| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 1,634,158 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 1,634,159 | 0 | G | C | 99.5% | 448.6 / NA | 192 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (99/91); total (100/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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| * | CP042583 | 1,634,160 | 0 | T | A | 100.0% | 456.4 / NA | 192 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (100/92); total (100/92) | |||||||||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GGCGTTACTGGATAAAATTTATCAAGGGCTGAACCCCGGCGGCGCGCTGGTGCTTAGCGAAAAATTCAGTTTCGAAGATGCCAAAGTTGGTGAACTGTTGTTCAACATGCACCACGACTTTAAACGTGCCAACGGTTACAGCGAACTGGAGATCAGCCAGAAGCGCAGCATGCTGGAAAACGTGATGCTGACCGATTCCGTGGAAACCCATAAAGCACGCCTGCATAACGCCGGTTTTGAGCATAGTGAGCTGTGGTTCCAGTGCTTTAACTTTGGTAGTCTGGTGGCATTAAAAGCAGAGGACGCTGCATGATCGACTTTGGTAACTTTTATTCTCTGATTGCCAAAAATCATCTTAGTCACTGGCTCGAAACGCTGCCCGCGCAGATTGCTAACTGGCAGCGCGAGCAGCAGCACGGGTTGTTTAAGCAGTGGAGTAATGCGGTGGAGTTTCTACCTGAAATTAAACCGTATCGTCTTGATTTATTGCATAGCGTTACGGCAGAAAGCGAAGAGCCACTGAGCGCAGGGCAAATTAAACGCATTGAAAC > CP042583/1633881‑1634431 ||| aCTGGATAAAATTTATCAAGGGCTGAACCCCGGCGGCGCGCTGGTGCTTTCGGAAAAATTCAGTTTCGAAGATGCCAAAGTTGGTGAACTGTTGTTCAACATGCACCACGACTTTAAACGTGCCAACGGTTACAGCGAACTGGAGATCAGCCAGAAGCGCAGCATGCTGGAAAACGTGATGCTGACCGATTCCGTGGAAACCCATAAAGCACGCCTGCATAACGCCGGTTTTGAACATAGTGAGCTGTGGTTCCAGTGCTGTACCTTGGGTTGACTGGTGGCATTaaaa > 2:692143/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |