Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 894,380 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (166/182); minor base T (1/0); total (167/182) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 894,382 | 0 | T | A | 100.0% | 837.1 / NA | 349 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Only 100 of 349 total aligned reads displayed.
TTCCGGCAGACAGATAGGTGTTCAGAATAGGTCCGAGGATATAACCCAGAAAACCGGTAAAGGCGAATGCGGAGATAATCCCGGTCGGCTTATTCGCC‑GTTTTATAGGTCAGGAACATCAAACCATACATACCCACCAGCGTCAGAATCAGACCCGGAGATGGCAGCATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCGCTAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGACTTGTACGGTCATGACTAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTATGACAGATGTAATTAATTAAGCAGCATAATGATAATGCGTAAGGGCACCCAGAAGTTTTACCCATCTTTACGCATTTGATCTGGAACAGGTTTAACAGCGGATTATCAGGTCATTAAGCAAATATAACGCCCTGAGAATTTCGACAGGCAAAAGAAAAAGGGGTTAGCATTTAGCTAACCCCTTATCTTATTTGGCGGAAGCGCAGAGATTCGAACTCTGGAACCCTTTCGGGTCGCCGGTTT > CP042583/894100‑894660 ||| ttCCGGCAGACAGATAGGTGTTCAGAATAGGTCCGAGGATATAACCCAGAAAACCGGTAAAGGCGAATGCGGAGATAATCCCGGTCGGCTTATTCGCC‑GTTTTATAGGTCAGGAACATCAAACCATACATACCCACCAGCGTCAGAATCAGACCCGGAGATGGCAGCATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGCCATGTGAAGAACt > 1:329306/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |