Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 738,286 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 738,286 | 0 | A | T | 100.0% | 555.0 / NA | 233 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 738,287 | 0 | G | C | 100.0% | 551.2 / NA | 233 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (119/114); total (119/114) | |||||||||||
* | CP042583 | 738,288 | 0 | T | A | 98.7% | 536.7 / NA | 233 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/3); new base A (119/109); total (119/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.12e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
CCGGCGATATTTTCGGTACTGCGGGAAAAATTGTGCGCATTATTTTCGACCTGGCACGCTATAACCGGATCCCGGTGATTGCGGAAGGCGTAGAGAGCGAAGACGTTGCGCGCGAATTAATCAAATTAGGATGTGTTCAGGCTCAGGGGTATCTGTACCAGAAACCCATGCCATTCTCCGCCTGGGATAAAAGTGGAAAATTAGTAAAAGAGTAATTTACGTATGTCCAGAATCAATAAGTTCGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTAGTGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACAGCGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAA > CP042583/738007‑738566 ||| ccGGCGATATTTTCGGTACTGCGGGAAAAATTGTGCGCATTATTTTCGACCTGGCACGCTATAACCGGATCCCGGTGATTGCGGAAGGCGTAGAGAGCGAAGACGTTGCGCGCGAATTAATCAAATTAGGATGTGTTCAGGCTCAGGGGTATCTGTACCAGAAACCCATGCCATTCTCCGCCTGGGATAAAAGTGGAAAATTAGTAAAAGAGTAGTTTACGTATGTCCAGAATCAATAAGTTCGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTg < 1:1028950/289‑1 (MQ=255) 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