Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 491,826 | 0 | T | A | 99.1% | 260.2 / NA | 111 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 491,828 | 0 | G | C | 100.0% | 261.4 / NA | 111 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 491,829 | 0 | T | A | 99.1% | 259.5 / NA | 111 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base A (73/37); total (73/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.42e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |