| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 747,422 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 747,422 | 0 | A | T | 100.0% | 422.6 / NA | 182 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (84/98); total (84/98) | |||||||||||
| * | CP042583 | 747,423 | 0 | G | C | 98.4% | 409.4 / NA | 182 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/0); new base C (81/98); total (84/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.64e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 747,424 | 0 | C | G | 98.3% | 409.4 / NA | 182 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/0); new base G (80/98); total (84/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.45e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
GCCACGCGTATAGGCGAGAAACTGAGTCTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGAGCCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑AGCCGCCGCACCG‑TACGTAGCCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCAGTAGCCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGA > CP042583/747152‑747700 ||| ccACGCGTATAGGCGAGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGggcgg > 1:679967/1‑289 (MQ=255) gcgTTTCGGCGGGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTgg < 2:909400/289‑1 (MQ=255) gcgTATAGGCGGTAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGGGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTgg < 1:940429/289‑1 (MQ=255) gcgTATAGGCGAGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTgg < 2:679967/289‑1 (MQ=255) gcgTATAGGCGAGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGACGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTgg < 1:26959/289‑1 (MQ=255) gTATAGGCGAGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGCTCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGc < 2:423626/288‑1 (MQ=255) gTATAGGCGAGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGc < 2:1174223/288‑1 (MQ=255) gaAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGAt < 1:1040878/288‑1 (MQ=255) gaAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGAt < 1:1195608/288‑1 (MQ=255) gaAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGAt < 1:1561457/288‑1 (MQ=255) aaactgtcacTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGGGCTGGCGCTGGGGTTCGTTTGGCTGCCGTTGCTGGCGTGGGTCGCCCCCTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCCGCTGGGCCGCTATGAATCTGGCTTGCTGCATGTGCCTATTTTCAGGGCG‑TTCATTTCTGGGTTCTTGTCTTTAGCGCGTCTGACC‑TCCTGCCGGACCGTTCCTTTGCCT‑CCTATTTTGGGGTGCTGGACGGTTATGATTg > 2:1494145/10‑289 (MQ=255) aaactgtcacTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCGATGAATATGGCTTGCTGCCAGTGCCGCTTTTCGGGGCG‑TTAATTTCGGGGTACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCCCCCCGCACCG‑TATGTTCGCTGATTATTTTGGGCGCGTGGCGGGTTATGATTg > 2:1885495/10‑289 (MQ=255) tCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGc < 1:1347599/288‑1 (MQ=255) tCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCa > 1:1152331/1‑289 (MQ=255) tGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTTCTGGCGTGGATCCGCCAGGCCCCGCTTATCATCATTACCCGCGACCCGTTGAGCATCCATGAATATGGCTTGCTTCCAGTTCCTATTTTCGTGGCC‑TTCATTTCGGGTAACTTGCTGTTTGCCCGTCGCCCC‑CACCCCCGCCCCC‑TCCGTTCCCTGGTTATTTTTGTCGCCCGGCCCAGTGTGATTTGTTTATTTGTCTCTGCTTCgtcgccg > 2:1932150/1‑283 (MQ=255) aaGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGGTCGCCCAGTCGCCGCTTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCCGCTATGGATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTTTTACCGCGTCCGCCC‑CCGCCCCGCACCC‑GTCGTTCGCTGCTTATTATGGGCCGCCGGCCGGTGCTGCTTTGTGCTGTGGTCGCTGGTGCTGCGACCGTTagc > 2:1624153/1‑286 (MQ=255) gTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGGTTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGGTTATTGTTGGTCTATTGGGTGCTGCTGCGGGAACGGGTATctcatcg > 1:1627664/1‑282 (MQ=255) tGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTTGGATTCGTTAGTCTGCCGTTTCTGGCGGGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTTCTGCAAGTGCCCATTTTTGGGGCG‑TTAATTTCGGGTAACTTGCTGTTTGCGCGTTTGACCTCGCCG‑CGCACCC‑TACGTTCGCTGGTTATTATTGGCGGGTGGCCGGTTGTGATTGGTCTCTTTGTCGCTTGTGCCGGAACGGTTATctcctcgg > 2:279434/1‑281 (MQ=255) tGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgc > 1:1938490/1‑281 (MQ=255) tGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgc > 1:1769052/1‑281 (MQ=255) gCTGAGGACCGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgca < 1:1925676/288‑9 (MQ=255) gCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgca < 1:708589/288‑9 (MQ=255) gCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgca < 2:1276177/288‑9 (MQ=255) agaaCGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgcacgcgt < 2:1769052/288‑14 (MQ=255) cGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTa > 1:824955/1‑289 (MQ=255) gtgGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTg < 1:1516785/289‑1 (MQ=255) gggCGGTGACGCTGTCGTTGGCATTCCTTGCTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCGAGTCTCCGATTATCATCATTACCGGCGGGCAGTTGAGCAGCTATTAATATGGCTTGCTTCAAGTGCCTTTTTTCGGGGCT‑GTCATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTGATGGATGACTg < 2:965150/287‑1 (MQ=255) gCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTgg < 2:1246924/213‑1 (MQ=255) ggggCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCgggg > 1:1220762/1‑288 (MQ=255) ggggCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGt > 1:552399/1‑289 (MQ=255) ggggctggcgctggGGTTAGTTAGGCGGCCGTTGCGGGCGTGGTTCGCACAGGAGCCGATTATCATCATTACCGGCGCGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGtt < 2:1189086/285‑1 (MQ=255) ggcgctggcgctGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGtt < 1:903794/288‑1 (MQ=255) ggcgctggcgctGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGtt < 2:552399/288‑1 (MQ=255) gggATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCt > 2:1174532/1‑289 (MQ=255) ggATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCtt > 1:1302165/1‑289 (MQ=255) gTTGGTCTGCCGTTGCTGGAGTGGTTCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTa < 2:1651200/289‑1 (MQ=255) tGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTa < 2:655144/282‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTg > 1:1373994/1‑288 (MQ=255) cGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGGGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGc < 2:1152331/289‑1 (MQ=255) cGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGc < 1:38733/289‑1 (MQ=255) cGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCt > 2:161840/1‑263 (MQ=255) cGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCt < 1:161840/263‑1 (MQ=255) ggATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGAc < 1:295846/288‑1 (MQ=255) gATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGGGGGAcgt > 2:405155/1‑287 (MQ=255) tcgccaagtctccGATTAGCATGAGTACCGGGGGTAAGTTGAGTAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGt < 2:1734771/278‑1 (MQ=255) cccagtcgccGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTGGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCg > 2:641106/9‑289 (MQ=255) cccagtcgccGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTa < 2:590827/253‑1 (MQ=255) cccagtcgccGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTa > 1:590827/9‑261 (MQ=255) cccagtcgccGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCg > 2:1982319/9‑289 (MQ=255) tcatcaTTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGt > 1:415688/1‑271 (MQ=255) catcatTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTAGTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGcc < 1:1608973/289‑1 (MQ=255) ttACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGa > 1:118319/1‑289 (MQ=255) tACCGGCGAGGGGTTGTGCGGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGat < 2:1220762/289‑1 (MQ=255) tACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGat < 1:1361993/289‑1 (MQ=255) gaCCGGGGGGAAGTTGGGCGGCTATGAATATGGCTTGATTGAATTGCCTATTTT‑GGGGCGTTTATTTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATAGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGat < 2:1071280/288‑1 (MQ=255) gaCCGGGGAGCAGTTGGGCGGCTATGACTATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGat < 2:1967012/288‑1 (MQ=255) gCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAg > 1:1834543/1‑289 (MQ=255) aGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGAt < 1:1406712/142‑1 (MQ=255) agcagcTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCACCGCACGCGTCCTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGTGAATGCGGGACTGGTGCGTTTAAACCTGTTTGCCAGCCACATGAGTAAAggctcgg > 2:1977815/1‑284 (MQ=255) cagcTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGtt > 1:542929/1‑289 (MQ=255) tATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGttt < 1:1885495/286‑1 (MQ=255) aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGata < 1:1802510/267‑1 (MQ=255) aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGata > 2:1802510/1‑267 (MQ=255) aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGt > 1:1789510/1‑278 (MQ=255) aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGt < 2:1789510/278‑1 (MQ=255) aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTg > 1:1173690/1‑288 (MQ=255) aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTg > 1:1146414/1‑288 (MQ=255) aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTg > 1:558559/1‑288 (MQ=255) aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTg > 1:1317056/1‑288 (MQ=255) aaTATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTCTTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCcgc > 1:1265472/1‑289 (MQ=255) ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGTGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATgg > 1:1519504/1‑289 (MQ=255) ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGa < 1:245390/118‑1 (MQ=255) ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGTATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGGAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATgg > 1:1677116/1‑289 (MQ=255) ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAAcc < 2:842981/243‑1 (MQ=255) ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCTAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGTCGCGATgg > 1:913360/1‑289 (MQ=255) ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTACAGGTACGGTTTCTGCCGCGTTgg > 1:207776/1‑289 (MQ=255) ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATgg > 1:1954855/1‑289 (MQ=255) ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATgg > 1:1962171/1‑289 (MQ=255) ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATgg > 1:884627/1‑289 (MQ=255) cTTGCTGCAAGTGCATATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCTGGTAACTTGTTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGAACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGGAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATggg < 2:296671/288‑1 (MQ=255) tgctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAAt < 1:274497/289‑1 (MQ=255) gctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTaa < 1:1124588/185‑1 (MQ=255) gctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTaa > 2:1124588/1‑185 (MQ=255) gctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGt > 2:454582/1‑228 (MQ=255) gctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGt < 1:454582/228‑1 (MQ=255) gctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAAt > 1:1838024/1‑288 (MQ=255) aGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTa < 1:917189/178‑1 (MQ=255) cGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCttt < 1:1715871/289‑1 (MQ=255) gggCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAAt > 2:247234/1‑268 (MQ=255) gggg‑TTAGTTGCGGGTAACTTGCTGGTGGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCAACG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTAc < 2:1373994/285‑1 (MQ=255) tGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTAtt < 1:147945/289‑1 (MQ=255) tGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCaa < 2:1834543/289‑1 (MQ=255) tAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATg < 2:1302165/288‑1 (MQ=255) aGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATg > 1:702997/1‑287 (MQ=255) ggcgTCTGCCC‑CCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGAGTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCTCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCTTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCt < 2:1317056/287‑1 (MQ=255) gccgcACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCa < 1:279434/288‑1 (MQ=255) cACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACgg > 1:651637/1‑288 (MQ=255) cACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACgg > 2:1407559/1‑288 (MQ=255) aCCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTTCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGa < 2:919991/288‑1 (MQ=255) aCCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGa < 1:1982319/288‑1 (MQ=255) ||| GCCACGCGTATAGGCGAGAAACTGAGTCTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGAGCCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑AGCCGCCGCACCG‑TACGTAGCCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCAGTAGCCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGA > CP042583/747152‑747700 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |