| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 819,836 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 819,836 | 0 | A | T | 100.0% | 540.0 / NA | 230 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (109/121); total (109/121) | |||||||||||
| * | CP042583 | 819,837 | 0 | G | C | 99.6% | 533.3 / NA | 230 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (108/120); total (109/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 819,838 | 0 | T | A | 99.6% | 543.8 / NA | 230 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base A (108/121); total (109/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
GCAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGAGCCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGAAGTGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGAGCAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTGCGTGGCGTGGAGCAGCTGGGGCAGGTACGTCTGGCGA > CP042583/819556‑820109 ||| gcAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTTCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAgcggcg < 1:784153/289‑1 (MQ=255)gcAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAgcggcg > 2:1441331/1‑289 (MQ=255) tttATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGtt < 1:269652/289‑1 (MQ=255) aTCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTa > 1:157225/1‑289 (MQ=255) aTCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTGTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGACGGCGTTCGATCTCCAACGTATGGCATTTTATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTa < 2:1926557/289‑1 (MQ=255) aaaGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTatgatg > 2:1546670/1‑289 (MQ=255) tCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGAt < 2:267985/289‑1 (MQ=255) tCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGAt < 1:1546670/289‑1 (MQ=255) tCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGAt < 1:1393348/289‑1 (MQ=255) gACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGAt > 1:97428/1‑262 (MQ=255) gACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGAt < 2:97428/262‑1 (MQ=255) gACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTAc > 1:1022908/1‑289 (MQ=255) tGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 2:1009664/289‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg > 2:1121892/1‑289 (MQ=255) tGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCAgg < 1:168465/289‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGCGACTAAACCACGTTAAGGGCATCAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 2:1486971/289‑1 (MQ=255) tGCTGTTAGCGGATAACCGACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATATCCACCGTATGGAATTTGATAAAGTGCCTTTTGACTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 2:50298/289‑1 (MQ=255) ttttAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCgt > 2:1205391/1‑289 (MQ=255) ttttAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGCTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCgt > 2:574287/1‑289 (MQ=255) ttAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTCGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCgttg < 2:1956571/289‑1 (MQ=255) ggATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATTAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTta < 2:1419746/287‑1 (MQ=255) gATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTtata < 2:1997593/288‑1 (MQ=255) aTAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 2:1595350/277‑1 (MQ=255) aTAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg > 1:1595350/1‑277 (MQ=255) gCATAAATATGAAGGCTTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTGTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGt < 2:137796/288‑1 (MQ=255) tAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATc < 2:634735/242‑1 (MQ=255) tAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATc > 1:634735/1‑242 (MQ=255) tAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTa > 2:1569568/1‑278 (MQ=255) tAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGAt > 1:1178762/1‑289 (MQ=255) tAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTAGCGTCGTTATTAATCTGGCGGTGTTATACCGCCTGGTAATGTGTTTgtt > 2:152735/1‑287 (MQ=255) aaTGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGgcg < 2:1797814/289‑1 (MQ=255) tGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGgcgc > 1:826020/1‑288 (MQ=255) aaGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCg > 2:725572/1‑198 (MQ=255) gTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGaa < 1:589869/289‑1 (MQ=255) gTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGaa < 2:910375/289‑1 (MQ=255) gTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGa < 1:1441331/288‑1 (MQ=255) gTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTCTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGGTTTATGATGATTTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCGGGTAATGTGGTTGATGgcgccacgtgaa > 2:1977315/1‑281 (MQ=255) ccACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGTCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGaa < 2:1023430/289‑1 (MQ=255) cGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGAtc < 2:826020/289‑1 (MQ=255) tATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGtt > 1:65954/1‑180 (MQ=255) tATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGtt < 2:65954/180‑1 (MQ=255) tATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCg < 1:1968856/232‑1 (MQ=255) tATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGAgct > 1:321417/1‑288 (MQ=255) aTGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGAtc > 1:1644862/1‑286 (MQ=255) ttGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAgg < 1:1662707/289‑1 (MQ=255) ttGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAg > 1:1532537/1‑288 (MQ=255) aaaGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGc < 2:1671924/289‑1 (MQ=255) aGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCa > 1:1336421/1‑289 (MQ=255) cGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 2:1734749/181‑1 (MQ=255) cGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTggt < 1:1121892/289‑2 (MQ=255) cGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTATATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTTTTATACCGCCTGGTAACGTGGTTGATGGCGCACAGTGACAAACTGGAAGCTCTTCTGGAAGGACAGCCAGCTGTCATTATTGACGATGGCGCGGGGGCCTgg > 2:1336364/1‑288 (MQ=255) tCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTggtcgaaa < 1:1564297/289‑7 (MQ=255) tttATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTggtcgaaac > 1:1033202/1‑281 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg > 1:375829/1‑171 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 2:375829/171‑1 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTa < 1:714598/191‑1 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAAt < 2:583871/193‑1 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGgcg > 1:1953664/1‑206 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGaa < 1:1848926/260‑1 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCaa > 1:1514140/1‑289 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCaa > 2:1643155/1‑289 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCaa > 1:943230/1‑289 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCAGGTGGTCCCGGTACTCATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCaa > 1:1739365/1‑289 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTCTATGATGATGTGCCGATGGGCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGGAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTTGCGTTATTGAAGATGACGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCaa > 2:1293236/1‑289 (MQ=255) taCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAAt < 2:1514140/289‑1 (MQ=255) tttGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGgcg > 2:198658/1‑201 (MQ=255) tttGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGgcg < 1:198658/201‑1 (MQ=255) tttGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAAc > 1:419115/1‑288 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAgg > 1:1712949/1‑231 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAgg < 2:1712949/231‑1 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTcc > 1:1483682/1‑289 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTcc > 2:1849274/1‑289 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTcc > 1:1227759/1‑289 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTcc > 1:559202/1‑289 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAAt < 2:1436897/179‑1 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAAt > 2:1561253/1‑276 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATg > 1:289253/1‑288 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGa > 2:105697/1‑289 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGa > 2:448759/1‑289 (MQ=255) cTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACg > 1:403076/1‑289 (MQ=255) tttttGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACgg < 2:321417/289‑1 (MQ=255) tttGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGaa > 1:22197/1‑289 (MQ=255) aagaactggctGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTg > 2:479740/11‑289 (MQ=255) tCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGc > 2:791895/1‑250 (MQ=255) tCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGa < 2:884266/289‑1 (MQ=255) cTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGt < 1:1893093/289‑1 (MQ=255) tCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGGTCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAACCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGtt < 1:849731/289‑1 (MQ=255) gAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGc < 2:1650171/288‑1 (MQ=255) ggCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTgcgtggcg < 1:1260145/288‑1 (MQ=255) ggCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTgcgtggcg < 1:510859/288‑1 (MQ=255) atgtcgcTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGGTCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTGCGTGGCGTGGag < 2:118195/282‑1 (MQ=255) atgtcgcTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCt < 1:1107823/211‑1 (MQ=255) atgtcgcTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGAGGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGCGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACACCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTAATGGAGCTCAGATTGCGTGGCTTGgcgc > 2:1898308/7‑289 (MQ=255) gtcgcTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGATCTACGATTTCGTGGCGTGgaggag > 2:1281242/5‑289 (MQ=255) cgcTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTGCGTGGCGTGGagcagc < 1:105697/286‑1 (MQ=255) gTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTGCGTGGCGTGGAGCAGCTgggg < 1:1281242/289‑1 (MQ=255) taaGTTTTAATCATTCTGACGGTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGGCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGGAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTGCGTGGCGTGGAGCAGCTGGGGCAgg < 1:579887/288‑1 (MQ=255) gAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTGCGTGGCGTGGAGCAGCTGGGGCAgg < 1:908631/289‑1 (MQ=255) ttttAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTGCGTGGCGTGGag < 1:1042357/272‑1 (MQ=255) aTCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTGCGTGGCGTGGAGCAGCTGGGGCAGGTACGTCTgg < 1:918645/289‑1 (MQ=255) ||| GCAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGAGCCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGAAGTGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGAGCAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTGCGTGGCGTGGAGCAGCTGGGGCAGGTACGTCTGGCGA > CP042583/819556‑820109 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |