCTCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGAAACCTGGGATAGCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCTTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAgcgcg < 2:1481539/286‑1 (MQ=255) gagaTGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAgcgcg < 1:192933/288‑1 (MQ=255) gagaTGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAgcgcg < 1:568855/288‑1 (MQ=255) gagaTGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAgcgcg < 1:1872134/288‑1 (MQ=255) agaTGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCCAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTGGGACCGGGCGTTAgcgcgc > 2:1360093/1‑288 (MQ=255) agaTGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAgcgcgc > 1:1446666/1‑288 (MQ=255) atgatgGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAGCGCGctc > 1:1861162/1‑288 (MQ=255) gatgGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTCAATGGA‑TTCGTTGGACCGGGCGTTAgcgtcgtccc > 2:82871/1‑281 (MQ=255) atgGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAGCGCGctctct > 1:1535477/1‑288 (MQ=255) tgGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAGCGCGCTCTCTa > 2:1011494/1‑288 (MQ=255) cAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAGCGCGCTCTCTACCg > 1:1042429/1‑288 (MQ=255) cggcggcAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAGCGCGCTCTCTACCGAt < 1:1303037/286‑1 (MQ=255) cggcggcAAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAGCGCGCTCTCTACCGAt < 1:82871/286‑1 (MQ=255) aTGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAGCGCGCTCTCTACCGATTTCCGTAACAGCg < 2:237248/289‑1 (MQ=255) gATCCTCGGGTCAGACAGCCACCCCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAGCGCGCTCTCTACCGATTTCCGTAACAGCGtt < 1:1143521/289‑1 (MQ=255) ||| TTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACAGTCTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTAAGCGCGGCCCAGCGTTATGGCGGTATTTTTGTGCCTCCGCATATTGCGGTCATCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGGCAAAATGATCCTCGGGAGTGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTC‑GGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTATCCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCTGGCTATCATTGGCGCGGTGTTCAAAAACGGTTACG‑TCAAAAACAAAGTC‑ATGGAGTTCGTTGGACCGGGCGTTAGCGCGCTCTCTACCGATTTCCGTAACAGCGTTG > CP042583/666517‑667057 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |