Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,644,439 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,644,439 | 0 | G | C | 99.6% | 586.7 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 1,644,440 | 0 | C | G | 100.0% | 595.4 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (128/124); total (128/124) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,644,441 | 0 | T | A | 100.0% | 602.0 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (128/124); total (128/124) |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
ATTAACCGCTCTTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGGCTCATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCGCTCGTTAACTCGTTTGCCGCTCCCGCAAATTGGCTAAGAACAAGAACGCCCGGATTGGCTGGGTCCTGAGCAGCAACATACTCTTTTGCTACCAGGTTCATCCCGTCACGCAGTGGCGTCACTAAGCCCACGTCAGAGTAGCGGAATATTTTCATCAGTAATTTACGGTCAAAATGCTGATTCAAATAATAAAGCGGCGTCCAGCCTAATTGCCCGTATTTACCATTAATTCGTCCAGCTTCATTTTCGAGCTGATGACGAATATCCTGATAGGCTTGCACATCACCACGGCTCGTTGGTGCAATCTGGGTA > CP042583/1644161‑1644718 ||| aTTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCCGACGTTAACTCGTTTGCCGCTCCCGCAAATTGCGAaagaacaa > 2:1660505/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |