Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 798,869 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 798,869 | 0 | A | T | 99.4% | 401.7 / NA | 173 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (81/90); minor base C (1/0); total (82/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 798,870 | 0 | G | C | 98.8% | 392.2 / NA | 173 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base C (80/90); total (82/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 798,871 | 0 | C | G | 99.4% | 399.3 / NA | 173 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (80/91); minor base T (1/0); total (82/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.71e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
ATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAACCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGAGTCGGGACCTTGCCCG‑TAGTCTTAGCACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGAGCCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATG > CP042583/798597‑799141 ||| aTGGCGACAGCCGTCCGTTGCCTAAACCGACGACGGCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCg < 2:646658/289‑1 (MQ=255) aTGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAACCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCg < 1:954838/289‑1 (MQ=255) cgtccgtTGCATAAACCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCTGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCAGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGt < 2:566873/284‑1 (MQ=255) gtccgtTGCATAAACCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGt < 1:1572494/289‑1 (MQ=255) tccgtTGCATAAACCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCTCCGGTGGCGGTGCGTGTCGTTgtggtt > 2:514853/1‑284 (MQ=255) tGCATAAACCGACTACGACGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCGGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGCTACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTc < 2:1942069/288‑1 (MQ=255) tAATCCGGCGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAATCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGc < 1:1372587/289‑1 (MQ=255) tAAACCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGc < 1:87881/289‑1 (MQ=255) tAAACCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGc < 1:1502758/289‑1 (MQ=255) aaaCCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCa < 1:995480/289‑1 (MQ=255) acccGACGACGCCGCTGCCTTAGCTAGAATGGCTGAAACCGCAGCCGGGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGc < 2:1685356/285‑1 (MQ=255) aCCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCaaa < 1:894197/289‑1 (MQ=255) aCCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCCCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCATCGGTCGTAAATGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACTGGAACTTGCCCGTTCATCTTCG‑TCGGTGGCGGTGCGTTACGTTGAAGGTATTCCTgctaaa > 2:180347/1‑284 (MQ=255) cgacgCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTa > 2:219333/1‑289 (MQ=255) cgccgcTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATg < 1:247229/288‑1 (MQ=255) cgccgcTGCCTTCTCTGGATTGGCTGACACCGCCGCCGAGGGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGGGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATg < 2:1761882/288‑1 (MQ=255) agccgcTGCCTTCTCGTGAGTTGCTGACACCGCCGCCGGGCGAAGTGGTGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAGCAAATGGCTGGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTGCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCCCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTGACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATg < 2:706923/287‑1 (MQ=255) tGCCTTACCTGGATGGGGTGCCACCGCGGGCGAGCGAAGTGGGGCCGGTAGGTACCTTGGGGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGGGCGTCTGGCTGATTGCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTc < 2:1622544/288‑1 (MQ=255) gCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTg < 1:589535/289‑1 (MQ=255) gCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTTAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCCAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGGTCGTGTCGTTGACGTTATTCCTGGCAAACCCTATGCAGGGCTGGACTTACTGAACaaa > 2:1935086/1‑289 (MQ=255) cggcgccgGGCGAAGTGGGGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACa < 2:1882119/286‑1 (MQ=255) cgccgccgAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACa < 1:125986/289‑1 (MQ=255) cgccgccgAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACa < 1:331648/289‑1 (MQ=255) cgccgccgAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACa < 1:1850543/289‑1 (MQ=255) cgccgGGCGAGGGTGAGCGGGTGTATACCTTTGCGGTTGGAAAAATGGTTCGCCTGGTGGCAGGGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCTGCGCGAATTTCTGACTTGTCACGGGCCCTTTCCCG‑TTCCCTTTCGAGGGTGGCGGGGCGTGTCCTGGAAGTTATTCCTGGCAAACCGTATGTAGGTCTGGAGTTACGGAATAAAGAACGACa < 2:884275/286‑1 (MQ=255) ccTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTTAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTTTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGGTTTGGATa > 2:1123691/1‑288 (MQ=255) gAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTcc > 2:608677/1‑289 (MQ=255) cGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCgt < 1:972444/289‑2 (MQ=255) cGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCgt < 1:219333/289‑2 (MQ=255) cGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATGACTCTCCGGGGCCTGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCg > 1:1763945/1‑288 (MQ=255) gCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCgtc < 1:1100452/289‑3 (MQ=255) ccTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCgtc > 1:646552/1‑286 (MQ=255) gtggAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCgtcgccat > 2:1271526/1‑282 (MQ=255) gtggAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCgtcgccat > 1:838221/1‑282 (MQ=255) ggAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCgtcgccatt < 1:1620869/288‑9 (MQ=255) aGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGc > 2:1706347/1‑184 (MQ=255) aGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGc < 1:1706347/184‑1 (MQ=255) aGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAAcc > 1:1875616/1‑289 (MQ=255) tCTTGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCgtggtg < 1:1207156/289‑1 (MQ=255) tCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATACCGGCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCgtggtg > 1:106176/1‑289 (MQ=255) tCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCgtggt > 1:849335/1‑288 (MQ=255) tCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGATTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCgtggt > 1:460331/1‑288 (MQ=255) cTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCTGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCgtggtg < 1:511824/288‑1 (MQ=255) cTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCgtggtg < 1:608677/288‑1 (MQ=255) cTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCgtggtg < 1:1431052/288‑1 (MQ=255) cTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGc < 2:1553173/289‑1 (MQ=255) cTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCGTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCgtggtg < 1:1807815/288‑1 (MQ=255) tttCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTc < 2:1046390/185‑1 (MQ=255) tttCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTc > 1:1046390/1‑185 (MQ=255) gTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTCCCCTCCGGGTCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGatat < 1:747042/289‑1 (MQ=255) gTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGatat < 2:646552/289‑1 (MQ=255) gTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGata > 1:29413/1‑288 (MQ=255) aTGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAGGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATACAGCCGGTGCGcc > 2:316798/1‑289 (MQ=255) aTGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAg > 2:1361064/1‑287 (MQ=255) tGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTc < 2:526204/167‑1 (MQ=255) tGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTc > 1:526204/1‑167 (MQ=255) tcAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCggtggt > 2:1093540/1‑289 (MQ=255) aaTGACTCCCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTg < 2:937665/289‑1 (MQ=255) tcCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCa > 2:1236768/1‑137 (MQ=255) cGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGc > 1:1366857/1‑134 (MQ=255) cGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGc < 2:1366857/134‑1 (MQ=255) ccGGTTAGCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGCCGGTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAACCCGTTTATCTGCTCGCAGGTTGGGATAACGCCAAGTTACTCCATATTCCGTCGCTACTAACTGAGGCGCTGGGTACACATATCTCCGCTCGGCCGATGGTTGTCGTCCTTGTGaaaa > 2:101741/1‑289 (MQ=255) cGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCg < 2:1982329/234‑1 (MQ=255) cGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCg > 1:1982329/1‑234 (MQ=255) gTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCgtggtg > 2:1558908/1‑237 (MQ=255) gTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGa < 2:286405/283‑1 (MQ=255) gTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGa > 1:286405/1‑283 (MQ=255) gTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATg > 2:422042/1‑288 (MQ=255) tATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCg < 1:1141616/289‑1 (MQ=255) cTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGc > 2:1497597/1‑115 (MQ=255) cTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGc < 1:1497597/115‑1 (MQ=255) ttgaattgaaCCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCTGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGTCCAAAATGCCGAACTTgttggt > 2:1462529/1‑289 (MQ=255) gaattgaaCCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGa > 1:1096183/1‑179 (MQ=255) attgaaCCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCg < 1:1021557/289‑1 (MQ=255) gaaCCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCGGGCGAAAATGCCGCCCGTGTTGGTTGCgggg > 2:1027714/1‑289 (MQ=255) aCCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCTATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAACGCTATCGCCGGTGAGCTCGGGGTTGCCGATCTGGCGAAAATCCCCCATTTTTTGTTTGCGGGGa > 2:184563/1‑288 (MQ=255) aCCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGa > 2:1194655/1‑288 (MQ=255) tGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTAc < 1:1271526/289‑1 (MQ=255) ggCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTACCCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTAGCCGTTCTGCGCACAATGCCGACCTTGTGGGTTGCGGGGACTAcg > 2:837908/1‑288 (MQ=255) ggCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTAcc > 2:1232362/1‑289 (MQ=255) ggCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTAcc > 1:135407/1‑289 (MQ=255) aCCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGt < 1:1659520/289‑1 (MQ=255) aCCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGt > 2:1199817/1‑289 (MQ=255) ggCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCgtggtg < 1:1217835/204‑1 (MQ=255) ggCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCgtggtg > 2:1217835/1‑204 (MQ=255) ggCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCg > 2:1782674/1‑289 (MQ=255) ggCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTCGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCg > 1:964642/1‑289 (MQ=255) cggcgCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTTGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCCCTTGTTGGTTGCGGGGGCTACCGGTTCCGGTaac > 1:541167/1‑283 (MQ=255) ggcgCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGt < 1:1232362/288‑1 (MQ=255) ggcgCGCATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGt < 1:180347/288‑1 (MQ=255) gcgcgcATTTCTAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGa < 2:1803670/238‑1 (MQ=255) tAACTTGTCACGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAAcgcg < 1:1782674/289‑1 (MQ=255) gtcacGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATc < 1:1462529/285‑1 (MQ=255) gtcacGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATc < 2:849335/285‑1 (MQ=255) tcacGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATAACGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGAGCTGGCGAAAATGCCGCACTTTGTGGTTGCGGGGACTTCCGGGTCCGGTAAACCTGTCGGTGTTAActcggcggtcc > 2:1365785/4‑282 (MQ=255) cacGGGACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCga < 1:60592/280‑1 (MQ=255) gACCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGc < 1:1199817/288‑1 (MQ=255) aCCTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCAt > 1:725237/1‑289 (MQ=255) ccTTGCCCG‑TTCACTTTCGACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATg < 1:1194655/289‑1 (MQ=255) ccTTGCCCG‑TTCACTTGGGACGGTGGCGGTGGGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATg < 2:930238/289‑1 (MQ=255) ||| ATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAACCGACGACGCCGCTGCCTTCTCTGGATTTGCTGACACCGCCGCCGAGCGAAGTGGAGCCGGTAGATACCTTTGCGCTTGAACAAATGGCTCGCCTGGTGGAAGCGCGTCTGGCTGATTTCCGTATTAAAGCCGATGTCGTCAATTACTCTCCGGGGCCGGTTATCACTCGCTTTGAATTGAACCTGGCACCGGGCGTAAAAGCGGCGCGCATTTCTAACTTGAGTCGGGACCTTGCCCG‑TAGTCTTAGCACGGTGGCGGTGCGTGTCGTTGAAGTTATTCCTGGCAAACCCTATGTAGGTCTGGAGTTACCGAATAAAAAACGACAAACCGTTTATCTGCGCGAAGTTTTGGATAACGCCAAATTCCGCGATAATCCGAGCCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATG > CP042583/798597‑799141 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |