Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,622,745 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,622,745 | 0 | A | T | 99.5% | 492.4 / NA | 209 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (108/100); minor base G (0/1); total (108/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.83e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,622,746 | 0 | C | G | 98.6% | 476.6 / NA | 209 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/0); new base G (105/101); total (108/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,622,747 | 0 | T | A | 98.6% | 482.8 / NA | 209 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (105/101); minor base G (3/0); total (108/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
TCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTACTGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTA > CP042583/1622467‑1623025 ||| tCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTGGGTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTCAGGCTAAtt > 2:1826274/1‑289 (MQ=255) ccATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCaaa > 1:305627/1‑289 (MQ=255) cATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGATACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCaaaa < 1:437542/289‑1 (MQ=255) cGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATATAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAG‑GGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATGGTGCTTCAAAATCCtt > 1:78010/1‑289 (MQ=255) 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gTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAg < 1:397888/289‑1 (MQ=255) cGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGtt < 2:1188241/288‑1 (MQ=255) ctcAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTGTAGCGGCGCGAGCCCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGGTCCTCAAACTCCATCAGGCTGGGCTCACGTTTGGCTCg > 2:607863/1‑288 (MQ=255) ccGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCg > 1:1127519/1‑288 (MQ=255) ccGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTCTGTGTTTATTTCATGTAAACGCTGCGCCCCACGTTGAATCTCAGGGTTAACGTTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTCTTCGAACTAGCCGTAAGGCCCGTGCAAATC‑GAAATAAGCTTTCTACTTGACCGGCTCGACCCCTATACCAACCTG‑CAGTTCCGTTCAGGCATATTATTCCTAAAAATCCTTCGCGTTTGCGTCAGGTTCGGcgtcaactagcc > 2:629622/1‑277 (MQ=255) cTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCAt > 2:1562110/1‑289 (MQ=255) cTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACAAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGGGAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGTAt > 1:857224/1‑289 (MQ=255) ccTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAg < 1:110104/288‑1 (MQ=255) tgGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCt < 2:1744062/262‑1 (MQ=255) 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gCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCAAGGTTGAATCTCAGGGCTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAACCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGAGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGTATCATTGTGCCTCAAAACCCTGCAGGTTGGCTTCAAGATTGCCTGGTGTTTGTGGCAGAAGTCCCACTacatttaaat > 2:1626908/1‑280 (MQ=255) aaaaaCGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCAt < 1:501716/287‑1 (MQ=255) aaaaaCGCAGGGTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCAGTGAAAGACGGCGCGCCAGTTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAGAATGACCGAGCGGAGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCACCGTGGGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATg < 2:1856092/288‑1 (MQ=255) cGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGc < 2:1248684/289‑1 (MQ=255) catgTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTTTTCTTATCTAATGTAAACGCTGCGAGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCaa < 2:1218314/286‑1 (MQ=255) cAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGGGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCaa < 2:1472777/289‑1 (MQ=255) 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aGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCaa < 1:832257/288‑1 (MQ=255) aGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTAGTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCaa < 1:455541/288‑1 (MQ=255) ggTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAAcc > 2:1185207/1‑289 (MQ=255) 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caccaacTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGATGCTCAGGGTTAACGTTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATGGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTGTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCGCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCt < 1:1631030/288‑1 (MQ=255) aaccaacTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCaa > 2:899746/1‑272 (MQ=255) accaacTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCgcgc > 2:1632209/1‑287 (MQ=255) accaacTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTa > 1:1878080/1‑289 (MQ=255) acTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATg < 1:1522086/259‑1 (MQ=255) tttCATGTCAACGCTGCGCGCCAGGTTAAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTCTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCa < 2:281347/289‑1 (MQ=255) 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aaCCTG‑CGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAAt < 1:1717635/289‑1 (MQ=255) cGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATCCTTTTCATCACTAGCGGTTTCACATCATCAAGCTGCGCAATCGTTACCTCGTTCGCTCCCGGCCATTTGCtt > 2:1803033/1‑289 (MQ=255) cGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTc > 2:259578/1‑275 (MQ=255) cGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTc < 1:259578/275‑1 (MQ=255) cGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCtt > 1:1361947/1‑289 (MQ=255) ||| TCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAC‑GAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTG‑CGTTTCGGTACTGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTA > CP042583/1622467‑1623025 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |