Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 799,595 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 799,595 | 0 | A | T | 99.1% | 526.4 / NA | 228 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base T (92/131); minor base C (2/0); total (94/134) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 799,596 | 0 | G | C | 100.0% | 534.8 / NA | 228 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (94/134); total (94/134) | |||||||||||
* | CP042583 | 799,597 | 0 | C | G | 100.0% | 536.9 / NA | 228 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (94/134); total (94/134) |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
ATGTCTGCGCTGGGTGTGCGTAATCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCAAGCGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACAGTCGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAAAGTCTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGAAAGCGCGTGGTCGCCCACAGTATGTTGATGGCATCACCTCCGACAGCGAAAGC > CP042583/799316‑799873 ||| tGTCTGCGCTGGGTGTGCGTAATCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGt > 2:1988335/1‑289 (MQ=255) tGTCTGCGCTGGGTGTGCGTAATCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGt > 1:13698/1‑289 (MQ=255) tGTCTGCGCTGGGTGTGCGTAATCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGt > 1:1479049/1‑289 (MQ=255) gcgcTGGGTGTGCGTAATCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGttatta < 1:848904/289‑1 (MQ=255) gggTGTGCGTAATCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCAGGGTGACCGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATGGTTGTG‑TTGGTTTACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGAGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGt < 1:1623628/289‑1 (MQ=255) ggTGTGCGTAATCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTgg > 1:830029/1‑287 (MQ=255) gtgtGCGTAATCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTc < 2:1479049/288‑1 (MQ=255) gTAATCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTaa < 1:1023523/289‑1 (MQ=255) aTCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCTGGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCCACTCAGCGTCCACCGGTTGATGGTATTACTGGTCTGATTAAAGc > 2:522410/1‑289 (MQ=255) aTCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGttatta < 2:603695/273‑1 (MQ=255) aTCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGc > 1:1752528/1‑289 (MQ=255) aTCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGc > 1:412278/1‑289 (MQ=255) tGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGaa < 2:134138/289‑1 (MQ=255) ataACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGAc < 1:1079186/289‑1 (MQ=255) aaaaaaTGGTTGAGGCCGTACGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTAGGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTAGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTAt < 1:729038/289‑1 (MQ=255) aaaaaTTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTAt > 2:1157034/1‑288 (MQ=255) aaaaaTTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATc > 2:187126/1‑289 (MQ=255) aTTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCt < 1:1593404/289‑1 (MQ=255) aTTGCTGAAGCAGATCGCATGTTGCGTCCGAGTCCAGCCCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCt < 2:796928/289‑1 (MQ=255) gaaaGCCGATCGCGTGATGAGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTAcc < 2:1422237/287‑1 (MQ=255) aGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTa < 1:1388443/289‑1 (MQ=255) aGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTa < 1:658683/289‑1 (MQ=255) agcGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGGACAGGAATCCGGGTGAAGGTATGGATGCCCAGCATCCGTTGCTGAAAAAAGAACCTTACGTTGTGGTG‑TTGTTGGACGAAGTTGCCGACCTGATGAGGACGGTAGTTAAAAAGGTGGAAGAGTTGATGGAACGTATGGCGCAA‑AAAGCCCGTGGCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCGACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTAACCAg < 2:1125591/287‑1 (MQ=255) tCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGt > 2:1383366/1‑241 (MQ=255) gatgCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGAtt < 1:1529989/289‑1 (MQ=255) tgCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGa < 1:357459/289‑1 (MQ=255) gTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGActc < 1:1965253/289‑3 (MQ=255) tCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGActca > 2:1866605/1‑286 (MQ=255) cGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGActcacg > 1:386230/1‑284 (MQ=255) ttCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGActcacgtac < 1:335522/289‑9 (MQ=255) ttCCAAGCCCGTACGGAAAGCCGGGTGACATGATGGTGGACCATGTTCCGGTGCTGAAAAAAGAACCGTACGCTGTGGTG‑TTGGTTGACGATTTTGCCGACCTGATGATTACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGActcacgtac < 2:63598/289‑9 (MQ=255) ccAGCCCTGTACTGAGAGCCGGCTGACATTCTGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAGAAAAGAACCATACTGTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑ACAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCTTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTTTCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGActcacgtac < 2:648059/287‑9 (MQ=255) gACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAG‑CCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTAt < 1:600040/247‑1 (MQ=255) aCCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTAt > 2:286319/1‑247 (MQ=255) gTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGAt < 1:1452872/289‑1 (MQ=255) tACTGGAGGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCTGCTCCCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTTCCTGTCCATTCTTGATc > 2:1473121/1‑289 (MQ=255) aGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTg > 1:611164/1‑288 (MQ=255) aGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTg > 1:766018/1‑288 (MQ=255) cGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGgcgc > 1:293297/1‑289 (MQ=255) cGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCAAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGgcgc > 2:940467/1‑289 (MQ=255) gTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATAtt < 2:203273/218‑1 (MQ=255) aCAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGaat < 1:1866605/288‑2 (MQ=255) aTGTATGCCCCGCATCCGTGGCGGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCACAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGaatca < 2:269708/285‑4 (MQ=255) aTGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGaatcactg < 2:144662/288‑7 (MQ=255) aTGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAAATGGCCGACCTGATGAGGACGGTAGTTAAAAAAGTGGGAGAGCTGATAGCACGACTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCTGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGaatcactg < 2:1037368/288‑7 (MQ=255) tGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGaatcactgct < 2:412278/289‑9 (MQ=255) cccAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGttatta < 2:1669545/180‑1 (MQ=255) cccAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGaat < 1:1804179/276‑2 (MQ=255) cccAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGaat > 2:1804179/1‑275 (MQ=255) cccAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTAt > 1:1135199/1‑289 (MQ=255) cAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATgg > 1:307718/1‑289 (MQ=255) aGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATggg > 1:958143/1‑289 (MQ=255) cATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATggggg > 1:1276388/1‑289 (MQ=255) aTCCGGGGCTAAAAAAAGAACCATAC‑GTGTTGTGTTTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGTTGGTGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACATCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATggggg < 2:48317/288‑1 (MQ=255) tCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGat < 1:277484/289‑1 (MQ=255) tCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGat < 1:187126/289‑1 (MQ=255) tGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTAcc > 1:900456/1‑209 (MQ=255) aGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTggg > 2:971663/1‑289 (MQ=255) aTTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCa < 1:911533/289‑1 (MQ=255) tgtgGTG‑TTGTTGGACGAATTTGCCGACCTGATGATGCAGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGACCTGATAGAACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACg < 2:959404/289‑1 (MQ=255) tggtg‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGtt > 2:1513500/1‑289 (MQ=255) tg‑tTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGcc > 2:843998/1‑289 (MQ=255) tg‑tTGGTGGACGAATTTGCCGACCTGATGAGGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGc < 2:356602/288‑1 (MQ=255) ttggttgACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGt > 2:1548548/1‑246 (MQ=255) gggtgACGAATTTGCCGACATTATGGTGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCTCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTTGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTa < 2:307718/286‑1 (MQ=255) gttgACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCg < 1:1214338/270‑1 (MQ=255) tgACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTaa > 2:498520/1‑147 (MQ=255) tgACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACgt > 2:1743017/1‑289 (MQ=255) cGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCGGCGTCCATCGGTTGATGt < 1:1182174/126‑1 (MQ=255) tGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGat > 1:1731082/1‑241 (MQ=255) tgatgaCGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTcg < 1:1473121/289‑1 (MQ=255) taggtaAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGa > 1:1103206/1‑289 (MQ=255) aaaaaGTGGAAGGGCGGTTAGGACGTCGGGCGCCA‑AAGGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCAGCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCa < 2:1260447/289‑1 (MQ=255) tGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCa < 2:76761/253‑1 (MQ=255) ggAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCg < 1:788721/287‑1 (MQ=255) ggAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCg < 1:1556947/287‑1 (MQ=255) agagCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCgtggtg < 1:971663/289‑1 (MQ=255) agaaCTGATGGAACGTC‑GGGGCAACAAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCgtggtg < 2:1103206/289‑1 (MQ=255) ccTGATATCACGTCTGGCGCCA‑AAAGCCCGTGCCGCGTGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCa < 2:1015040/287‑1 (MQ=255) gaCGTCTGGCGCAA‑AGAGCCCGTGCAGGGGGTATGCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGa < 2:1613361/287‑1 (MQ=255) aCGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGa < 1:502036/287‑1 (MQ=255) cGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGAAAg > 1:558727/1‑289 (MQ=255) gTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCATTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCCATGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGCCCAGGGTTCTTTTGTTCGGGATTAGGAAGTTCATGCAGTGGTGCAGGatctggcttt > 2:582963/1‑280 (MQ=255) gTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGAAAgc > 1:1337935/1‑289 (MQ=255) gTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGAAAgc > 1:872240/1‑289 (MQ=255) tGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGAAAGcgcg < 2:1188975/289‑1 (MQ=255) gcgcAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCAc > 2:1698406/1‑212 (MQ=255) gcgcAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCAc < 1:1698406/212‑1 (MQ=255) gcgcAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCg < 2:493459/265‑1 (MQ=255) gcgcAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCg > 1:493459/1‑265 (MQ=255) gcgcAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGAAAGCGCGTg > 2:442009/1‑289 (MQ=255) gcgcAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTAATCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGCAAGCGCGTg > 1:1222265/1‑289 (MQ=255) cgcAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTcg > 1:224162/1‑244 (MQ=255) gcAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGAAAGCGCGTgg < 2:872240/288‑1 (MQ=255) aaaGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTAcc > 2:712782/1‑108 (MQ=255) aaaGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTAcc < 1:712782/108‑1 (MQ=255) aGCCCGTGCCGCTGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGAAAGCGCGTGGTCGCCca < 1:582321/289‑1 (MQ=255) aGCCCCTGCCGCTGGGTTCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCAACGTTTGATGTTATTACTGTGCTGATTAAAGCGAATATTCCGTCCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATGGACTCACGTACCATTCTGGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGTGGGATATGCTCGACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGAAAGCGCGTGGTCGCCca < 2:1222265/289‑1 (MQ=255) tGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTa < 2:51584/185‑1 (MQ=255) tGGCAACTCAGCGTCCATCGGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACTCACGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAATCACTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTa > 1:51584/1‑185 (MQ=255) ||| ATGTCTGCGCTGGGTGTGCGTAATCTGGCGGGTTATAACGAAAAAATTGCTGAAGCCGATCGCATGATGCGTCCGATTCCAGACCCGTACTGGAAGCCGGGTGACAGTATGGATGCCCAGCATCCGGTGCTGAAAAAAGAACCATACATTGTGGTG‑TTGGTTGACGAATTTGCCGACCTGATGATGACGGTAGGTAAAAAAGTGGAAGAGCTGATAGCACGTCTGGCGCAA‑AAAGCCCGTGCCGCGGGTATCCACCTCGTACTGGCAACTCAGCGTCCAAGCGTTGATGTTATTACTGGTCTGATTAAAGCGAATATTCCGACCCGTATCGCCTTTACCGTATCCAGTAAGATTGACAGTCGTACCATTCTTGATCAGGCTGGCGCGGAAAGTCTGCTGGGTATGGGGGATATGCTCTACTCTGGGCCGAACTCCACGTTGCCGGTACGTGTCCATGGTGCTTTTGTTCGCGATCAGGAAGTTCATGCCGTGGTGCAGGACTGGAAAGCGCGTGGTCGCCCACAGTATGTTGATGGCATCACCTCCGACAGCGAAAGC > CP042583/799316‑799873 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |