Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 831,039 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 831,039 | 0 | A | T | 99.3% | 690.7 / NA | 298 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 831,040 | 0 | G | C | 100.0% | 701.7 / NA | 298 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 831,041 | 0 | C | G | 100.0% | 705.8 / NA | 298 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (169/129); total (169/129) |
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
ACGTAACCAGGTTGCTCTGGTGAGCCAGAATGTCCATCTGTTTAACGATACGGTTGCTAACAACATTGCTTACGCACGGACTGAACAGTACAGCCGTGAGCAAATTGAAGAAGCGGCGCGTATGGCCTACGCCATGGACTTCATCAATAAGATGGATAACGGTCTCGATACAGTGATTGGT‑GAAAACGGCGTGCTGCTCTCTGGCGGTCAGCGTCAGCGTATTGCTATCGCTCGAGCCTTGTTGCGTGATAGCCCGATTCTGATTCTGGACGAAGCTACCAGCGCTCTGGATACCGAATCCGAACGTGCGATTCAGGCGGCACTGGATGAGTTGCAGAAAAACCGTACCTCTCTGGTGATTGCCCACCGCTTGTCTACCATTGAAAAGGCAGACGAAATCGTGGTCGTCGAGGATGGTGTCATTGTGGAACGCGGTACGCATAACGATTTGCTTGAGCACCGCGGCGTTTACGCGCAACTTCACAAAATGCAGTTTGGCCAATGATCGAAAAAATCTGGTCTGGTGAATCCCCTTTGTGGCGGCTATTGCTGCCACTCTCC > CP042583/830759‑831319 ||| ccAGGTTGCTCTGGTGTCGCAGAATGTCCATCTGTTTAACGATACGGTTGCTAACAACATTGCTTACGCACGGACTGAACAGTACAGCCGTGAGCAAATTGAAGAAGCGGCGCGTATGGCCTACGCCATGGACTTCATCAATAAGATGGATAACGGTCTCGATACAGTGATTGGT‑GAAAACGGCGTGCTGCTCTCTGGCGGTCAGCGTCAGCGTATTGCTATCGCTCGAGCCTTGTTGCGTGATAGCCCGATTCTGATTCTGGACGAAGCTACCTCGGCTCTGGATAcc > 1:1745242/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |