Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,455,111 | 6 bp→TCATCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,455,111 | 0 | A | T | 99.3% | 638.8 / ‑5.3 | 271 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (117/150); minor base C (2/0); total (119/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.95e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,455,112 | 0 | G | C | 99.2% | 623.8 / ‑3.3 | 271 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base C (117/149); minor base T (0/2); total (119/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.06e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,455,113 | 0 | T | A | 98.5% | 624.8 / ‑3.1 | 271 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); major base A (116/148); minor base C (1/3); total (119/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.34e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,455,114 | 0 | A | T | 98.2% | 624.0 / ‑5.3 | 271 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/3); new base T (117/149); total (119/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,455,115 | 0 | G | C | 98.9% | 621.4 / NA | 271 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base C (117/149); total (119/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.85e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,455,116 | 0 | C | G | 98.9% | 627.2 / NA | 271 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/3); new base G (117/148); total (119/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
ATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTAGCGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGAGTTTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTAGTAGC‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCAGC‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGAGTGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCAGCTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCC > CP042583/1454841‑1455386 |||||| aTGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGgtg > 1:1849961/1‑289 (MQ=255) cTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCa > 1:1999205/1‑289 (MQ=255) ttCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCAt > 2:595375/1‑288 (MQ=255) ttCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCAt > 2:546559/1‑288 (MQ=255) cGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTctc < 1:595375/289‑3 (MQ=255) ggttcggcgGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTAtg < 1:633158/283‑1 (MQ=255) tcggcgGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGa < 1:37987/286‑1 (MQ=255) cggcgGTCATATTGGTTGAAGGGATGGTGTAATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGTTATATGTTGATCAATAATATCTGGTACGGCTTTGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGAGCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATGCTCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGAt < 2:1482652/287‑1 (MQ=255) cATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTctcgacctt < 1:1439805/273‑9 (MQ=255) ggTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGAt > 1:1673231/1‑288 (MQ=255) tAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGccc > 2:688795/1‑289 (MQ=255) aGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTACCTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCCTCG‑GTACTGTTCGGTTTAGCCGCATCCTCG‑ACCTTTTATTGAATTGTGGTTGGGGTGCCCaaa > 2:1221343/1‑289 (MQ=255) tggtgtcatttGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGGTTCATAG‑‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGc > 1:1020243/9‑289 (MQ=255) tggtgtcatttGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTTATTTGGGTGTGGATGCCCAAATATGc > 2:1971718/9‑289 (MQ=255) tggtgtcatttGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGc > 2:811332/9‑289 (MQ=255) tggtgtcatttGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGc > 2:620208/9‑289 (MQ=255) ggtgtcatttGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCg < 2:793361/282‑1 (MQ=255) gCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCtttt > 1:1571469/1‑286 (MQ=255) aaTGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGt < 1:577585/289‑1 (MQ=255) aaTGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAGATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATgtcagaa > 2:1765019/1‑280 (MQ=255) gTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCAt > 1:1036943/1‑289 (MQ=255) gTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCAt > 2:1956043/1‑289 (MQ=255) gTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCAt > 1:706753/1‑289 (MQ=255) atGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 1:168407/289‑1 (MQ=255) atGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 2:336391/289‑1 (MQ=255) atGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGAGGTGTGGATGCCAAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 1:1744828/289‑1 (MQ=255) gTTGCTCAATAATATCTGGTACGTCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCAtc < 1:1478049/289‑1 (MQ=255) gCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATctct < 1:1189286/289‑1 (MQ=255) cTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa > 1:1873484/1‑283 (MQ=255) cTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 2:1873484/283‑1 (MQ=255) cAATAATTGCTGGTACGGCTATAGGCTGATTATTCAGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCAAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCttat < 2:1066132/289‑1 (MQ=255) aataatATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGccc > 2:1148825/1‑228 (MQ=255) aataatATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 1:269182/280‑1 (MQ=255) taataTCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTAc > 2:1530405/1‑289 (MQ=255) tatCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGt > 1:28590/1‑289 (MQ=255) ggTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGAt > 1:471893/1‑202 (MQ=255) tACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAg > 2:1390780/1‑255 (MQ=255) tACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCttatta < 2:509407/278‑1 (MQ=255) tACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCttatta > 1:509407/1‑278 (MQ=255) tACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGc < 1:1221343/288‑1 (MQ=255) tACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGc > 1:162599/1‑288 (MQ=255) cGGCTTTGGGTTGGTGATTCGGGGTATTCTCGTTGTCCTGATCACGTTGTTCAGGTTGAAAACCAAATTCCCAAGCAAGTTGGTGGACGCAAGCGTAACTAATGAGTTACCGCAAATGACAAGAAAACGGTTAGTCTGCCT‑GAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTGATGTGATTGTGGTGTTGATGCCCAAATATGCGATTGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGctcg < 2:1601975/288‑4 (MQ=255) aTGGGTTGAGTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGctcgttggt < 2:1907239/289‑9 (MQ=255) aTGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGctcgttggt < 1:1837004/289‑9 (MQ=255) tGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTTGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa > 1:753877/1‑255 (MQ=255) tGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTTGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 2:753877/255‑1 (MQ=255) attattCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGGAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa > 2:1372165/1‑253 (MQ=255) attattCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGGAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 1:1372165/253‑1 (MQ=255) attattCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCAtc > 1:126979/1‑255 (MQ=255) attattCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCAtc < 2:126979/255‑1 (MQ=255) attCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATctct < 2:1665926/255‑1 (MQ=255) gTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTg > 1:865632/1‑288 (MQ=255) tGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTAtg < 2:426928/161‑1 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa > 1:1636012/1‑227 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCttatta > 1:433964/1‑237 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGaaaaaa > 1:1384274/1‑289 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGaaaaaa > 2:1824089/1‑289 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGaaaaaa > 2:302802/1‑289 (MQ=255) tCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCTCATTACTGAAAAAAAt > 2:1708771/1‑289 (MQ=255) cGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGt < 1:132556/289‑1 (MQ=255) cGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGt < 1:1060672/289‑1 (MQ=255) gCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAAGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTc < 1:923050/289‑1 (MQ=255) gATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCgg < 1:822016/289‑1 (MQ=255) gATACTGTTGAAAAGCCAATGCCCCAACCAGTTGGTGGACGCCAGCTTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGTT‑GTTTCATCT‑GTACTGTTCGGTGTTGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCgg < 2:1020243/289‑1 (MQ=255) tGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGc > 2:1783070/1‑288 (MQ=255) tGTTGAAAAGCAAATTCCCCGGCCAGTTGGTGGACAGCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTTGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCAt < 1:913311/289‑1 (MQ=255) tGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCAt < 2:52963/289‑1 (MQ=255) gTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATc < 2:1988569/289‑1 (MQ=255) ttGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTAt > 2:1046447/1‑227 (MQ=255) aGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGCCGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAA‑GT‑GGTTGCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTa < 2:1634509/289‑1 (MQ=255) aGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTa < 1:1310189/289‑1 (MQ=255) aGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTa < 1:1783070/289‑1 (MQ=255) aGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTa < 1:334279/289‑1 (MQ=255) aGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTa < 1:53733/289‑1 (MQ=255) aaTTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCa < 2:922148/251‑1 (MQ=255) ggACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGc < 1:1530405/288‑1 (MQ=255) ggACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGc < 1:302802/288‑1 (MQ=255) cGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATc < 1:40547/256‑1 (MQ=255) cGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATc > 2:40547/1‑256 (MQ=255) ccAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGcaacaa < 2:453407/288‑1 (MQ=255) aaCTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAAcagc < 1:1754912/288‑1 (MQ=255) cTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATtg < 2:277238/102‑1 (MQ=255) aaTGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTTTGGCTGGAAGTT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTCTTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCa < 2:256475/289‑1 (MQ=255) aaTTACCGCGAATGAACAGTAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGTT‑GTTTCATCG‑GTACTTTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCGTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGCGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTAt < 2:129619/289‑1 (MQ=255) aTTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc < 1:1971718/289‑1 (MQ=255) aTTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGGGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc < 1:1764349/289‑1 (MQ=255) aCCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTa > 1:771216/1‑288 (MQ=255) cAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTc > 2:369181/1‑222 (MQ=255) cAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTc < 1:369181/222‑1 (MQ=255) aaaTGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCAGTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTa < 2:1849961/289‑1 (MQ=255) aaTGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGACAACAATAACAACAGCCATCATCTACCTGTa > 1:804378/1‑288 (MQ=255) tGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAccc < 2:162599/289‑1 (MQ=255) tGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAccc < 2:865632/289‑1 (MQ=255) cAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTcc > 1:1939401/1‑288 (MQ=255) aaaTCGTTAGTCGGGGCGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTTTAGCCGCATT‑AGCGACCCTTTATGTGCTTGTGGTGTGGATGCACAAATATGCGATGGCTTTTGTTGGTATGTCAGAAGCTGAGCTATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCa < 2:1441469/288‑1 (MQ=255) aCCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCa < 1:1601338/286‑1 (MQ=255) gTCTGGCTGGAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAAct > 2:1571309/1‑229 (MQ=255) gctggAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTa < 1:190736/212‑1 (MQ=255) gctggAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGcc > 1:927565/1‑289 (MQ=255) gctggAAGGT‑GTTTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCG‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCGGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCCCCACTGTGGTGCAATTcc > 2:1584404/1‑289 (MQ=255) |||||| ATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTAGCGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGAGTTTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGT‑GTTAGTAGC‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCAGC‑ACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGAGTGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCAGCTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCC > CP042583/1454841‑1455386 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |