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Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
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gCGGATTTTTTT‑CGACCCCATGGTGCGGCGCACGATAGCCGGGCGATTCGCCGCCAGTGTCGGTTTATGCACGTAAAACTCATCCGGGTTAACCGCACCCTGCACGGCCATCTCACCAAGGCCCCATGCGGAAGTGATAAACACCACCTGGTCAAAGCCGGATTCGGTATCAATGGAGAACATCACGCCAGATGATGCGAGGTCAGAGCGCACCATCCGTTGAACACCGGCGGAGAGCGCCACACCACGGTGATCGTAACCCTGGTGCACACGATAAGAGATGGCGCGa < 1:295935/289‑1 (MQ=255) gCGGATTTTTTT‑CGACCCCATGGTGCGGCGCACGATAGCCGGGCGATTCGCCGCCAGTGTCGGTTTATGCACGTAAAACTCATCCGGGTTAACCGCACCCTGCACGACCATCTCACCAAGGCCCCATGCGGAAGTGATAAACACCACCTGGTCAAAGCCGGATTCGGTATCAATGGAGAACATCACGCCAGATGATGCGAGGTCAGAGCGCACCATCCGTTGAACACCGGCGGAGAGCGCCACACCACGGTGATCGTAACCCTGGTGCACACGATAAGAGATGGCGCGa > 1:1682736/1‑289 (MQ=255) cGGTTTTTTTT‑CGCCCCGAGGGTGGGGCGCACGATAGCCGGGCGATTCGCCGCCAGTGTCGGTTTATGCACGTAAAACTCATCCGGGTTAACCGCACCCTGCACGACCATCTCACCAAGGCCCCATGCGGAAGTGATAAACACCACCTGGTCAAAGCCGGATTCGGTATCAATGGAGAACATCACGCCAGAGGATGCGAGGTCAGAGCGCACCATCCGTTGAACACCGGCGGAGAGCGCCACACCACGGTGATCGTAACCCTGGTGCACACGATAAGAGATGGCGCGa < 2:1161977/288‑1 (MQ=255) ||| ACTATGCAGCGTATAACGCTCCATGACCTGACCGCGACTGCGCACGGTTTCCGGACGCGCCTGCACAATGAACAGTTTACCGGTGTGGCCATCTTTCGCCCACTCAATATCCATCGGGCGACCGTAGTGTTTCTCAATTTGTACGGCCTGTTTTGCCAGTTCCTGCACTTCTTCGTTGGTCAGGCTGAAGATGTCACGCTGTTCCTGCGGTACGTCTTCGATTTTAACCTGCTTGCCGTGCTCCTGGGTCGGCGCGTAAACCATGCGGATTTTTTT‑GCTCCCCATGGTGCGGCGCACGATAGCCGGGCGATTCGCCGCCAGTGTCGGTTTATGCACGTAAAACTCATCCGGGTTAACCGCACCCTGCACGACCATCTCACCAAGGCCCCATGCGGAAGTGATAAACACCACCTGGTCAAAGCCGGATTCGGTATCAATGGAGAACATCACGCCAGAACTTGCGAGGTCAGAGCGCACCATCCGTTGAACACCGGCGGAGAGCGCCACACCACGGTGATCGTAACCCTGGTGCACACGATAAGAGATGGCGCGA > CP042583/1468002‑1468554 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |