| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 805,974 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 805,974 | 0 | A | T | 99.6% | 569.3 / NA | 245 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (114/129); total (116/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 805,975 | 0 | G | C | 99.6% | 569.4 / NA | 245 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (115/129); total (116/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 805,976 | 0 | T | A | 100.0% | 581.3 / NA | 245 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (116/129); total (116/129) | |||||||||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
CAAGCAGGGGATCTTTAAAAAGCGCGACCCACAAGGGCATCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCAAGCGGCAAAATTGAGATTTATAGCCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACAGTACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGACCACTCAACGTCCGTCTCCTCTCGCTAAGGG > CP042583/805694‑806254 ||| cAAGCAGGGGATCTTTAAAAAGCGCGACCCACAAGGGCATCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTAc > 1:1190756/1‑289 (MQ=255) cgcgACCCACAAGGGCATCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGaaa > 1:705888/1‑288 (MQ=255) cgcgACCCACAAGGGCATCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAg > 1:44908/1‑289 (MQ=255) ggCATCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTTGTGCGCTGAAACCGGCTTGCCGTcg > 2:699155/1‑288 (MQ=255) cATCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAgg > 2:408993/1‑289 (MQ=255) cATCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGACGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGATGCAGCTTACAGGTTTCCACTATACATCTCGCGTTACCTCAAATTACGGCAACGTTGATGGCCTGGAAGGGGCTTGCCGTCCgg > 2:19062/1‑289 (MQ=255) aTCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGa > 1:832395/1‑289 (MQ=255) tCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATTGGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGaa > 2:1194238/1‑289 (MQ=255) tCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGaa > 1:517156/1‑289 (MQ=255) tCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGaa > 1:1467284/1‑289 (MQ=255) tCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGGATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCGCGCGTTCACTCAACTTACTGCAACGTTGATGTGCTGAAGGCTGCTTGCCGTCAGGaa > 2:1300223/1‑289 (MQ=255) tCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGAAAACCCCCTGACTAAGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTACTCGCAGGCGCTGGCGGACATTGCCGCTACCTGCGAAGTGCTTGACGGCGATCTGACCGCTCCACTGCCGACCCTCACCCCCGGCTTTGAAAGTCATGAGGACACGCTGAACAAACAGTATCCGCTCCAGCTCACACGTTCCCACAATAAATCTAGAGACTCCTGAACTTACGCCCAACTAGATGGGCAGACAGCGGCTTGCCGGCAGGaa > 2:1786458/1‑289 (MQ=255) tGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTgg > 2:653166/1‑289 (MQ=255) ttATAAAGCCGTCCGTGAAGATCCGAAGGAAAACCCACTGACTACGCCATCGGGAAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGAt < 1:796248/288‑1 (MQ=255) cTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCt < 1:36924/288‑1 (MQ=255) ccGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCGTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACGCAACTTACGGCAACGTTGATGGGCTGAAAGCGGACTGCCGTCCGGCAATTTGGATCAAACCGCtcgct > 2:799969/1‑285 (MQ=255) gAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGcc < 1:1738631/288‑1 (MQ=255) ccGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAAc > 1:1021326/1‑289 (MQ=255) cGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAAcg < 2:586338/289‑1 (MQ=255) cAAACCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGt < 1:1242787/287‑1 (MQ=255) aaaCCCACTGACTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGGAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTAt > 2:147627/1‑288 (MQ=255) aaaCCCACGTACTCCGCCATCGGGCAAAATTTACATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGCTCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCTTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATc < 2:1314906/289‑1 (MQ=255) cACTGACTACGCCATCGGGCACATTTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGTATGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGTAGGCGATGTGATCGATCCACTGTCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACaa < 2:440381/289‑1 (MQ=255) cTACGCCATCGGGCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGa < 1:1747028/289‑1 (MQ=255) cgccatcgggCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATaa > 1:1636398/9‑289 (MQ=255) cgccatcgggCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATaa > 2:1714644/9‑289 (MQ=255) cgccatcgggCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATaa > 1:182643/9‑289 (MQ=255) cgggCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAATCAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAg > 1:296915/3‑289 (MQ=255) cgggCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCACCTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAg > 1:1522147/3‑289 (MQ=255) cgggCAAAATTGAGATTTATTCGCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAg < 1:1977223/287‑1 (MQ=255) ttGAGGTTTATTCACATGCGCTTGCTGACATTGCCGCTACCTGAGAATTGCCTGAAGACGATGTGATCGTTCCACTTCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAACCGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTaa < 1:1315039/289‑1 (MQ=255) ttcgcAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCgtggt < 2:1021326/285‑1 (MQ=255) ttcgcAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCgtggt < 1:763839/285‑1 (MQ=255) gCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAg < 1:1678145/245‑1 (MQ=255) aCCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGt < 1:862847/177‑1 (MQ=255) ccTGGGAATTGCATGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGTATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGcc < 1:1353537/289‑1 (MQ=255) tGGGAATTGGCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCAc < 2:1090302/289‑1 (MQ=255) ggAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTg < 2:1667202/168‑1 (MQ=255) aTTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAat < 1:1989453/288‑1 (MQ=255) gCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAatgat > 2:573329/1‑288 (MQ=255) gCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAatgat > 1:1690601/1‑288 (MQ=255) gCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGGGAGGTTCATATTGAGGCGCAAGTGACGCGACGAatgat > 1:1883353/1‑288 (MQ=255) aGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCggg < 1:877457/288‑1 (MQ=255) gATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGtgtg < 1:573329/288‑1 (MQ=255) tgggatcgctcCACTGCCCATCTAAAAGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGt < 2:1328538/285‑1 (MQ=255) gtgacggagcccacgCCAATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCg < 2:176600/275‑1 (MQ=255) gatcgatcCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTCCGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCa < 1:1496411/289‑1 (MQ=255) gatcgatcCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCa < 1:653166/289‑1 (MQ=255) catcgctcCACTGCCAATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCCGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCa < 2:1522147/288‑1 (MQ=255) atcgatcCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGa > 2:479158/1‑227 (MQ=255) accACCGCCGAGCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCTAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTggg < 2:1682268/287‑1 (MQ=255) ccgacagATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTaaa < 2:872992/283‑1 (MQ=255) aCTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGTGTGTGGTCGCACTGGGTGaa < 1:689781/289‑1 (MQ=255) aCTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGATGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGaa < 1:1062252/289‑1 (MQ=255) aCTGCCGAGCTACACGCCGGGATTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGaa < 1:1906206/289‑1 (MQ=255) tGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTAGCCACAACGCCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTTCGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGCGAAgg > 2:838755/1‑289 (MQ=255) tGCCGATCTACACGCCGGGATTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTaa > 1:1786832/1‑214 (MQ=255) cGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAg < 1:1266358/285‑1 (MQ=255) aTCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTg > 2:1210230/1‑286 (MQ=255) cacGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGc > 2:1543484/1‑254 (MQ=255) cacGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGc < 1:1543484/254‑1 (MQ=255) gCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGa > 2:944619/1‑288 (MQ=255) ggCTTTGAAAGTTCTCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCAAGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCCGGGCTGACCCgg > 2:1956486/1‑289 (MQ=255) ggCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCggg > 1:1442315/1‑251 (MQ=255) ggCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCgg > 1:233087/1‑289 (MQ=255) gCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGa > 2:678268/1‑289 (MQ=255) tGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGTGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGGGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCa > 1:1805402/1‑289 (MQ=255) tGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGAcccagcgcct < 1:1319779/289‑8 (MQ=255) aTCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCgtggt < 2:1594798/194‑1 (MQ=255) aTCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGAt < 2:182643/287‑1 (MQ=255) ccGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAgg < 2:233087/289‑1 (MQ=255) gCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACTTGTCGATAAGggt < 1:409419/289‑1 (MQ=255) tGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGggtgg < 2:517156/289‑1 (MQ=255) tGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGggtgg < 1:750182/289‑1 (MQ=255) tGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGGTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGggtgg < 1:1388575/289‑1 (MQ=255) acaaacaGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTg < 1:1601403/289‑1 (MQ=255) caaacaGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACgt < 1:1570801/271‑1 (MQ=255) caaacaGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACgt > 2:1570801/1‑271 (MQ=255) aTCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGAccc > 2:739597/1‑250 (MQ=255) aTCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGAccc < 1:739597/250‑1 (MQ=255) aTCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTa < 2:10516/285‑1 (MQ=255) aTCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTa < 2:31355/285‑1 (MQ=255) aTCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGt > 1:728643/1‑289 (MQ=255) tccgtgtcAGCTTACAGGTTTCCGCTAGAAATCGCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTa < 2:1388192/282‑1 (MQ=255) aGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGGTCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGAcc > 2:987325/1‑287 (MQ=255) aGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGAcc > 1:934502/1‑287 (MQ=255) cTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGt < 1:1592538/209‑1 (MQ=255) cAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGACCACTCAAcg > 1:808283/1‑289 (MQ=255) tttCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGACCACTCAAcg < 2:1636398/285‑1 (MQ=255) tCCACTGTAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGAt > 2:256157/1‑248 (MQ=255) tCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTg > 2:791261/1‑259 (MQ=255) tCCACTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCAAAAAACGCGGTATACACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGAGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGAAGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGACCACTCAacgtacgt > 1:96125/1‑288 (MQ=255) tCCACTATAAATCTCGCGTTCACACAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGACCACTCAAcgtccg > 2:1807855/1‑287 (MQ=255) aCTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTg > 2:72825/1‑256 (MQ=255) cTATAAATCTCGCGTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGACCACTCAACGTCCGTctcct < 1:1025412/289‑1 (MQ=255) gcgTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGggtgg < 2:1131583/241‑1 (MQ=255) gcgTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGggtgg > 1:1131583/1‑241 (MQ=255) gcgTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGACCACTCAACGTCCGTctcct > 2:1402654/1‑278 (MQ=255) gcgTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGACCACTCAACGTCCGTctcct < 1:1402654/278‑1 (MQ=255) gcgTTCACTCAACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGACCACTCAACGTCCGTCTCCTCTCGCTAAggg > 1:269832/1‑289 (MQ=255) ||| CAAGCAGGGGATCTTTAAAAAGCGCGACCCACAAGGGCATCACGTTGCTTATAAAGCCTTCCGTGAAGATCCGCAGGCAAACCCACTGACTACGCCAAGCGGCAAAATTGAGATTTATAGCCAGGCGCTGGCTGACATTGCCGCTACCTGGGAATTGCCTGAAGGCGATGTGATCGATCCACTGCCGATCTACACGCCGGGCTTTGAAAGTTATCAGGATCCGCTGAACAAACAGTATCCGCTGCAGCTTACAGGTTTCCACTATAAATCTCGCGTTCACAGTACTTACGGCAACGTTGATGTGCTGAAAGCGGCTTGCCGTCAGGAAATGTGGATCAACCCGCTTGATGCCCAAAAACGCGGTATCCACAACGGCGATAAAGTCAGGATCTTTAACGATCGTGGTGAGGTTCATATTGAGGCGAAAGTGACGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACGTGTCGATAAGGGTGGTTGTATTAACGTACTGACCACTCAACGTCCGTCTCCTCTCGCTAAGGG > CP042583/805694‑806254 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |