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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.82e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 677,538 | 0 | C | G | 99.6% | 582.2 / ‑3.7 | 248 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (128/119); minor base . (1/0); total (129/119) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.03e-01 | |||||||||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
CTGGGCTACTGTAGCGGGATTGAAAACTACAGCCGCTTCCTCTCCGGTCGTGGACCGGGTGAGCCACCGCCGACGCTGTTTGATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAATTGGCGGCATGTATCGCGGTGACCGGGCGCGTAAAGAGACACTGGTGGAGTACGGCTTCCGCCTGCCAAGTGCGCTGGATAACCGTCCGCTTAAGTTTGAAGAGTTCGAAGCATTAGCGCCGCAAACCATCTATGTTAGCGCGACGCCGGGTAATTACGAGCTGGAAAAATCCGGCGGCGATGTGGTGGATCAGGTGGTGCGTCCAACCGGATTGCTTGACCCGATTATCGAAGTGCGGCCGGTGGCGACACAGGTTGATGATCTTCTTAGCGAGATTCGTCAGCGAGCGGCAATTAACGAACGCGTACTGGTCACCACACTGACCAAGCGGATGGCGGAAGATCTTACCGAATATCTCGAAGAACATGGCGAGCGCGTGCGTTATCTTCACAGTGATATCGACACCGTCGAACGTATG > CP042583/677257‑677817 ||| cTGGGCTACTGTTCGGGGATTGAAAACTACTCGCGCTTCCTCTCCGGTCGTGGACCGGGTGAGCCACCGCCGACGCTGTTTGATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAATTGGCGGCATGTATCGCGGTGACCGGGCGCGTAAAGAGACACTGGTGGAGTACGGCTTCCGCCTGCCATCAGCGCTGGATAACCGTCCGCTTAAGTTTGAAGAGTTCGAAGCATTAGCGCCGCAAACCATCTATGTTTCGGCGACg < 2:209950/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |