Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 901,026 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 901,026 | 0 | A | T | 100.0% | 1078.0 / NA | 453 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (231/222); total (231/222) | |||||||||||
* | CP042583 | 901,027 | 0 | G | C | 99.6% | 1063.2 / NA | 453 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base C (230/219); minor base A (0/2); total (231/222) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 901,028 | 0 | T | A | 99.6% | 1062.5 / NA | 453 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (230/219); total (231/222) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 453 total aligned reads displayed.
TCGGGTTATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTAAGCCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGAGTTTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGAATAAATACCAGCACCTGCTGGTGACGTGGCTGGTGGCGTTCGGTAGTAATCTCTCTGCGTTGTGGATATTGAATGCCAACGGTTGGATGCAATACCCGACCGGTGCGCATTTTGATATCGACACCCTGCGTATGGAGATGACCAGCTTCAGCGAGCTGGT > CP042583/900746‑901306 ||| tCGGGTTATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCTTTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTAt < 1:1771143/289‑1 (MQ=255) tCGGGTTATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAACACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGTTACTAACTGGTCATTCTAt > 2:1378330/1‑289 (MQ=255) tCGGGTTATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTAt < 1:1793642/289‑1 (MQ=255) gTTATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCa > 1:120544/1‑289 (MQ=255) ttATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCa > 1:190409/1‑288 (MQ=255) ctctctTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCATAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGTTTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTAtgtgt > 1:130030/1‑288 (MQ=255) ctctctTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTgg > 1:1335671/1‑289 (MQ=255) tctctTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGTTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTTGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGCggg > 1:1823189/1‑289 (MQ=255) ctctTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGc < 1:831481/289‑1 (MQ=255) tctTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCg < 2:1498968/289‑1 (MQ=255) tGCGCATGTGGGGTGTCATTGATTTAGCGCGCTGGCAGGTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACGTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGAGTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTCCCGGCCTGAACATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCAcc > 1:997501/1‑289 (MQ=255) gtgGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCg > 1:898309/1‑289 (MQ=255) gggATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGAt > 1:1438196/1‑289 (MQ=255) aTGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATgg < 1:752699/288‑1 (MQ=255) gTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAg < 2:898309/289‑1 (MQ=255) aTTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCAt < 1:1092311/289‑1 (MQ=255) aTTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTCGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACGATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCAt > 1:727987/1‑289 (MQ=255) atttatcgcGCTGGCAGTTTGCTCTGACAGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTAGCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATTTTTTTGGCGTCCCGCTGGCGTTGGAAGCATTAAt > 2:781129/9‑289 (MQ=255) tttatcgcGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATg > 2:1219992/8‑289 (MQ=255) 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aCCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAACCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTg < 2:455610/289‑1 (MQ=255) gcgcTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCg < 1:1629494/289‑1 (MQ=255) gcgcTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCg < 1:13691/289‑1 (MQ=255) gcgcTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCg < 1:1490370/289‑1 (MQ=255) gcTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTTGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCggg < 2:1852767/289‑1 (MQ=255) cTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCggg < 2:1184329/288‑1 (MQ=255) cTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGttct > 1:1128486/1‑287 (MQ=255) tttATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGCTATGACGCGCTTCTGGGGTTAGCTCTTCGGTTTCATTTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGCTTGGTACTAACTGGTCATTCCATTCAAACTATGTTGGCGATATTTTTGGCGATCCTCTGGCGATGGACGCATTAATGCCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGCCGGGCGGttcttattc > 2:1174834/1‑289 (MQ=255) tATTTGTCCCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTTGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCTGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTTGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGCCTGTTCTTCTTCg > 1:569137/1‑288 (MQ=255) 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tATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCg > 1:1049224/1‑288 (MQ=255) tATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAAGGTCCTTCTTCCTCGAACCCACCTTTGTCGGGCGGTTCTTCTTCg > 2:848244/1‑288 (MQ=255) tACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCa > 1:948348/1‑289 (MQ=255) 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gTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGAATAAATACCAGCACCTGCTGGTGACGTGGCTGGTGGCGTTCGGTTCAAATCTCTCTGCGTTGTGGATATTGAATGCCAACGGTTGGATGCAATACCCGACCGGTGCGCATTTTGATATCGACACCCTGCGTATGGAGATGACCAg < 2:1969137/288‑1 (MQ=255) ttCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGAATAAATACCAGCACCCGCTGGTGACGTGGCTGGTGGCGTTCGGTTCAAATCTCTCTGCGTTGTGGATATTGTATGCAAACGGGTTGATGCAATACCCGACCGGTGCGCATTTTGATTAAGACCCCATGTGTTCGGACATGACCAGCtt > 2:1920984/1‑289 (MQ=255) tACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGAATAAATACCAGCACCTGCTGGTGACGTGGCTGGTGGCGTTCGGTTCAAATCTCTCTGCGTTGTGGATATTGAATGCCAACGGTTGGATGCAATACCCGACCGGTGCGCATTTTGATATCGACACCCTGCGTATGGAGATGACCAGCTTCAGCGAGCt < 1:1149514/288‑1 (MQ=255) ||| TCGGGTTATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTAAGCCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGAGTTTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGAATAAATACCAGCACCTGCTGGTGACGTGGCTGGTGGCGTTCGGTAGTAATCTCTCTGCGTTGTGGATATTGAATGCCAACGGTTGGATGCAATACCCGACCGGTGCGCATTTTGATATCGACACCCTGCGTATGGAGATGACCAGCTTCAGCGAGCTGGT > CP042583/900746‑901306 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |