Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,457,586 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,457,586 | 0 | A | T | 99.4% | 377.3 / NA | 161 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 1,457,587 | 0 | G | C | 100.0% | 378.5 / NA | 161 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (85/76); total (85/76) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,457,588 | 0 | C | G | 100.0% | 381.6 / NA | 161 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (85/76); total (85/76) |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
CTTTTGGTGCGGTAAAAAAAGCGTCTGCGCCAGGGCAAATCAGCGTAAATGATTTGCGCACGGTATTAACTATTTTACACCAGGCATAAGCAATAATATTTCGGCGGGAACACCCTCCCCGCCGAACTAAAAAATATATTCAATCGTATTTAATAAAAATATTTCGTGAGTCTCTGTGCGCTAATTCTCCATTTGGCGTAGGGAAAATCACATCTGAATCAGGAATTAACAATGAAACCTGTAAAACCACCTCGTATTAATGGACGAGTGCCGGTCCTGAGCGCACAGGAAGCGGTGAATTATATTCCCGACGAAGCAACACTTTGTGTGTTAGGCGCTGGCGGCGGTATTCTGGAAGCCACCACGTTAATTACTGCTCTTGCTGATAAATATAAACAGACTCAAACACCACGTAATTTAAGCATTATTAGTCCAACAGGGCTTGGCGATCGCGCCGACCGTGGTATTAGTCCTCTGGCGCAAGAAGGTCTGGTGAAATGGGCATTATGTGGTCACTGGGGACAAAGCCCGCGTATTTCTGAACTCGCAGAACAAAA > CP042583/1457307‑1457863 ||| ttGGTGCGGTAAAAAAAGCGTCTGCGCCAGGGCAAATCTCGGTAAATGATTTGCGCACGGTATTAACTATTTTACACCAGGCATAAGCAATAATATTTCGGCGGGAACACCCTCCCCGCCGAACTAAAAAATATATTCAATCGTATTTAATAAAAATATTTCGTGAGTCTCTGTGCGCTAATTCTCCATTTGGCGTAGGGAAAATCACATCTGAATCAGGAATTAACAATGAAACCTGTAAAACCACCTCGTATTAATGGACGAGTGCCGGTCCTGTCGGCACAGGAAg < 2:1862748/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |