Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,575,374 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,575,375 | 0 | C | G | 99.6% | 610.4 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (139/119); total (140/119) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,575,376 | 0 | T | A | 100.0% | 617.9 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (140/119); total (140/119) |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
AGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGTCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGATTCGCTCGCCGGAGTGGTTGGCACGCAGCTCTTCTGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGACTAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGTTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTGGGCGATGCTTTTACACTCCGGCTATGCCGATCATCCGTATAGCCGCTTTGATATTGTGGTCGCCGAGCCGATTTGCACTTTAACCACTTTCGGTAA > CP042583/1575095‑1575652 ||| aaTTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGTCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGATTCGCTCGCCGGAGTGGTTGGCACGCAGCTCTTCTGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGc > 2:1011313/1‑289 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |