Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 876,010 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 876,010 | 0 | A | T | 99.2% | 1129.1 / NA | 478 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (232/242); minor base C (3/1); total (235/243) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.65e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 876,011 | 0 | G | C | 99.2% | 1106.8 / NA | 478 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base C (232/239); total (235/243) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 876,012 | 0 | C | G | 99.6% | 1124.2 / NA | 478 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base G (234/242); total (235/243) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 478 total aligned reads displayed.
TGTAACGTCCATCATGCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCAGCAAGATGCCGAGCACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑AGCATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCAGCGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGAGCTGGGATCGTCAACCTGAAAGTGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGGCGCTCAT > CP042583/875727‑876291 ||| ccATCATGCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTTCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGGGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCCCGACAGTGAAAGAATCCACTGGATTTCTGAAGTTGTTGAGTTGGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGt > 1:724382/1‑289 (MQ=255) ccATCATGCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGt > 1:1601835/1‑289 (MQ=255) ccATCATGCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGt > 1:378035/1‑289 (MQ=255) tCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGGTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGGCGTTTTCGTTATcgcg > 1:293831/1‑289 (MQ=255) ttCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGt < 2:68875/289‑1 (MQ=255) ccGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGt > 1:912495/1‑287 (MQ=255) cGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGACCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGc > 1:848864/1‑288 (MQ=255) cTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTct < 2:1636894/288‑2 (MQ=255) tatTTTGCCCGTCAGGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTTGAGGATTCTGGCTGGGGTCATTCTGTTATGGATGGAAGGGTCTTATCCCGGCGCTGCGGTGAGCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTTGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTctcggcg < 2:1363629/289‑7 (MQ=255) tttGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTg < 2:237774/289‑1 (MQ=255) ttGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTgg < 2:790392/289‑1 (MQ=255) tGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGt > 1:463382/1‑289 (MQ=255) gCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTg < 2:1246715/289‑1 (MQ=255) gCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTg < 2:948827/289‑1 (MQ=255) atGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCGAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATgg < 1:1120132/289‑1 (MQ=255) atGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATgg < 1:184121/289‑1 (MQ=255) ggATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTa > 1:196329/1‑289 (MQ=255) gATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTTGTCTCGGCGCTGGTGCGGAGTGGAGGTTTat > 2:1183731/1‑288 (MQ=255) gATTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTaa > 2:96685/1‑289 (MQ=255) aTTTATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCGGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCGTGCGCGTATGGGGGGTTTAAt > 2:549171/1‑289 (MQ=255) tttATTAGGCTCGAAGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAAt < 1:739473/288‑1 (MQ=255) ctcgaaGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTctcggcg < 2:1156700/252‑7 (MQ=255) ctcgaaGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAAGGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCTCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTAt > 2:1753241/5‑289 (MQ=255) tcgaaGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTAt < 1:1334265/285‑1 (MQ=255) tcgaaGATGCCGTCGACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATc < 1:1091635/286‑1 (MQ=255) tgccgtcgaCGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAAt < 1:934948/281‑1 (MQ=255) gccgtcgaCGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTct < 2:518381/235‑2 (MQ=255) cgtcgaCGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATgg < 1:709009/283‑1 (MQ=255) gaCGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCa < 2:598887/288‑1 (MQ=255) ggTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTg < 1:597995/217‑1 (MQ=255) ttCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTg < 1:1300290/224‑1 (MQ=255) ttCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTg > 2:1300290/1‑224 (MQ=255) ttCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCCCGACAGTGCAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTCCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGGCTATGGGCGGTTTAATGAGTATTTAGCCGGCAATGGGTGACTTTA‑TGTTTGCTTGAgtcg > 2:1273459/1‑288 (MQ=255) cTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCa < 2:475141/289‑1 (MQ=255) ttATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATgg < 2:88916/259‑1 (MQ=255) gAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGACTGCATGTGATTTATGAAGTGGTTGAGTTTGTAGGACGCTGG‑TCGATGATTGACGTTGTCGTTAATGCGGTGCTGTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATTAGTATTTATCCGGCTATGGGAGCATTAAGTGTATG‑TTTAGTCGTCTTAATgcta > 2:293857/1‑286 (MQ=255) ggCGAAGGTTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGACAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATTGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACa < 2:1983897/287‑1 (MQ=255) aGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATgg > 2:1101820/1‑253 (MQ=255) aGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACaa > 2:460520/1‑289 (MQ=255) aGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACa < 2:378035/288‑1 (MQ=255) aaGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGtt < 2:1398165/262‑1 (MQ=255) aaGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGtt > 1:1398165/1‑262 (MQ=255) aaGGCTCTTATCCCGTAGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATAGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGAATTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATAGCGGTGCTCTCGGCGCTGGGGCGTATGGGAGGTTGAATGAGTATTTATGCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGGTTGCTTTAGTCGTAATAATGACatagtt > 1:1787761/1‑284 (MQ=255) aGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGtt < 2:670833/288‑1 (MQ=255) ctctTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGtttt < 1:343450/287‑1 (MQ=255) ctctTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGtttt < 1:1474183/287‑1 (MQ=255) aTCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTAt < 2:1003950/289‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGtt > 2:319032/1‑167 (MQ=255) tCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTg < 1:1169928/182‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATgg < 2:1512529/234‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGtt > 1:1502796/1‑289 (MQ=255) ggCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAAt > 1:1160355/1‑195 (MQ=255) ggCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCCCgg > 1:1253695/1‑161 (MQ=255) atGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAAc < 1:483878/289‑1 (MQ=255) atGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAAc < 1:1752488/289‑1 (MQ=255) atGGTGACAACGTTAAGGTGTGTTGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGGGGGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGGTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAAc < 2:1734560/289‑1 (MQ=255) tGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGtttt > 1:1880049/1‑246 (MQ=255) tGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCaa > 2:879399/1‑287 (MQ=255) tGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATGAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGCTCGTGAGCCTGa > 2:528917/1‑289 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGt > 2:62768/1‑264 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGt < 1:62768/264‑1 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaa > 1:529841/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaa > 1:54666/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaa > 1:1556015/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaa > 1:767925/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAAACTGaa > 1:798992/1‑288 (MQ=255) ccAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCAAGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGaa > 1:1917731/1‑288 (MQ=255) aaaGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAgtc < 2:1031655/214‑1 (MQ=255) aGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 2:1877197/289‑1 (MQ=255) aGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATga < 1:96685/289‑1 (MQ=255) aatgatCGCAATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATgag < 1:1000192/288‑1 (MQ=255) tgtatggCCATCGCGTGGCTTGGTTGGGATGCCAAAGGGCATGACAAGCGCGAAAGTGGAAGGATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGTTGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGTTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATATGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATgagg < 2:912644/283‑1 (MQ=255) tgatCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATgag < 2:1556015/287‑1 (MQ=255) atCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTctcggcg < 2:336537/141‑7 (MQ=255) atCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑t < 1:1528478/194‑1 (MQ=255) cATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGa < 2:397437/289‑1 (MQ=255) gTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCTGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTa < 1:2074/288‑1 (MQ=255) ggCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg < 1:1239016/288‑1 (MQ=255) ggCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTATGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATg < 1:1377899/288‑1 (MQ=255) cTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGaa > 1:1638517/1‑289 (MQ=255) tgtTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCt > 2:1803543/1‑289 (MQ=255) ggATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCt < 2:738337/269‑1 (MQ=255) aTGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATg > 1:1984514/1‑289 (MQ=255) ccAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATgggg > 2:158349/1‑289 (MQ=255) cATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGAcc > 1:1516584/1‑208 (MQ=255) aTGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAAc > 1:1691460/1‑231 (MQ=255) tGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTAGGGAATCTAATAATGGGGCAGCCaaaa > 2:1528846/1‑288 (MQ=255) agggcgACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTTTGAAGTTGTTGGGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTTTCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGa < 2:1495486/286‑1 (MQ=255) aGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGa < 1:438873/289‑1 (MQ=255) aGCGCGAAAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGa < 1:680784/289‑1 (MQ=255) aaGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTTACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACt < 1:1043335/288‑1 (MQ=255) aTGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGtct < 2:848864/289‑1 (MQ=255) tggaTTTGATTTATGAAGGTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGGTCGCA‑GATTGACGTTTTCGTTAACGCGGTGCTCTCGGGGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGtctc < 1:1194642/286‑1 (MQ=255) tttGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGa > 2:1451738/1‑229 (MQ=255) tttATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTgg < 1:885277/288‑1 (MQ=255) aTGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGa > 2:1213018/1‑259 (MQ=255) aTGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGatat > 2:354763/1‑289 (MQ=255) tGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGTAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGgc > 2:1334852/1‑289 (MQ=255) tGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGgc > 1:316875/1‑289 (MQ=255) tGTAGGCCGCTGG‑TCGATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCTCGGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGTCGTGGGATCGTCAACCTGAATCAGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGgc > 1:1434670/1‑289 (MQ=255) ||| TGTAACGTCCATCATGCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCAGCAAGATGCCGAGCACGATTCTCGCTGGGGTCATTCTGTTATGGAGCGAAGGCTCTTATCCCGTCGCTGCGGTGATCTTTCTGGCCAGTATTATGGTGCCAACGTTAAAGATGATCGCCATCGCGTGGCTGTGTTGGGATGCCAAAGGGCATGGCAAGCGCGACAGTGAAAGAATGCATTTGATTTATGAAGTTGTTGAGTTTGTAGGCCGCTGG‑AGCATGATTGACGTTTTCGTTATCGCGGTGCTCAGCGCGCTGGTGCGTATGGGAGGTTTAATGAGTATTTATCCGGCAATGGGTGCATTAA‑TGTTTGCTTTAGTCGTCATAATGACAATGTTTTCTGCTATGACGTTTGACCCGCGTTTGAGCTGGGATCGTCAACCTGAAAGTGAGCATGAGGAGTCCTGACAGTATGGAATCTAATAATGGGGAAGCCAAAATCCAGAAAGTGAAGAACTGGTCTCCCGTGTGGATATTTCCTATCGTCACGGCGCTCAT > CP042583/875727‑876291 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |