Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,473,570 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,473,570 | 0 | G | C | 99.6% | 585.4 / NA | 248 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (115/132); minor base T (0/1); total (115/133) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,473,571 | 0 | C | G | 100.0% | 578.4 / NA | 248 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (115/133); total (115/133) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,473,572 | 0 | T | A | 99.2% | 583.0 / NA | 248 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (113/132); minor base C (2/0); total (115/133) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.16e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
GGGAACGGCAGGCCACAGGCATCCCTGGAGAGCATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGGCTTAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCAACTTTTTAGTAATTCCAACTGCTCACTAAATAATTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTGCGCTATAACCCGACTCGTCGGGATACGA > CP042583/1473291‑1473849 ||| gggAACGGCAGGCCACAGGCATCCCTGGAGAGCATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGAt > 1:1268122/1‑289 (MQ=255) aCGGCAGGCCACAGGCATCCCTGGAGAGCATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATaaaa > 2:261695/1‑289 (MQ=255) ggCAGGCCACAAGCATACCTGGAGAGAATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGa < 2:1546010/289‑1 (MQ=255) gCCACAGGCATCCCTGGAGAGCATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACcgcg > 1:687122/1‑289 (MQ=255) gCATCCCTGGAGAGCATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCt > 1:773626/1‑289 (MQ=255) agagCATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGAtt < 1:1496706/275‑1 (MQ=255) cATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTgag > 1:1069779/1‑289 (MQ=255) cATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTgag > 1:422684/1‑289 (MQ=255) cATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTgag > 1:1552477/1‑289 (MQ=255) cATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTgag > 2:435165/1‑289 (MQ=255) aTGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTgaga > 1:1759480/1‑289 (MQ=255) gggTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATtct < 2:852178/288‑1 (MQ=255) gggTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAAGGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATtct < 2:1827370/288‑1 (MQ=255) tgCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTTTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAAc > 2:500789/1‑289 (MQ=255) ccAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCATTAATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAg > 2:365517/1‑289 (MQ=255) tCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATaa > 2:875460/1‑289 (MQ=255) tCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATaa > 2:1949953/1‑289 (MQ=255) gctgaactATCAATGAATCCCGAAATGGTGAAATTGCAGCAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGGACGAATAAACAGTTTGATGGAGCTGTGCGTGATTTGTTTCTGAATAAAACTTTTATCCAGCAGGAAGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATaa < 2:1982150/282‑1 (MQ=255) gCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACg < 1:1354602/289‑1 (MQ=255) cttATCAACGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCTACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGAACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTTTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGa < 2:1420862/287‑1 (MQ=255) cGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGa < 1:261695/289‑1 (MQ=255) cGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGa < 1:875460/289‑1 (MQ=255) cGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGa < 1:843894/289‑1 (MQ=255) cGTATCAAGTCACCCCGCAAGGAAGCAATTGGAACAAGAGGAAAATTGCGGCTGGATCGAACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGa < 2:1204/289‑1 (MQ=255) tCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGt > 1:1916258/1‑289 (MQ=255) tCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGt > 1:927626/1‑289 (MQ=255) cGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCg < 2:614553/289‑1 (MQ=255) aaTGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTC‑AAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCt < 1:89974/288‑1 (MQ=255) atgatgCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTg < 1:1679113/289‑1 (MQ=255) atgatgCAATTGCAACAAGGGGAAATTGGGGCCTGGATCGAACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGGGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTg < 2:687122/289‑1 (MQ=255) tgatgCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGc < 1:1296636/289‑1 (MQ=255) tgCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGc < 1:163136/282‑1 (MQ=255) gCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTaa < 2:1313222/289‑1 (MQ=255) aaTTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAAt < 1:1323199/288‑1 (MQ=255) ttGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCTATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTa > 1:1137346/1‑288 (MQ=255) gCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATcc < 1:583201/289‑1 (MQ=255) gCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATcc < 1:1219331/289‑1 (MQ=255) gCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGAACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATcc < 2:588607/289‑1 (MQ=255) aacaaGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATccc < 2:927626/288‑1 (MQ=255) aacaaGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATccc < 1:148228/288‑1 (MQ=255) aacaaGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATccc > 1:39109/1‑288 (MQ=255) aaacaGGTGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGCGCGGTGCGTGAGTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCACGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATccc < 2:1694584/284‑1 (MQ=255) acaaGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATccc > 1:498892/1‑287 (MQ=255) acaaGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATccc > 1:1999315/1‑287 (MQ=255) acaaGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCct > 2:1959628/1‑288 (MQ=255) aGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCctctct < 2:1230040/289‑1 (MQ=255) gAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCtaat < 1:1168882/288‑1 (MQ=255) aaaTTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCGTTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCtaata < 2:238201/288‑1 (MQ=255) cTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGc < 1:1539400/288‑1 (MQ=255) tCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTtg < 1:548392/289‑1 (MQ=255) cACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACg < 1:628294/228‑1 (MQ=255) cACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATccc > 2:743499/1‑261 (MQ=255) cACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATccc < 1:743499/261‑1 (MQ=255) cACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATcc > 2:1159150/1‑260 (MQ=255) cGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCg < 2:1515284/289‑1 (MQ=255) gAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGt < 1:120817/289‑1 (MQ=255) aaTAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATAAACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGACTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTCATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTTTCTAATAATAATGTAGCCACTTATCGCGtt > 2:1580010/1‑289 (MQ=255) ttCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTa < 1:1588855/265‑1 (MQ=255) ttCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAg > 1:407460/1‑288 (MQ=255) tCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGc < 1:1959628/288‑1 (MQ=255) aGCGGTGCGTTATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGAACATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGATCCCAAATTACCTAAAACAAGAGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTACAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAAAGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCaa < 1:1410778/288‑1 (MQ=255) aGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCaaa > 2:480188/1‑289 (MQ=255) aGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCaa < 2:1127960/288‑1 (MQ=255) aGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCaa < 1:1964938/288‑1 (MQ=255) cgtggCGTGTTTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGAATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAag < 2:1907840/284‑1 (MQ=255) cGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCa < 2:1032837/285‑1 (MQ=255) cGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCa > 1:1032837/1‑285 (MQ=255) tttGTTGCTAAATAAACCTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAAACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGtt < 2:1625797/288‑1 (MQ=255) gttgCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTAt > 2:1594393/1‑222 (MQ=255) ttttATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCa < 1:1008639/289‑1 (MQ=255) aTCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCatgat > 2:1019706/1‑285 (MQ=255) cATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATATTAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGt > 1:1117082/1‑289 (MQ=255) cATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGt > 2:1101696/1‑289 (MQ=255) cgcgGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGa > 2:70553/1‑164 (MQ=255) cgcgGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGtt < 2:457495/255‑1 (MQ=255) gggTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCaa < 1:449507/289‑1 (MQ=255) ggTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCaa < 1:223791/239‑1 (MQ=255) ggTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCaa < 1:1952403/288‑1 (MQ=255) gTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCa > 2:1725316/1‑237 (MQ=255) aaaaGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCCCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATAAACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGAATATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCt < 2:517393/289‑1 (MQ=255) cATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCaa < 1:1595426/228‑1 (MQ=255) cATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTctgaaaa > 2:215157/1‑283 (MQ=255) aTCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTctgaaaat > 2:786070/1‑282 (MQ=255) tCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTctgaaaata < 1:1101696/289‑9 (MQ=255) tCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTctgaaaata < 2:900592/289‑9 (MQ=255) acccGCGTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATAACCTAACACAAGTGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATATTAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGc < 2:1117082/287‑1 (MQ=255) cTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGCCAATg > 1:1509284/1‑289 (MQ=255) aTTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGCCAATGTTGct < 1:1613655/289‑1 (MQ=255) tGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCtaat < 2:1361859/157‑1 (MQ=255) tGCTCCAAAATTACCTAACACAATGGGATACACGTGCGATAAGGATCAAAGACCGCGATTATATTTTCATTCATCGAGATGCGGCTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATCGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCCAATCATAATGTAGCCACTTGTGGCGCTAAATTAAGCCCGGCAAACAGTTAACGCTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTTCTCTGAACATCATTCTCAATGTTGCTCATCGGAAAGTTg > 2:1758915/1‑288 (MQ=255) cTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTgc > 2:643749/1‑287 (MQ=255) aaaTTACCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTGCGCtata > 1:502497/1‑288 (MQ=255) aCCTAACACAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTCTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTGCGCTATAACCCg > 1:339296/1‑288 (MQ=255) acacAAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTGCGCTATAACCCGACtcg > 2:1981225/1‑288 (MQ=255) cacaAGGGGATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGGGATGCGGGTAATTCACATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCGAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAAGTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTGCGCTATAACCCGACtcgtc < 2:1612341/289‑1 (MQ=255) ggggATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTGCGCTATAACCCGACTCGTCGGGAt > 2:821859/1‑289 (MQ=255) ggggATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTGCGCTATAACCCGACTCGTCGGGAt > 1:852746/1‑289 (MQ=255) ggATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTGCGCTATAACCCGACTCGTCGGGAt < 2:421001/287‑1 (MQ=255) gATACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTGCGCTATAACCCGACTCGTCGGGATAc < 1:1698421/288‑1 (MQ=255) tACACTTGCGATAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGGGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCATGATTTTAGTAATTCCAACTGCTCTGAAAATAATTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTGCGCTATAACCCGACTCGTCGGGATACGa > 2:1443133/1‑288 (MQ=255) ||| GGGAACGGCAGGCCACAGGCATCCCTGGAGAGCATGGAAATCGAAGGGGGTAATCTGTGCCAATATTTCTGCCGTATCAATGCCTCCCGCAATGATGCAATTGCAACAAGGGGAAATTTGCGCCTGGATCGCACGAATAAACGGTTCGAAGGAGCGGTGCGTGATTTGTTGCTGAATAAAACTTTTATCCAGCATGACGCGGGTGAAAAGACCATCAAAAACCGCTTTCATTGTGCTATTGCCTGCTCCCAAATTACCTAACACAAGGGGATACACTTGGCTTAAGGATAAAAGACCGCGATTATCTTTTCCTTCATTGAGATGCGGGTAATTCTCATTAATCAACAGTTCAATAAACGGATATTTTAATAGTTCGCCTGCGTAATTATCCCTCTCTAATAATAATGTAGCCACTTGTGGCGTTAAATTAAGCCAGGCAAAGAGTTTATGTTGAATAAAAAAATGTTGGCAACTTTTTAGTAATTCCAACTGCTCACTAAATAATTGCCAATGTTGCTCCTCGGTAAGTTGCGCTATAACCCGACTCGTCGGGATACGA > CP042583/1473291‑1473849 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |